Map Locations of contig_185116 (6225 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_185116

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_27662 5 2456 bp AK360972 Available Available None





CDS Structure of MLOC_27662






Contig Sequence (6225 bp)

>contig_185116 6225 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCGTGTTCAACCGCCAGCGCCAGGATGAGCGCCTCCCGCGCGGCGGCGAGCAGAAGTCC
GTTGTCATACTCTCACACGCGCCCTACTCTTCCCTCTTCCGCCTGCTGCTGCAGATCCTT
GGCCCCCTCTGCTTCGACATAGGCCACACTGCGCTGACAATGGTGGCCTCGCACGTTGCC
GCCTGGCCAGCCCCATCACCGGGGTGCCCCATGGAGCTCCCCATTGGCAGCGCCGCGCTG
CGGGTGCACCTTCCGCCCGCTGCCGACGACCCTGGGCCGCCGCCTGCGCTGTTGCCGGCG
AACCCCTCGGTGCCGTATGGGCTCTTCCACGATGCTGACCTGTTTGCTGCGTTTCGTGGC
TTGCTCCTCCACCTGTGGACTCTTTGGGAACTCATGGTTGTTGGTGAACCCATACTGGTT
GTGGCGCCATCACCACCTCAATGCTCCGAGGCTGTGGCTGGGCTTGTTAGCCTTGTTGCT
CCAATCTTGTATAGTGTGGACTTCAGGCCGTACTTTACTATTCATGATCCGGACTTTGCT
CGCCTGAATGCGCTTGCAGAAGGTGAGGTGTTCCCGCCGATGGTGCTCGGGGTGACGAAC
TTGTTTTTCCTGAGGAGTCTTAAGAGTGTTCCAAATGTGGTGTCCGTGGGAAGCCCGAAT
CCAAATTCTACTAGGGTGCTCCCAGCAGGTGGGCAATCACCGGCATCAGCAAATGGATCC
AATGGGACACCTGTGAGGCTCAAACTCGACAAGCTTGCAATCAATAAGTTTTCGCCCACT
GGTCTATTGAATTCAATCAAGTTGAGAAGAGAAGGCCCTCTTTCCCTCATGACAGAGCAT
AAAGAGGCGCTATGGAGCACATATGTGCCAACTACAAAGCCTGACACCTCTGTTCTAAAT
AGACTCATTGATGCCGGCGTGTCACCTAGAATTGAGGAGTCCATGTCAGTTGTCAATAAT
GAGATATTGAGGCGGCATTTCTTGGAGCTAACGACCAACTTCCTTGCACCTTTTGGGCCA
TATCTGAGAACCACGACACCACCGGAAGGGAGTTCTCCATTCGTTGATCCACCACTACTT
CCACCATTTCACGCAGATGAGTTTGTCAATGGTTTGGCTTCTAGAGGCCCAGGGAAATTT
TTGTCGAAAAGGATGAAGTCCAATTGGTTGGATTTATATAGGTAAGCCAGAACCACATTT
GTTTGGCAAAACATTTTATGAATTTTTAGTTTGAATTACTTCGCAAAACAGGGATTCGCA
AGCTAACTTTTTCTTTTTTGTTTCACCACTGATCTTTGTCAGAAAATTCTTGGAAGGCCC
TAACTTCATGCCTTGGTTCCGACAAAGACGTTCTGCTGCAGAGCAAGATCAGCTAAGGTT
ATGGAGGCAAGCTCGCATGAATGTTGATATCGAGAAGTTAATGTCAAAGATGTCCGAGTT
GGAGAGGATTGATTCTTTTAATGTTATTGAGCGGTATCTTCTCAAAGAGATGGAGGTAAT
ATATGTTCTGATGCTTTCTTAAGTTAACTGCCACTTGCATAAATAAATAAATCCTTAATA
GTTATGGAGATTTAAGTAAGAAATCCTTAATAGTAGTCGTTTTCTGTTAGGACAAACTAC
GAAGATAAGCTCACGAACAGCTCATATAAACTAAGACTAATCGTTCTAAGTCATAAGCCT
TTTCTTCTGACAAGGACTGCCTACACCTGCTATAGGCTTTAGGCCAGCACGAACCAAGCA
GGATGAATGTCTCAGTTTGACGGGCACATAAAGGAAGTTAAGGGAAATATGATTGCCATT
TTGGAGATGACACTTTAGGAAGTTATCATAAGATCTTTAAAGTAGTTCTTAGTTGCAAGA
