Map Locations of contig_207544 (9280 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_207544

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_30232 4 5719 bp MLOC_30232.3 Available Available LOC_Os03g02970.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13103.m00273 protein Dicer, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_30232






Contig Sequence (9280 bp)

>contig_207544 9280 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGAAATTGCAGCAAGCTGAGGTGATACGCGAGAGGACTGGCTATCGGGTTGGGCACTACT
GCGGAGAGATGGGTCAGGATTTCTGGGATGCTAGGAAGTGGCAGCGAGAGTTTGATTCCA
AACAGGTCATTCTTCTCACTTCCACCCCCTTCCATACCGTTCTTATTGCTGTGTATAATG
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ACCAGCAGTAGCTAGCCAGCAGCAATCAATACTTAAGCAGCAGCAGCCAGCCAGCAAGCA
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GGGTTAGTAGTTGGGCTTTACCGGGCTACACCATTCCCATGTCCCCGACGTATCAACGGC
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TGTGTATCACGTATCACACGTTTATATGCGGATACAGCAGATTTTGAAGTATTGGTGCTT
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CGGCAATTGCATTGATTATGTATCACATATATAATGTTCATATTTTTTGGCAAGACTACA
TGCTGGTCGTATTTCTTGCCTGATTTGAACTGCCTTTGGAATAGGCTATGTTTCTAATCA
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ACAGGAGTCACTAGCCAAGAAGATTGTGCCATCAAGATAAGAAATCTTGAGAGTAAACTG
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TCTGAAGTTGTTGTCCAATATGACAAAGCAGCCACCCTTTGTTCCCTGCACGAGCAGATC
AAACAAATGGAAGCTGCTGTTGAAGAAGCTGCACTCTGTAGCTCTAAGAGAACAAAGTGG
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TCTGAGCGTACAGAAAGTGATGGTGCAGCTAATTTAATCCAGAAGTTGAGAGCTATAAAT
TATGCTTTAGGTGAACTAGGACAATGGTGTGCTTATAAGGTATTTGTTTGATGTTCAACG
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TGATCTACCACATTCATAGTTGATATAGCGAGTTAGTGACCGAGATTTGGCTTCTGATTA
TCCTATTTTAAGGCTGGTTCCTTACCTGACATGCTCCCTTGATATCATTTATGACGTGTC
CCATCAGTTGCATGAATATCACTTGTTTTTTCGTGCAGGCTGTTTGTTTGGCTGCCTGTA
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AGTTTTATCCTGAAGGTGTTGCTGAAATTCTGAGAGTAAGTTATTTACTTCCTCGCTCAT
TATCTGTGCATACAAACAGGTACTGATCTGGACAGTGCATTTGCACTCTCCAGCACCTGA
GATTATCCTCCAATCTCGTTCTGATGGACCTTTTTTCTGTGACAGGGAGAATGGATTTTA
TGTGGAAGAGATGGCTGCCAAAGCACTCAATTTATTAAGTTGTATATGTATTCTGTCAAT
TGTGTGGATGTAGGGACATCTAAGGACCCTTCCCTTGCACAAATATCGAATTTTTCTATT
ATTTTTGGCAGTGAGCTGGATGCAGAGGTATGTTCCATCATCTGGAATATCCTGAAACTT
GAATATAATGTTGTGGGTTCACCATTTTTTCTTTCTGATTTTCAGGTTCTGTCGACACCA
ATGGATCTCTTTGTTGCCAGGACGATGATAACAAAAGCATCTCTTGTATTCCGTGGACCA
ATTGAAGTTACAGAAAGTCAGGTTGATCTGCTTGACAAATTCCAAGTAAATATTCATTCT
AAGCATTTTGCGCTGGTGTAGCTAATACCGTACTTTTGTGATTGCAGCTGGTTCTGCTGA
AGAGCTTTCATGTTAGGCTCATGAGCATAGTCCTTGATGTTGATGTTGATCCCTCAACTA
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GTGCTTTAAGAGAGATCGATTGGACTTTAATCAACAACATTGTGAACACTGATGCCTGGA
ACAACCCACTTCAGAAGGCACGACCAGATGTCTATCTAGGCACCAATGAGAGGACACTCG
GTGGAGATAAGAGAGAGTATGGGTTTGGAAAATTGCGTAATGGAACCGCTTTTGGACAGA
AGGCACATCCAACTTATGGTATTAGAGGAGCCATTGCTGACTTTGATATTGTTAAAGCAT
