Map Locations of contig_219789 (3065 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_219789

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_31521 4 2328 bp MLOC_31521.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_31521






Contig Sequence (3065 bp)

>contig_219789 3065 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGCAAAGCATGGAGCAGTTGTCACTCGCTTCTTTGAAATCCTATCTTGTCAACCACTACT
AACACACCATCTATATCTTATACTGAGTTGCAAACACACATTTTTTAACAATTTTCTACA
CACTGATTCCGGTACAAGCTGGTTATTCTGTTCGATATGTAGGTTACCAGTGCTTAAAGT
TAAGAAACAAGGCTTAGCTATTGATGGTTGCTAATATAAAAAAGGCATCCCTCGTTACTT
ATGGTGACTGAAACCCTCAACGTCCTTTACCCTACTACTGTTGCTCCCATCGATGACTTT
TACTAGGAGATATATATTTGCCTATGTCGACTTCCCCCAACACTACCCTGGTTATAAATA
AGCATGTACTATTTTGGTAAATGATACTTGTATGCTTTCATCATTAGTACCTGTTAAGTA
GTGTTGGAGCTTAATGGCATGCCTTTGTTGAATGTCTTTTCTTTCTGAAATGTTATACAT
TCTGTAAACTGAGATATTTTCTGTAAAAAATGTGCTGGTGCTAACGTTCTTTATTCTTGC
ACCGACACCATTAAAAGGTTGACATGGTATGGTGTGGGATATCAATGTACAGTACATATT
GTGTAATTATAGATTGATGTCGTAGTTGCATTAGTTTGAAGTGTTTCGAGAGTTTGTAGT
GAGACTAGAGCATAGGCTTGTTTTATTGTAGATCTATAGTAGAGTATAACAGTTCAGTTG
TGGACTATGTGTTATCTATATGCTTGTTGTATGTGATTTCACTCGAAGTTATTAGATCAT
ATGCTTGTTGTGTATCAATGATCCATGGAATATAGTAATTTATATGGTTCACACATAAAA
CTTGAAATAGAAAATCATTACAAATGTTTATCCTTTGCAAACACCTACCAATTTTTTTTG
CTAGGATAGAAAATAAAAGGGACATTGATAATCAGTAGTGCTTTCATGAAAAGTTCTACT
ATTCTAATTTTGTCAGAAAGGCTGACCCTATGCTTCCATAAAAATCCCATGGATAGTCAT
GGTGATATTATGCACTATAGCTATTACTGGGATAAATCTTACAAGGACATGCATTTCTTT
TCCTGATTTTATGCTTTTACTGGATTTGTACTAGACAAATCCAAAAATTTCTTCAGTTCC
TCCTGCAACTTCTCTATTAACATGTTAAATTATAAGTAATTGAAAACAAGTTACATGCAT
AATCTGATTTATAGATGTTTGTGTGATGCTTATATATGTACTGCCAATTCATGCGAGGTG
AACATCTTGTTCCCAAAAGGTGAAGACTTCAATCTATCCACCAATCAAGTCTTTGATCTT
TCCATCGAGTGAGTCTTTGATTTGTTCAACTCCTATACTATATGATTCTTAGGCCATGGT
GTTTTGGGATGCTATTATTCATGGCTGCTGGTATTGTAGTTGTGGACTTGTGGTTAACTA
TTGTGTATATGTTCATATGATGTTTCTATGGATTTGGATTTTTGTGATATATGGTGGTAT
TATGTACATGATATAGGTCGTTTAATCTTCAGTTATTTCTTTTGCTCTATGTTTATTAAT
GCCTTTGGTACATTTACTTTGTTAGTGACCACCAAATTCTCGTTTTGACATCGTGTGTTG
TGTTTCATGTGTTTGCCACTTTGTTTAGTACGTACCCTGCATCTTTGTTTTAGACTTTAG
TCTCATCAGATGTTCAATTTTCATTCCTGCATGCTATCCATGTCATCTTCGTATTGATGC
CACATGCTATCCCTGTCACCTTCGTATTAATGCCACATGATGTGCAATATTCGTGGCACA
TTGCATAGACGCCATGTTAAATGTTTATGTTCATACCAGTGTGCTTGCACAAAGTGTGGT
TTATTTGGGAATAATCTTGGCAAAGTGTGTATTTATTTGGATTCTTACAAATGATTTACA
TGTTTTTATTTGATATATTAAAACAGAGGCACTTCATGCTCTGCCTTACATGTTTTTATT
TTATGTATTAAAACGGAGCACATGATGGTATGTTGTTCAATCTTAAGACAAATGGTAGTA
TATGTGTTTCCACTTGCTAGTTATTACTTGTATTTTGTTGTTGCAGTTCTGAAGATAAAA
GCCTTGGTGTAGAACACAACAAGTCCTAGGTTAATCATAAGCAGCTCGCGCATGAAATTT
CAGTTAGGATCAAGTTATTCTAATTCGTACGTGGGGTAGGTGACATGTGGTGGTTTGATC
GTGTTGTGATCAGCATGTATTGCATGTATCATTTGTAATCTAATGTTACATGTTCTAATG
TTATGTGATGGTTGTAGGTGAATGAAATGCTGGAGCAATCAATTACTCTCATTTTTATGT
TGTTACATTTTGCTCACAGTTAAAAGAAAAGAGGCAAGAGATTGCCTAGACGAGCGTACT
ATTTGTAGAAAACCTAAAAAAGGAAGAAAATGTCAATGGTCCAATAACAACTATGCTTAA
TTTGTTGTAAAAGGGCTAGATTCGAAATGCCGCATGCCAGAAATAATGGGCTGATATGAA
GGGATCGGCCCACTAAAAATGTCAGATGCCACGTCAAAGCCTATGTGGCTCTCATGTCAA
TGGTTGTGCCATGCCATACCATTTGCCACATGGCGTGCCATGTCAGCTCAGCCACGTTGG
ATCCTACCTGGTTTCAGTATATGTGTAATGACTAAAATTTTGGTCAAAGGTCTGTTTGGT
CCCTAGCAATGCCACGTCAGCTTGGCCACGTCAGATCCTACGTGGCTCACACAAATTGGT
AATGACCAAACCAAAATTTTGGTCGATAGAGACTATTGACATTGTAAATTTGGTCAAAAA
AAGTTAAGAAACGACAACAAGACGAATCAATGACCAATATAGAGAGTCATAATTGACCTT
ATTTCTTGTAGTGAAGTGATTTTCCGCCTGCCTCCTGTCGGCAAAGATTTTGCGTCAGCT
TACGACGACATTGTAGCTTCTTTGCCGACAGCCTTCCCTAAAGCTCTTTGCCGTCAGTAT
CTGGCACCGAGCAGTCGGCAAAGAACTTGAGACGGCAAACGACAGGCGATGCCTCCGTTA
GGGCT