AGAGTTCTATCCGTGTAGGACACTAGCGGCCTGCCAGGTCACCACGATAGAGATCGAAAA
GAGAGTTTGAGTTTGTTTAGTTAAGATTTTGAGTTTGTTAGTCAATGCATGTGTCTCCAG
TTAAGCTAATTCCAGTTTGGTTAGTCATGGATCTATTACTGGTCAAGGCTGTGCTATACA
AGCAAGCTGATGTATCTTTTGATCGATCAAAACAAAGAATCAATAGTGTAAGTCTAAATA
GCCTCAGAGCCACACTGCCAAAGTAGGGATTAGGATCAGAGGTGATTAATTAGGGTGAGT
GCCCTACCCTCGATCTTTGTCCTTTAGACCCTTATCCTACCAAAATCCATATCAAAATCA
GAATTACACTAGAGGTCCTCTTGGTGAGATAGGATGCAACCTAACATGTATGTTATGCCT
TGTACTTGTGTCTACTTCCTTGGTTTGACTGAATTATCCTTTCCTCTTATGACACATTGA
GCTTTAGGAACTAAACTTTGGAAGTTTGGTAATGGTATGTTATAATGATTTTCTGAGTGA
TTACCTAGTTTAGTTTTCTGTAGCATAGGGCTAAATGTCATAATATTCAGCAGTTCTCCT
AAAAAATGATTCAGATCACTGAGACTTTCCACATATACTAAAAGGAACACGAGTGGTTTT
CTTGCATTTAATCAGATGCACCCTTAATACTTCATGCAATACATGCAATTTTCTGCAATA
AAATCCAACGAGGCTCCTACTTTGTAGCGCACACCAATCTGTACTCTATTATGAGTTTGC
CATTTAATTAGCTTACAGGAATGTTGCGCCAGAAAACATTAATTAGTCTATGGTGAACTA
CAGATTAACTAGGATTTGATCATTTTAAGTATGAACTGTTCTGGTATATGAATACGGTTT
TAGTTGAACGTACCACATGTTTTGTGTGACTGGTTTTGTTGATGTTTTCTTGCAAGAAAT
CAAACCAAGTGGCAATGGAATAGTGTTAAATGTTAAAGTCATGAAGTTTAGCGTAACATG
ACTGAACTGGGACTTTGTTCTGTCTTTACCTGCTAATAACCGCCTTCGGTAGTCGGTAGT
AATGGCATTGGATTTGATGTAATAAACAGTAAAGCATTAGAGACGTATAACTTTTTTGCT
GAATAGTGGTGTGACACTATAATAATATAATTTGGTAATTAGGGCCGTTCTATACCAGTC
TACCATTCTCTCTCCTGTATTTGATAGACTGGAGGGATGCATGCACATGAACGGTTGAAG
ATTTCCATCTTATATTATTATTATGTAATTTTGACAGTCTAACCTCAAGAATTTCGATTT
ACTGTAACAGCCCCCATAATATAGTTCTGTAACAGCACCCATGATATAGTTCATTACAAC
AAGAGGGGCCTTGCCATTGTTTAGTGATATATACATTTAAAAGTTGCATGTTAAAATGTT
TCAGCATATAGATATCCAAAGGAATACCCTGGACAGTAGCTTGTTCAACATACCTATTCT
GCGTTCCATGTTTTGTTGAATATCCTGATGTTTATTTCCAATTTCTGCCGTCCAGAATTC
TCGGACAGGTACTGCTGAATCAATAGCAGCATGCCAGAAACTGAAGGCAGACCTCCAGGC
AGCATTCAGTGTCCTCCCAAAGGACATGCAGCAGCTGCTGCTTTCCAACCCTAAACGAGC
CGGGCTTCTTCAAGCCAGCCAAGAAAAGGTCTCAGGACTTGGGGACGTTGTCTCCCAGAC
AAGTTTGTAGCTGTTCTCCTTTTTCTTTGTAATATTACTATTGCGATTCTTTTATCCACA
GAGTAAAAAATTCACACGATTTTTTTATACATGGGTACTGGCCTGCTGGGTTTGATTCTC
TTTTATCCACAAAGACTAAAATTCGCATGCCTTTTTTATAATTACATGGCTGCCGGATTT
GACTCAAAATGTTCATATTTACCTTTGCATCTCACTCTGTATGATTCCACCTAAAAAAGT
GTTATTGAAGAAATAGTAACATAACTAAATGATTTATTGTCTTGGTTCTTTTTTCATCTG
CAGAAACTATACAGCTTAAGAAATCATGTTTTACATTATGTAACAGCCCTCAGCATCCTC
CATTAAAAATAAATAAGCAAGGTTATTCAGATTGAGGATCTTAAGGCGTGATGTTAATGG
TTGGTCTTATAGCTGGATGCCCATCAAATTATTGGTAACTTGCTATTTTGTTCTTCCAAT
