Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_200835 (3296 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_200835

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_29465 2 272 bp MLOC_29465.2 Available Available None
MLOC_29466 1 416 bp AK355158 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_29465






CDS Structure of MLOC_29466






Contig Sequence (3296 bp)

>contig_200835 3296 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGGCTTGGTGGGATGGATTCCAAATTATGCGGGACGGGCAGGCTATCACTTGGACTGTC
TTCAAGGAAGGATTCTGCGCCGCTCACATTCCCCCTAGAATGATGACCATTAAGAAGCAG
GAATTCTGAATTATGAGGCAAGGCAACGGAACAGTCATGGAGTACGTGCAGAAGTTTAAC
CTTTTGTCAAGATATGCACCAGAAGACGTCAACACTGAAGCCGCAAAGGTGGAACGCTTC
ATGGAAGGACTTTAGCAATCACTTCAGTGACAACTTGTTGTATGTTAATGCCGGTCCTTC
TGCGATCTGGCGAACAAGGCCCTGATGCTGGAGGACAAGCGTCGTGCGATGGATGACACC
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GGGGTCAAGCCCAACATTCCAGGAAAGGTTACCTGCTTTGGATGTGGACAGACTGGACAC
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TCTTTTGTCACCCAAAAGTTCGCTGCAAAGTGTGGTTTGAGGACTACCCTCCTTAATGGG
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TTTGGTCAAGGATCCTATGACCGAAAACAATAGGTCATAGAATCTGTTGACCAAAAAATT
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TTATGAAATAAATTTATAACTTATTCAACATTTTTATTATGAAGAAAATACTATGTGCAA
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CTGTCATCATACATTTATTGTTAGCTGGGTCCTGCATACATGGACAACTTCATGAGTATG
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TAGACAGAAAATTAAGATCTAACAATTATTAAGGATTAACGTGGAGGATCATGACATAAA
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ATGCGCTTGCACGGGTTAGTTTTTATTTATTTTTAATAATATAATTATTAAATAGATACT
ATGTTAAAATTAAATAAATATTTTGGACATGGATGCTTGAATAACACTAGCTGAATTGCG
CTATAATACTGTGAAGAAACAGTGTCCAATCAGTCGATCATGAGGAATAAATATATAAGA
TGGTTTGTATCCTCCTCAAAGCCTTTCAATACATATTGTCACATGGCATGGTGGGTATAG
TTGCTGTTGTACAGAGGCAGTAAGCAGGACTGGCAGTAAGGAGATACTCCCTCCGTCCCG
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NNTTTTGGGACGGAGGGAGTATATCACTGGAAACGATCTGAACAGATATGTTACAGTAAC
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AATAAATTACTACCACACAATTTTTTATCTCTAATAACAATTACAAATGCTCGTATTTTT
TTGTAGTATACATGCTTGTGTGACATGCTTTACTGAACCTTGTTATGAAAGATCAA