Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_191313 (3276 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_191313

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_28388 1 369 bp MLOC_28388.1 Available Available LOC_Os09g07320.1, FRAME:-3, EVALUE:6e-75, 13109.m00577 protein ethanol tolerance protein GEKO1, putative, expressed
MLOC_28387 1 327 bp MLOC_28387.1 Available Available None
MLOC_28386 1 334 bp MLOC_28386.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_28388






CDS Structure of MLOC_28387






CDS Structure of MLOC_28386






Contig Sequence (3276 bp)

>contig_191313 3276 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAGCAAGAATTCAAAGAAGCGAAAAAGATTTGAGCCCTTATTAACGACCATGAAGAACA
TANNATACAAGGAAGTCCTTAGCACATAAAGTTGTCGGATCAAATTATACCAACTGAAGG
TAAAGTATGTTCAGATCTGCATTACAACCACATAACTATTGTATATTTAATGCACACTAA
CCTGAGTTTTTTTGTTGTGTAGTACTCGAGGGAGCATTGTCAGTCTTGAGAAAGCATGAT
TATTCCTTCCGCGACATCTGCCCATCCTATACTTGGTCAAAGCTGCACCTATTCAAGCTG
GAAATAACAAGAGACAACGTGAAGGTTTGACCAAATACAGGAGGAAGATGCATTGACAGT
GGCTTGATAAAGAAGAACAAAAATGCTAACTATTGTCTTGTTGCCAAAATTTACGTTGTT
TTGCTATTACACAACCACTTATGTGTGAGTGTGATATTATCAATATGAATCGTGTGGATC
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TAAAAAAGCCTGTGCGTTGAGCTTATTAATGACCACGACATTAGTAATGCGATTCCTTTT
TATAGGTTATGGCTGGATTTCTAGAACCTGGAAGCAAAGTAATAGAATTTTTTGTTTCAG
TGGTCTTAAAGTAAGGGAAAAAGTTTGCCCCATTGTTGTTTGTCTGGTTGTGGTCGTCGC
AAATTTTAAGCCCGTATTTTTTTTTGAGGAAAGAGTGCTTTTATTTATTTTCAAGGGCCT
ATTTTCAATGGCCAGAGTACATTGGAATAGGCTTGTATAGTCCAATATGAGATTCCAGAA
TGATAGCATGAGTCTGAGTGCGTTGTACTTTGCTTAAAAAGCGTGAGTCTGAGTGTCTAT
GTACATAAAGAGTTCTCCAATTTGGATGCCACTAGACCGATACGAGCTTGTAAATAACTG
TTAAACATATTCTATTTTTTGTTATTGAAAGGCTATGCCTCTATCAGTCTCTTGAAAGAA
GTGAAAGAAATGCAGCCTTGATAATTGAAGTCCAACATTCAATTTACTTAACTTGTTTTT
CTCACTGGGTTCAGTCCGTCATGTCCATGGGGGTCTTTATGAGAAATGGTAGTGTCGGCT
TTAAATGTTTGTTGGAACGGGTTGACCAAAAAAATCTAAACCTACAGTTATTTGAATATA
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ATTTATAGACAAAATGCTTCAGTGGAAATACTCTGGTATCCTCATTATAGTTCATGTTTG
TTTGTTTTGTGAAAGAAACGGTAGAGGGAAGCCCAACCCTACATATCAAACGTTAAATAG
GCATGTGTCCCTGAATTTATGTGTAATTCTTAAATACCAAACGATTGGTCTTTTGGCTGC
GCTAAACGATAAAAATTGTTGGCTAGATTTTATCCAAAGGTCTAATGCACAAAAAATGTA
AGGAACTAAGGATGGATATAAATGTATACCTATCTCAACAAACATCATGGGTGTACTGGT
AAGTGGTCCATGGTGAGTAGCTTCGAGTGTAATCTTCAAAAGCAACGAGTATTAAAATCA
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TGGACATTGCTCACAAACCATGGAACCAAACAAACGCAGGCTCACAGTATAACATGAAAT
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AACATATCGAGCTTTGGTTGCACCTGTGGGTTAAACAAGATACACACAGATGAATGCAGA
ACCAACCGATTGGATGGACAGTGAGTGCAGGGCGATTGGAGACTGCAGTGTGTTTGCATA
GGAATATGATCTCGGAAACAGCCTCTCCAGTGGCTTCCTGCCACCGATGGTCAAGATCAT
CCTCTGCAACAATGTTGTGTTCATGTTTCAATAACCTAACATTACCATTTGTAAAGCTCT
CCATCCCCTCCTAAATACAAATATTAGCAAAGGTTAGTTGGGAACTATACCACAAACACA
TTTGTCAGAAACCTTATACAAATAAATAAAATAAGGATAAGTATTGCAGATAACTTTAAC
CGAGATCAGAGCCAGTGGAACATAATGGACCATTGTTTTGTTACACCAAACGACCCTAGA
TCTCCGTACACTAGTGAGGTATGCAATTTACTAGGGTATATACTCGCGGGTAAAATATTC
TAGCAAAAACACACCTAATAAACAGTCTGCTTGTAACTCCCAGATTGCGGTCACTACCAC
TATGTTGCCAGTGAGAACGGCCATTATGATGGGCTGCAGTTTGGATGTTTGAGTGTGTCA
ACATGACCTATATGATGAGGTGCAGTTTTTATCCATTTCATTGTCTGGACGCATTGACCC
GAGTGGATCAGGATGTAGCGTGTCTTGGACATCTATCGCAACCAGTTTTGCTCTTTGACT
GCATATATTGTATGATGACCCGCCATTAAGAACGAGGAAGAAGGAGAAGACCCTTCTGAT
GGATAAGAGTGTTCAGTACTACTACTGTTGCTTGAAGGTTTTGGTTCTTCTCCATGCTTT
TCAGTACTGTCCATATCTGCTGGTAAGCTTTCCTTGGAAACTATGGCTTTCAGGTCGCTG
GAAACTTGTTTGAAATACAGTTGGAGACAGCTAGAAATACAGTTTGTTGTATAACCTGTC
TATACCCAACTATGCCTCCGATCACAAGTGTCATTCCAAACACTGAAGTAGTCTCCATAA
CACAGCTTTGGCAACAAATTTCTATTTAATAGTACAGTTTTTTTATCTGAGTCCTCTTTC
CCTTCAACGAAAACAGAATAGGCAAAAACACCTTAT