Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_195846 (4018 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_195846

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_28908 1 679 bp MLOC_28908.1 Available Available None
MLOC_28907 1 3219 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_28908






CDS Structure of MLOC_28907






Contig Sequence (4018 bp)

>contig_195846 4018 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCAGGTATGAGCAGCTCCTGAGCTGGCTGGATGGATGGATGCAGGTCATGTGTCGTGAAC
TAACACCACGATACTTAGGCTGTTTGTAATGGGAGTATCATAAGTAGGCAATTTTGATGA
TTCTTCATAGAATTAAATGAAGTTGAGTATGTGTCATGCATGGCAATAAATGAACCACCC
TATGATACTATTAACAGATTATAATATGCATTACGGATGTAGTATCATATGCATAATACT
AGTATATGATACTCTCTATTACGACCAGCCTTATCTGGAACGGAGGGAGTATACTTTGGA
ACAGAGGGAGCAACTAGAGCCGACACCCAGCAACCCAGCAACCAAATCCGGAGCCGTCGC
TCGGACCCCGAGTCCACGCACCAGGCTGGCCAACGACACTGTCACCCACATGGCCAGTGC
TGGCATCCCTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAACCCTAAAACAAAT
CAGTCAAGCTCTCGTTGCCAACTCGCTGACCCACCGTCCGGGTGGCTGCCACATCAGTTC
CCTGTTGCCACGGTGCTGCCAGCCTGCCATTCCACTGCCTTGGATTCGGTTGTGGCGTGG
GCTGGGAACCGTAGAGTTTTGTTCCGATGTGTCGTTCAAGGCGGAGGTTTGGTCGGCTGA
CGTTAGGTATGAGCAGCTCCTGAGACTGTCTAAGTTACTCACCACTATGACCAGTTTGAT
GGATGGATGGATGCTACTGTGTGATGAAGGCCCTGTTTGGATACTCTAACTTAGCTAGAG
GTTAGAGGTTAAAGTTAGTGCTACTGTGTGATGAAGGCCCTGTTTGAACGGTAGAGTTAG
CAGGATGGATGAATGCAGGTCATGTGTCGTGAACTAAAGCCACGATACTTATCTCGAACA
GAGGGAGTATATTTTGGAACGGAGGGAGTACATATGTATGTATGGATATCATGGTCATGT
TGCTTTGGGGTTCAACCTCTTTTTGGATTAAAAAAGAGGGGCGATGCCGATGATGATTAC
TGTGGCTGAAATAATCATGTCTTGAGACATCAAGACAGCCATGGCGAGGTGGGACTAAAT
AGTGCCTGAAAATTGGTGTCTGTGTTGGAGTTGCTCTTAGAGCCCACCCTTACCTCTGTT
GCAGCCTGTCCAATTCATCGCCAATGTTGGATGTTCTGTGCCTTGGACGGTCGTTCTGAT
GAGTGATAACCAGGGCAGTTCTCTTACATTGTGATGGGTGGATTATGCTGCAAGAGATGT
GAGTGTTGGGTTTGAAGATGAAATGCAAAACTGAGCCCTCTCTTGCTACGTTACATAAAC
TCGGTTCAGTTGCATTTTGTTCTGGATCTGGGATGGATCCTCCTCCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCCCTCCCTGCGAAGAAGAAGAAGAAGAACAAACCAGTCAAGCTCTCA
TTGCCGACTCGCTGACCCGTCGTCTGGGTGGCTGCCACATCAGTTCCCTGAATCTACGGT
GCTGCCTGCCACTGCCATTCCATTGCCTTGGATTTGGTTGTGGGGTTGGCTGGGAACCGT
ACAGTATTGTCTGATGTGTCGAATGAGCCGGAGGTTTGGTCAGCTGATGCCGGGCATGAG
CAGCTCCTGAGACTGAGACTAGTCATAGGTGGGAGTAACTTAGGTTTTAGTTCAATTTGA
ACTTGAACTAAAACCACAACAGGAATTATGTAACGGAGGGAGTAACATACATGCCACATA
CGCAAAAAAGGTGGTGTGACAAGTAATTAAAGAGGATGGATGGATGGATGTGTGCATGCA
