Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_218317 (1845 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_218317

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_31375 1 140 bp MLOC_31375.1 Available Available LOC_Os08g32980.2, FRAME:+3, EVALUE:9e-16, 13108.m03429 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_31375






Contig Sequence (1845 bp)

>contig_218317 1845 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTGGACCAAGCAGGGCAGCGGCCTCTGCGCCATCCTCATCATCTCGGTGAGCCTGCCCC
TGCCCGCCCTCTGCTTTCGCTCCCCGATCCATCCCAGACCCAGACACTGTTTAGCACCGT
GGCAAATGGTGCACTGGATGTGCTTGAAATGTTGGAGTATAATCTAGGGGAAAACGTGTG
AAGAATTGAGGAGTGTTGGATGCTGGATTGGCGATTGGATTAGTTGTGATGTGAATTTCG
TCTATCTGTGCTCATTACCGCCAATTTGTACATGATCATTCTTGGAAATACGTTTTACAT
GTATGTGTAAGAGTTAAAAGGATGTGCTGATTGTAAGGAAACCACAGTAGATTTATATTT
GCCTAATATGGTGCTCAGGTCCATCGATGTTGGATGTAGGAATCATTTTAGGTATGTCAT
ATACCGTTTGATTATCTGCCTTATACTGGCTTAAGCTCATCAATGTTAGATCATCATTTA
CGGTTAGAGTAGAATATTATACCCGCACAGATAATTAATCACCTTCTCATCCGTTGCAGG
TCGGAACAATCACGCTGATATCACTGACTGGCGTGCTGATTTTCATGTCCTTCCTGTTGG
TTGCGACTGCTAATGCCATTGTCGATTCAGTTCTTATGTCCTTGGCAGCTGCTGGAGGAT
TCCTAGCCTTGTTCTTTGCTTGCTTGGTTGTAGTATATGTCGGAGGAGTATCAATTGCTA
CATTCGTCGTTTCCACCATAGTTATCTCTGCAATTTTTGCAGCCATGATTGCTACCGGTA
CCCCATCTATCCGTCGCTTTGTTTAATAGTCATAGAAGATTGGTACATGTTAGCTACATG
TTCTAACTAAAACATTGTTAATTTCTGCCTTTACACTTTTCCAAGGAAAGAGGAAAAACT
ATCAACCTCTGCATACCGTGTAGGTGTTTTTACAGAGCTGTTGCAACAGTTGCAGTTGAA
GGGTCTCCATGTAAGTAATCACCTACCATATGTTCACTTTTCTTTGTAAGTCAGCTCGGC
CCTAAGGGGAACTAATCACTCGACGCATTAGTACAAGGGTAAGAACATTTTTCCATTCAG
CGCTCCCATACGATAAAAAAATAACTTGCTATTTTGACCAAGTAGGAAAATGAAGCGTGC
TTTTCTATTTCATTACCTGGTTGACTTATAGGATTCTCGATTCACCCAGGCTTACAAATA
CTAAAACCATGTCATTGAAGCACAACGATGCTTTCTTTTAAAAATGTTGCACAACAATCT
GGTTTAAATTTTCGGAGCTAATAATCTGTTTCTCGTTTCTACATGTGCTTTTTTCTATGA
AACGTGGGAATCTTTATACCTCCTTAAAAACCGTTATTTATAATATTTTTTGTTATTCTT
CCTTAACAGGTTGATGAACTCTACTCACTTGATCTTGATGCCCTAAAAGATCTTCAGTAT
GCTACCCTGCTGCCAATTACCATGAATGTCGTTTTCCTGAATCAACTGTATCAAACAATT
TGGTGTTTTGCAGGCCAATTGATGGGATTATATTATTGTACAAATGGTGACCTCCAGAAA
AAGATGAGCGCCCTGTTATCAAGGATGTGGTCCCAAATGTATTCTTTGCTAATCAGGTCA
GGGTAGTTACGTTGATTAAGTTTTTTTTGCCGCCTTTACTCTGCATCACATCTTTAACCA
AATCTTTTTTTACTGGTAGATAATTAACAGCGCATGTGCAACCCAAGCTATTGTTTCTGT
TCTGTTGAACTCTTCTGGCATCACCCTTAGCGAGGACCTCAAAAAGCTCAAGGAGTTTGC
AAAGGACATGAAGATCAGTTTTATCGCGATGATGCTCATCGTGAC