CTGGCTTAGTTCCTTCTCGTGATAGAGGGTATTCAAGTGACTATCAGAACCAAGGCAAGT
TGTTCATGGCAGATTCATGCTGGGATGCTAAAGATCTTTCTGGAATGGTTGTCACTGCTG
CCCACTCAGGAAAGCGGTTCTATGTGGACTGTATTTGTTATAACATGAATGCAGAAAATT
CATTTCCTAGGAAGGAAGGCTATCTGGGGCCTTTGGAATATAGCTCATATGCTGATTACT
ACAAGCAAAAGTAGGACAAAGTTTTCTTAAATGCTGAATCCTGCCTTACTTTAGTCTCTC
TAAGCAATTTTATGATGGTAAATTGTGACTCATTGTGCTGTTTGATCTCAGATATGGTGT
GGAGCTAGTGTATAAGAAACAACCTCTTATACGTGCACGTGGTGTTTCCTATTGCAAGAA
TCTTCTGTCTCCTAGATTTGAGCATTCTGAAGGTATCTCGAGTCCCATCCTGAACACACC
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TTTATGTCGAAATTTGTGCTACTATTTTTGTTGACCCAGATGTGAGTATTGTGGTCATGC
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ACAAAACATATTATGTCTATTTACCACCCGAACTTTGCCTTGTGCACCCACTTCCTGGAT
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CCATCTTTGGTGGGGAGTCAATACCTGGTAATGAATTACAGAAGGATTATGACGATGACT
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TCTCAAGCAAGACATTAGCAGATGTTGTTGAAGCACTTATTGGGGTCTATTATGTAGCAG
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CTCAAGAGATCCCTCCCCCAAAGCCATATAATATACCTGAGAGCATATTGAAAGGCATTG
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AGGCTATAACGCATGCATCCAGGCCATCTTCTGGTGTTTCCTGTTACCAGCGGTTGGAAT
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TGAAGTTCTAGGTTTAATATATTTCAAGCAATGCTGACTATTTTCTTTCAATCTTCTGAA
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TGGACTTGGGGATTGCAAGGCTCCTAAAGTTCTTGGAGACATTATTGAGTCTATAGCTGG
GGCAGTATTCCTGGATAGTGGGTATGACACCTCGGCAGTCTGGAAGGTATTTCTTTATAT
TCTGGAGAAACTTTCTTAATAGAAAAGCAACCTAATCTGGAGGAAGTCTGAAACAAACTG
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TCCGATGCATCCAATTAGGGAGCTCCAAGAACGGTGCCAGCAACAAGCAGAAGGGTTAGA
ATACAAAGCATCCCGGGCAGGCAATGTAGCTACTGTGGAAGTCTTTGTTGATGGTGTTCA
GATTGGTGTAGCTCAGAATCCCCAGAAGAAGATGGCACAGAAATTGGCGGCGAGGAACGC
ACTCGTGGTCCTGAAGGAGAAGGAAACTGCAGCAAAGAAAGAGACAGAAAAGGATGGTGA
TAAGAGCAATGCTGGGTTCACCAGGCAGACCCTGAACGACACTTGCTTGAGAAGGCAGTG
GCCAATGCCGCAGTACAGGTGCATAAACGAGGGCGGCCCTGCTCATGCTAAAAGATTTGT
GTACGCGGTTAGGGTGAATACGTCGGATCGTGGATGGACCGACGAGTGCGTCGGAGAGCC
GATGCCGAGCGTGAAGAAGGCCAAGGACTCTGCCGCCATGCTTCTCCTTGAGCTTCTGAA
TCGAAGTTTCCCTGATAAGCCTGGCGGTAAGAAGTGATAGCTATTGACGTTGTTGGTGAT
CATTGCGGTGGCATCGGCGTCGAGACATTCGGCATTTTTACACAGCATAGATTCATTACC
CATTCAGTGCTCTTCAGCTCTGGCAAATAAGATAGATAGACAGGCAGAGCTGATGAGTGA
GAGCAGAGGATAACTCTTACCAACCTAGTTGAGGCCGCTGGATGTCATTAGAGATTTATT
TACTGTGAGGCAGGATAAATAGGAGTTGGCAATAGCAGAAAGAAATGGTAGTCTGATATA
GGATAGATCTGAGTGGAGGCCTCTTAATTGTATTGTATTTTGTTGTAACTTGCAAACATG
CATTAGATGATTGATCCAAGAGAAATCTGTGGAATTTTACCCTTACCCTTTATGGATTAT
TCGGTGCATTCATTTTCATATTGCTAGACAACTGCTGGTAGTAGCAATAGAAATTAATTA
AAGACCAATGCCCGCCACTAGATTTCAATTTTTCACTTGAAAGAGGGACACTAACATATC
TTGAAAACCTGATAATATGGGGCAACGTCCACGTACGATTCGTAGAGATAAAAGGGCTGC
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CCTGCGTCATGACGAGGTCGATGTCGCGGGCCTCGATGCCGGTCTCGTCCACCACCTCCT
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