Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_194477 (2153 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_194477

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_28748 6 1999 bp AK369051 Available Available None
MLOC_28749 5 2006 bp MLOC_28749.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_28748






CDS Structure of MLOC_28749






Contig Sequence (2153 bp)

>contig_194477 2153 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGGATACATCTCAACTGACCAGCTCATGCGCTCCATGGTGCCATTACAAGTGGCTGGAG
GAATGGTGTATGCTCACAAGGTGTGTGATCCTTCTATCAAATTCTGGCTATATGTGCATG
GCCTCATTGGTTATAATTTAGGTGTGTTGGCTATATTTAGGTTTTGTAGGCCAAGTTGTT
TCATCCAGACAAGAATCCCACGAATCTTAACGTGATGTGTACATCAATCTCTTCTGCTCT
ATTGCGTCATGTGCTCCGCGCCTGTACCATATGACTCAGGAGTGCCCAGTGAAAAAATGT
GTTATATTTGTAGAGTCGATGTTCTCGGAGAGGGAAAATCATCCCCGCAATGGTTTCTAG
TCATGTGAAAACTAAGTTGTTTAAAAATGGTCAAGTAAAGAAAGAAATCTTTCATGGTTG
TGGGATTTAGAGGATTACTAGCTCGCTATGATTATAGATACTTAATTTGTTTGCTTTTGA
ATTAAGTTTGGTAAGGCATATGAAGTCCCAAGTTATCTTGTAAAAAGGATTCTTATGATA
AGCGTGGAAAGCAACTTCTGAACTTTTATATAGATATTTAAGTACCAATACTATATTTTG
TTATGACACAGGAAAACCATATTTTGAGGCCAAAGATTTATCTTGGATGTTACATGTGCA
TTACTTTAGCTAACCGTCCTACCGTCGGGCTTTTAGTTGAAGTTCAGCGAATTTCTTGTA
ATGGCATTTGAGGGATAATACGATCGACCCAACTGTTAGCTTTGGTATGTTTTTTGGGCT
CGACTCATGAAAATGATGGCTAGCTTGCACCAACATCTGTATGCTGCTCCCATATTACCC
AGTTATTGACAGCAAACTTGCTTGTGTGCCATGCAAACAATGACAGGTGGATGAACATGC
AGCTCAATGGTGGCAATTCAGTCACCGATGTGGGTGACCTAGCTATTTCACGCCACCGAC
AGACTAAACCATTGAGAACGGAACCAAGAAGCTTGTCGTGCCGGCGGCTATTGCAGCACT
GGCCCATCACGCTTGTCCAGGCCGCGGCATAGTCAAGGATCTTAGTTTGTAGGGTGGATG
GTTGCACGGGTCCACTCTTGCTGCTTGTGTCATGGGCACCTTACGCGGCTCCTCCCCCAC
CCCTAGAAGGCCTGCTTTGTTCAGTAACCAACTTTGACTCTGTATAGGCCACTAACGTCT
GGTAAGCGCATAATGCTCAATTATGTGATGTAGCTGTTTTCATGTTCTGCAATTCAGTGA
TACCAAATTGTGTGCACAATGGGATGTTCTTACAGCTCTGAACTTGTTTCATGCAGACAT
ACAGTTGATTTGAGAATTAATTCCTCATCAACCATTGGATGCTATAGGTCTGGGTATAGC
TAACTCAGCTGAATTTTGGCTGAGAGGTGCTCTCATGTTAGGCCAAACACATTTTATTCT
CAAGCAATTAAATCTTTTGTTCAAATGCTTCAAGGCGGTTTTACCATATTTGCAAAAAAA
GGTGGTTTTAGCATGACCATGCTTGTAATGCCAGCTTATTTTCTCAAGTGGGCTGCTTAC
TCAATTGAAAAAAGGCAGAACTTAGTTCCAGATTTAACGAGAGTACATTTTACAATGAGT
TTTATAGTTGATGTTGATCATAATCAGTAAGTGTACATAGCATTTCAAATATTTTTCTAT
TTTGTGCATATTAAAAATTGAATACCGATTGTTCGGTATGCCTATTTGTAGCATATTGCT
GACTTGTAGTGAAGTAGCGCCATACGAAGTACCATATGTACCTTATTTTCAAATAAGCTT
TTCTTAAAATGTAAAATACTAAAAGGCAGGTTGTGCTAATTTTTTGGTATTCTATGACTC
CTCCAAATAGTGATTGGATATACTATTTATGAGCTATAGTAAAATCGATATACATGGGGT
ATGAACTAGAAAGTTTTAAGGCATCATAATTTGTTTCTTGTAATATAATACGACCAACAA
GTAGTAATTTCATGGAATAAAACAATCCCTTGGTCTAACATGATTTAACATTTTTCATGG
GTCGTTGAATGACCATTCAGTTCATAAGGCACATTTGAACATGTGTGTCTCTGCAACACC
TCTGATTTTACCCAACAAAGCAATGGTAATGCTGCACAAAACAGTTCTTTAAG