TGTAATGGGTATCGTGGTCATGTTGCTTGGTGTATAGAGCCCAGCCGAGGGATCAACCTC
CTTTTTGGGAAAAAAATGAGGGGCGATGATGATGTCACCGGCCGACATAATCATGCCTTG
AGCAATCAAGACAGCTGTGGTGTGTGGGTACTAATTAGAGCCGGAATCGGTGACCTCGTT
GGAGATGCCCTTAGAGCCCACCCTTACCTCTCTTGCAGCCTGTTCAATTCATCTATGATG
TTGTATGTTCTGTGCCTCGGACGGTCGTTCTGATGAGTGATAACCAGGGCAGTTCTATTA
CATCGCGATGTGTGGATAGCAAGAGAGTGAGTGCTGGGTTTGAAGATGAAAGATAAAACT
GAGCCATCAATTTTTCACCGTTTAGTTGCATCTTGTTTTGGATTCGGTATGGATCCTCCT
CACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACCCTACGCTCTCATTGCCAACCCGCTGACCCAT
CGTCCGGGTGGCTGCCACATCAGTTCCCTGTTACTACGGTGCTGCCAGCCTGCCATTCCA
TTGCCTTGGATTCGGTTGTGGCGTGGGCTGGGAACCGTAGAGTTCTGTTCTGATGTGTCG
TCTGAGACGGAGGTTTGGTCGGCTGACTCCAGGTATGAGCAGCTCCCGAGACTGTCTAAG
TTACTCACCACTATGGCCAGTCTGATGGATGGATGGATGCTACTGTGTGATGAAGAGATG
GAGTTCTTACAGGGGCGATGATGATGACCATGGCTGAAATAAGCATGCCTTGAGCAATTA
AGACTGCTGTGGCCTGTGGGTACTAAATTAGAGCGCACCCTTACCTCTCTTGCAGCAATT
CAATTCATAGCTAATGTTGGATGTTCTGTGCCTTGGACGGTCATTCTGATGAATGATAAC
CAGGACAGTCCTCTTACATCGCAATGGGTAGATTATGCAGCAAGCTATGTGAGTGTCAGG
CTTTAAGATGAAAGGCAAAACTGAGCCCTCTTTTGCTACGCTACAAATATTTGATTTTAC
CTTCTTTAATATGCATTGTTTTTTTTTTCTATTCCTCTATATTGTGTTGATGTGAGTAAC
GACCCATCTGGACTTGGATTGATGTCTTCTGAACACAGCATATTTGTTTCTGTTGTGTGT
TGATGAGTTCTATTCTTTTCTGAATGGCTATGATGATTTCCTCCCCTTTGGTGTTGGAGA
TCTTTCAACATATCCTGAGATATAGATGCTTTCATGTCTCCTAAATTGGTTCCATTCAAC
TTTGCCCAGTTAGACAGTTAGTAGTTATACTAGGAAGCCTTGCTCTACAGCAAGTTACCA
GTTACGGCTATTTGTTGCTGGGCGGGGAAAGAGAGAGACAGAGAGAGATGGTAAGGAGAC
CTGAAGGATTGGAATATCACCAAAGAACTAGCAATGAACAGGGGTGCATGGAAATTAGCT
ATCCACGTGCCTATCCCAACTTGTTTGGGACTGAAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTTGGTACCATAAGGCTTCAAGTACTACCTGAAGCGTTGTCCAACTTTGGTGA
TTTATGGTGGGTTAAATCTGAGCCATTCAAGTAATACTCTACAATTTTCCTGGATTTCAC
GAACTATTCCTCGTGCATGTGTTTGTTATGACACCTGTGTTTGATACTTCTACTACTGTT
TGATTATAGTAATTTGATCAGTGAGAACTTCTGGAATATCCTCCAGAAAACAGCTTGATT
TCCCTACTAACTTTTCTTTGTTTCTTCTTGATTTGAAGAATGCCCGTTTGGCAACTGTGA
ATGGTCATGGGCTCATTGTGAAAATTAAGTTATATATATTCTGTGCATTGTCGGCCTGTA
GCTTGAAAAAGAAACCTGTCATTACCTATGGCTTTGGTTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAC
TATGACTTTGGTTCTTTGTGTGCACCTTCTGGAAAGGTGAGATGGTGTGAAATCTTTTTA
TTGAACAAATTTAAAAGCAGATTCTTATTGATGCCATTTTTCAGTTTTTTGGTCCAATTT
TCGTATCCATTATCAATTTTTCAGTTGATATTTGCCATTGTAGTCCTCCTTAACTTCCAC
CATTGATGCTTGCCATCCCGTCGCCGCGCCCGCCCCGCTCGCCGTGGCTGATGATCGCGC
GCCTCGGTTGGGGCCGTGTCCCTCCCTAGGATGGAGTGGGCCGCCGGCGCCGGCCCCC