Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_190328 (2127 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_190328

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_28246 2 296 bp AK365754 Not available Available None
MLOC_28245 1 388 bp AK372635 Not available Available None
MLOC_28247 1 138 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_28246






CDS Structure of MLOC_28245






CDS Structure of MLOC_28247






Contig Sequence (2127 bp)

>contig_190328 2127 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACCATTGACCATCATGCAGTAGGCGCAAGATTGATAGTCTCCTTACCTCACTTCGTTGG
AATGCAGTGCATTTGCATTACTCATAGTGTACTGAAATTCTTGGCTTCTATACAAATGAT
CCTTTTGACCTATTCTGATGCAATGTGGTAAATTCAGATGCATCGTGTTTGTTGGATGCA
TATTTCTTTTGAAAACAAAATGGGCAACGTCTTCTTGTTTAATTGTTCAACGAGGTCTCA
AATAGAAATAGTCAACTATCGTCATTCTTAAATCAAAGGAAAAAAATATTGCCCTTGCAG
TTATGATATATGTCATGATGAACTTAAAACATGGAAGTTGTTACATGAAGTTTTTCATTT
TCTTTTCATTTTGAAATTGTCATCGGGTGGAAGGGCTCCCCATCTGAAATGATCTCATTT
CAAAAAGAGAATTGATCCAGGGTTACATGAATCTTTCAACTTTATCACCTGACCCTTTGT
ATTTCCAATGAACACCAGGTTATAAATGTTCAAGTGCCTTTCTTGTTTAAGCTTGCTATC
GATTAGCTTGCAGCACTTGGTGGCGCTGAAGCCTCACTGGCATCATTAACATGATGCTAA
TGCAACCCTGTTGGCTCTCTTTGCAAGCCGAGCAGCAGTTCTGAGTGGATATGGTATTGC
GCGGTCGGGAGTATCAGCTTGTACAGGTAAATTTTGTTAAAGAACTTGGTTATCAATTTT
TTTTATGCCTGAAAAGCCGCCGAAAGAAACTCTGCATTTTTTAAGTTCTCTCTTTCTGCT
CTCCTTTCATAACATATACAACTATGATTTATGCATTATGGTAAATATTTATGGAAATTT
TTCTGTTTCCAGAACTATGATTTTCGAAAGTTACCTAGAGAGCCATCCGTTCAGTCTCCA
GGATGGTAAATGCTGAACCCTTTCATTCCCATGGTATCACTTTTTAATGAAGTTGTTTAA
GTACTGTAGCTGTCCAGAATTTTAGATATTTCAACACAGTATGGATATATATTGAATGAA
GTATCTTATTTTCTTGCTATACAATGTTGTTCCTGTACGTCCTTATATTCGTGAAGCTGA
AAAAAGGTTACTATGAGTGGTATATGTACATTCTCTTGCTCGAACCCGCACCTAAGTGCG
TGTCATTTTCATTAAAAAAAATGTCCAAATGGGGCAAGGTCTATCTGGTAGTAAGAAAAA
ATTGAAAGCAAGCAAAAGAAAGCTAAAGGCCTAACTAAAACTAGAAAAGCTAGAAAAGGG
AAAAGAACCATTTGAAGATCTTGCACTTAGCTCGAGCCAAACTATTTGCATCTGTACTTC
TATGAGGATCGAGTGCCATCTGTACATTTGTAGCCACTTTCAGTTTTAGATGGACCTGTC
CTGCACAACTATTTCGATATTTATGTGTGGACACTTTAAGTATTACTTTAGTTTATTAAC
TTTCCGTGTTGCAGGTGTTTTCTCACTTGCATGAGCTTGATCTTCGTTATCATCTAAGGT
ATTTGTGAATGCTCTGGTTCATGCCATCATGTCTGCTTCAATGTTTTCCTTGATTCATTG
ATTGTCCACACTATATTCTGTGCGGCCAGTAAGGTGCCGTCCTGTTAGCAATTAATCGGC
CCTAGGTCTAACTGCTACTTGTGTAAATCATCATTGTGGAAACATGTTATAAGAATTCAA
CACTTACAGTTATTATGTAGTTGCTGAGTTTTGATATTTACGAGCTGGGAATTATTTGAT
TTTTATGTTCCTTTGCCTGTTTATGTTTTTCAGCCGGCAAACTGGAGCTCTAAATCGCAT
AACTGACAGAGGCAGCAATGCAATAAATTTCATTCTTACAGTGACAGTGTTCAATATTGT
TCCCACAATACTAGAGGTACTCACAGTTATTTCTCCAATTGTTACCATTCATCAGTTGTG
CATACTGTGATATTGCTGTTGCTTTTGGTAATTGATGCCACTTATTCTCGGAATGTTTGC
TTGAGCTCTGTCTATGTTGTGTTTTGTTTCTTATTTACAGATTGGTATGGTGTCAAGTAT
ACTTGCCTACAAGTTTGGCTCCACTTTTGCTTGGATTACTTCAGTTTCAGTCGCTACTTA
CGTTGTTTTCACTTTGGCTTTGACACA