Map Locations of contig_199596 (1606 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_199596

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_29330 3 1354 bp MLOC_29330.3 Available Available None
MLOC_29329 1 1440 bp AK354276 Available Available None





CDS Structure of MLOC_29330






CDS Structure of MLOC_29329






Contig Sequence (1606 bp)

>contig_199596 1606 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGTGGAGAATAAATGATTCTTAGCATTTTTATGTTCTAACACAAATATATAACGTAGGTC
TGATGCCGTGAAACTAATATTCGCCTAGCCAGCGCTTTCGGTCGATGGCAAAACGAACAC
ATAGCGAACCATGCTTGCCTTGAGATGGATTGAATCAGCTAACAACACACGCACACACAC
TCACATGTAACGTATTTGCTGTTTATAATTCTTCAACTCAGGGTGATACAGCCTAGGAGC
TGCATGTATCACCTGGCTAAGCAGAGTTAGGATTTCTAGGCATGCAATTGTTGGTGAACT
CTAGCAATCTTTGAGATCTATTAACAACCAAAAGAGAGAACTAGCAAGCTGGAGATTTGA
CCATCTAAATTCGTTGTGCTAATTTAAGTAGTTCTTAGCTATCATCTAACAAAACCATTA
CAATATTTATTGATATAGTCCATTGTTTGTTTTTCGATTTTTGGCAAATGGAGCAGGTTA
TGAAATCACATATTTCAATTAGTTTTTGGTCTGTCAGCTTGAGTAGTAATTCTTTATAGT
GTCCCAGTTGTTATTTCATATAGGGTACCTTGCTATGGTGCAAGGGACTATAAGATACTT
CATATAGGAGGTCGAGCCTAAAAAGGTACAATCATGTTAATCAATGTGTCATGATATTGT
TCCTGCTTCAAAATGCACGCTCGGGTGTTAGTTAACAGTCCTCTAAATATTGATTTTCTG
TTACAGAATTTGTCCATTTGTGCAGGCTTTCATTCATGATGGGCCAACCTTGAAGTCTTA
ACGATTACCCTTTCCAACATGCAACACTCGCGATGTGGTGCTTAATCCTGCTAATTTTTT
TGTCTATTAATTTTTATGTTTTTTTCACCTCAGATATTGTATTAATTTAGGTTGGGTTCT
AACTAGAGATGCACATAAATAACTTGGTTCTCGGTATCATAAAACAAACAAGGCACAAAC
CTAGAAGGTTATTGATTATATGTTGTAACCCATTTAATTAAGCTGGTTTTCTTGACACCA
TTTTCTATTGTAGGCTGTTGAATATATACAGTTTTTGCAAGAGAACGAACAGAAGTGTGG
TTGGGTGAGGTCTGGATACAACATCTCACTTTTTGTTTGTTTCAACAATGCATTTTTCTT
TTACTTCCTGCTTTGATCAAATTGGAACTAGCCTTGTAGATCAGAATAATTGAAAATTGA
TGTGTAATATTAGGTCTGTGATTGCAGTGTGTAAAATTGGCCTATTTATTCGATTCTTGT
CATATAAAATGTGTATTTTTTACCCTAAATGTGTATTTTTTTTCTTAGATGCCCTTATGA
ATCAGGACCATCCACCATCGACCATTGACCGAGAAAAACCAAGAAGGCAAATGATTCATA
AGGGCATCGCTGCTATGAACATCGTCTAATCAGTTAGTGTAACCATCGACCGAGAGCTGA
GACTGGTGTTGAATTTTGATATGCGATGACATCTNNNNGGATGATGATACCTTTTCGTGT
TTGATCTTTTCTTTACATACTACAACCACTGTAGCACTCAGCACCTTTTCAAGATTCTGA
AGGATAGTTCTGTTTCTTTTCTTGCCTATTTGATCTGTGTTTTTAT