ATAGTGATGAATCCATACATCCTCAGCTGTGGGATCGATTGAGTGGCAAAAAAGATTTCC
CTTTCATCCTCTAGCGAACTTTTTTTCTGGCTCATTCATGTTGATATATGAATGCTGACA
TGGTATTCTCAGCTATTCCCCCGTCCCATAATATAAGAGCGATTTTGACACTACAGACGG
AGGGAGTAGAAAGCAATGATGCTAAGCTGCAGGTCCATCAGGATTAAGGACATGTTTGTT
CGCCGACCACACATTGCCAATGCCAGACCTTATTGGCAGCATGCTTTCTTCAATGGAAAT
AGATAAAATTTGAGAGCTGGTGTTACAAATCCGAACTATTTTGCGTATTGTACAAGTTTG
TTGTATTAGAATTCAGAACCAACTAAAAAAGACTGATGGAAATTTTCTATGAAGCTTGTA
TCTGAATGTAGGTTTACCTTTTATTAGTTGTTGACGATGCTACTTATGTTACAGCTGTGT
GCATTAGTGTTTTACTATCAGTACCAGGTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAACGTCT
AGATCACTGTTTTAGTGATCTAAACACTCTTATACTCCCTCCGTCCTAAAATAAATGTCT
TAAGCTTAAGCTTAGTACAACTTTGTACTAGAACTAGTACAAAGTTGTATTAGAACTAGT
ACAAAGTTAAGACAGTTATTTTGAAACAGAGGGAGTATTAGTTTACAGAGAGAGTAAGTA
TTAAAACTGTCAGCTTGGACGGTTAGTTTCTCCGACCCTTCTTACATGAAAGTTGCATGG
CCTGATATATTTGTGCCTGTTTCTACATTGGCCCAAGAAGTCTTTTCAGAAGGCTCATGA
TACATGAGAAGTAAAAAGAAACTCAGGAGTGATGTTTTCACATGCACCGGTGATCTGTAA
TGCAGAGCCCAGAATCTAACATGGTTTATGAGTTAAATGTGTAGATCAATACTACATCCG
GAAAAGAGAGGGAGAGAGAGACCTGGACTTATGCAAAGGCTCATAAGCTCCAACCATGTG
TTAAGAAGAGGAGGAACTACACGAACTAGAATCAGAAAATTGGGCAACTTAAATGTGTTA
AGAAGCTCTGGCTGGAATGAACTAGAATCAGAAAATTGGTCCACACATAAGAAGAAAGAA
TCACAACCAAATCACCATTATTTCCTAAGAAAAACATCATGATTTGATCAAAGGTACGTC
ACATCCATGCAGCACAAAGCATATACCAAACAAAGCCCAACAAAGATATAACGAACAGCA
GCGCATAGCGCAAGTGCTGTTCATTCCAGCCAGAGCAATCCTGCTGCCATACATGGATGA
CACCGTCACACCGGGCGGAGCATCCTGTCAGCCCGCTCCTCATTCCCAATAAAATACACC
TTTGTCCGGCAGCTTATGAAGATTGACTTCTAATATCTTAAAGACAAAGCGGCTAGTAAA
CTGATGGCATGGGATGGACAAAACATCACCACTATTGGGTGTAAGGTCATTGTTAGATCG
GTCATCACCACTATTGGGTGTATGGTCTTTGTTAGATCGGCCATCACCTTCAAGCTGTTT
TCGCCATCACGCCACTCATTGTGCCCCAGGGGACTCTCCATGACCTTAACAAGATAGAGC
GGGTCTTTTTGTGGTCGGGTTCGCACAAGACAACAGGTGTAAAATGTAAGGTCATTTGGG
ATCTGGTTTGCCGGCCTAAGGCTTTTGGAGGCATAGGAATCCTCAACATAGACAAATTTA
CCAATGCTTTGCGATTGAGATGGCCTTGGTATGAATTAAAGGAGCCTAATAAACTTTGGG
TCGGATTAGGCAACCCAGGTACTTCTTCTATGCTTCAACCACTATCATCGTTCGAAATGG
GGCTAAAACACCTTTATGGAACTCCCCTTGGTTGTTTGGAAGGAAGCCCAAGGACGTCTC
CTCACTCATTCATCAAGCCTTAATGAGAAATAATTGGAAAGTTCGTGAGGCTCTTCATGG
GAATGCATGGATGGTTCGGATCCGGCCCGACACCATCATCTCTGGGGGACACATCGGGAT
TTTTTCTCTCTATAGATGCTTGTGAACGACTTCAAACTTAACTGATTTCGGAATTGCTTA
ACTGCTCAGAGCTAATATAGGGGAGTAGTAAGCCAGCCCACCACA