Map Locations of contig_204688 (5022 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_204688

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_29895 2 818 bp None Available Available None
MLOC_29896 2 1106 bp MLOC_29896.2 Available Available None





CDS Structure of MLOC_29895






CDS Structure of MLOC_29896






Contig Sequence (5022 bp)

>contig_204688 5022 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCCCAAGATTCTGGCGACATCAGCCGACAGGAGCACGTCGGAAGGCCGCCACGCGCACG
AGGCCTCCCACTTTCATCTTCCAGTTCACCACCGCGAAGTGAAATCCCAATCTCCAATCG
CCACAGCGAACAGCAGCCGCCAGATCCTTCCCCCCAGCTCCGATGGCCTGCACGAAGCAG
ACGGCCCGCAAGTCCACCGATGGCAAGGCGCCGAGGAAGCAGCTGGCGACCAAGGCGGCG
CGCAAGTCCGCCCCGGCCACCGACGGCGTGAAGAAGCTCCACCGCTTCCGCTCTGGAACC
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CCCTTCCAGCGCCTCGTCCGGGAGATCGCGCANNNCTTCAAGACCGACCTCCGCTTCCAG
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ATGATCTGTCGCTATGTGTCGTGGTGCTTGAATGAAATGACAATGGAAAAGTTCAGTTAT
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TGGAGAGCGTTTGTCCCTATCTATAGTATGTCATCCTGCAGAGTTAATGTTGCTCCACCT
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GCAAACTGTTCTAATAATTATCCTGTGGATGTACCAATAGAATGTTCGTTCCAAATAAAG
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CTATTTTTTAACCGAAAATTACTTATGGGAAAGTGACAAATGCAAATACTCCCTCCAATT
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ATAGACATATTTTAGAATATAGATTTATTCATTTTGCTTCGTATGTAGTCCCTAAATGAA
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CAACATTTAGTGAGTATCCATAGAACCAACAAGAAGTTGAAGTTCCATGTATAGTGAGAC
AAGCTTTGCCATAACCTCACTCACCTGGATATCCATTCTTCGAGAATATGCTATTAGTCC
GTACTATCATGCAGATCAAACTAAGTCCTATGGAGTTGAGTGTCTTGAGTGGTAGTTCTC
CTTAAAAATCCAAGCCCAAGTTTATTTTAATACTTTTCGTTTCTTTCACCCTGGATTTTT
CTTTAGAAATGAAAACATGCTTACCATCAATATTTCTCTAGCAATATTCAGAATGGTAAC
TAGAATTAAATGATATTCAACTAATGTGGCGAATGAAATTTAAGTGCAACGAGTCAAATA
AAAGCATTAGCAATGTTCAGGAAATCGGTAATTGGTAGTAGCTCGGTTAGTCTGGGAGTA
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CATTTAAACATTTAATCTTGTCCGGATACTTGCGAACATATAGCCACAAACTATGCTACA
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CTAATCAATGAATGGTCAATTCCCCAATGAGAAAGGGGAAGAAGATACCGACGCCATTGC
GGAAGGGGTTGGGGAGTAGCCGTCATCACCAGTCAACGGGTCAAGTGATGGCGAGCAGCC
CTCGACAAAGGATGGGGAGTAGCCGGCTGATACGTCTCCAACGTATTTACTTTTCCAAAT
ACTTTTGCTCTAATTTTGGCCTCTANNNNNNNNGATTTGAATGGAACTAATCCGGACTGG
CGCTGTTTTCAGCAGAACTACCTTGTGTCGAATCAATAAATTAGGGTGAAATACTACCAC
TAGTAGGAGAAATGCTAGCAGTAGCGCTGGTTTTTCCATTACCAGTAGCGCTACTGCAAT
CGCGCTACAACTAATCTATTAGCAGTAGCACTAAAAATAAAAACGCTACTGTTATACACA
TTAGCAGCAGCGCTGGAATAAATAAAGCGCTACTGCTAATATTCCAGCACTACTGCTAAT
ATTCTTGCTTTCGATATTTAATTCGCGTCGTATTTATGTCCCCCTACGTATTTGTGCATC
CTCTATACAGTGGTTTCATCATATCATAATAAACATGCATAA