Map Locations of contig_188125 (10217 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_188125

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_27993 2 2818 bp MLOC_27993.2 Available Available LOC_Os05g15890.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13105.m01674 protein SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_27993






Contig Sequence (10217 bp)

>contig_188125 10217 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCATCAATTATCAAAACCACATAGGGAGATATATGCTCTAACACCGGGAGGCCTTGATG
GACTTGTTTTTCATTTGACGAACGTCTTGTGCATCTAGATTCCGAGGAACTTCGAGCTAT
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GTTGCCTGCTTGGATTTCATAAAAAATGCGAGTCTTCATCCATTATTTGTGTGATTCACA
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CTTAAATTTTTGTGGCTGAACTGAAATGAACTGTACAGTATCCGCAATCACATGTAAAAT
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CTTTAATCTTTATTTGTAACTGCAGCGATGATGATAAGATGTTGACGATTAAAACTTTTT
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ATTTGGACTATAAAAAGATTCAAACAAACCCTAGCCCATATTATGGTAACTTGTGTAATC
ATCTTCTTTGCATTTTTTAGCATTGCGTTTATTTCTGGAAGGTTTTCTTTTCTAGATATT
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TTTTTCTTATATCTACCCGGGCAGGTAATTTAGGTGTTAACCTTGTCAGTGCTAACCGTG
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TGCAAACGAAATGCTGCGTGCCTGCTAAGCCGACTTATGCTTTAGTACTGTGAAGCACTT
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AGGGCGAAATTTCGCTCAGTGGAGGAGCAGAAACGGAAGGAGTTCAGCCGTATCGCGTCC
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CGCAGGGTTTCTTCAGAGTTCTTTTTCCTTCATAGTGTGGAGCTATCGCATATGCTTAAA
TGCTTTGGCTGTCTAGAAAGGTGGTATGCTTTCCTTTGAGGACATCTCCATGTTTGTTTG
TTTGTTTGTTTGAAAAGTGATGGAAATCGATTAACATCAGGCGAGATTAAGTTTGGCTAT
AGCCTATAGGCTTGCGTGACCATGAACATGATGCTCAAATCAAATCGGTCCTCCAAACAA
CAGCAATGAAGTGGCAACATCGCTTGCTTAAGAGGAGGTCCGACGCTTCCATACACGAAA
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CCATAACATCAGATCATCCGCGATGCTGAGTATTGTGTGGTGATTTGTTCTATCACACGA
AACAAATAGAAACTAAGTCAGTGCTTCTACGGAGGGAGTAAACGTGAGAACGGTTATTAA
AAAACCGGGTGTAACGG