Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_184946 (2161 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_184946

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_27640 1 192 bp MLOC_27640.1 Available Available None
MLOC_27639 3 395 bp MLOC_27639.3 Available Available LOC_Os06g20090.1, FRAME:+3, EVALUE:6e-33, 13106.m02146 protein NUP155, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_27640






CDS Structure of MLOC_27639






Contig Sequence (2161 bp)

>contig_184946 2161 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGGCCATCGGCCCCGACGTCGCCTCGGCGGGGCTGCACGTCTCGGAGCGGATCGGCCGC
GACGCCGCCGCGCAGCCCGACCTGGAGGAGGCGCTCGAGGCCTCGCGCTACGCCTCCCAC
CCTTACTCCTCGCACCCCAAGGAGGTAACCCCCCCGCCACCGCCCGCGTACTGTCTTCTA
GGGTCTGTGCGCGCCCGAGTCGTTGATCTGCAGCAGCGTATGTTTTCCTTTTCTGGCGGA
GCTTCGCGTGGGTTAACTAGTACAGTACTGGGGGATTCGTGGACATTTTTTTTAGTCTTT
CCGTTCTCCCTGCTGGGTGGACTTTGGGTTGGAAGCCGTCGAAGGCTGAGGTGAACACCG
TGTAGTTGAAATTGGACCTGCTTACTTGGAGCTTGGTAGGAAATTGAGGTGATTTTTTTC
CATAAACGCAGTGCCGTATCATTTTGACAAAATTGGCTGTCTATGGGAAACTTTGCGGCG
AATCCTGTGGAATTTAAGGTAAAAATTCCGGGAAACAAGCTTAAATTGTAGCTGTGCACG
TTTGACAATTTACATGGGAGACTAAATCAGGGGGTTCTAGTTTTTTTTTTGACTTAGTGA
TCTGGGGTTGAACACAACAGGAAAATAATACAATGTTTGCGACGTTGCTTATCACTGTGT
GAGGCAGTGAGCTTCCTTCTTTACTAAGATTCATTCATGAGCAGGCCTAGGTATATAAGT
GTTTAAGCTTGGCAACCAATCAGGGAAACCGCAAAGGGTGCATCTGAGCTCAAGGATAGG
AGAGCTTAATCATGTCTCTATGCAAGCTCATTGCCATTATACAATACTATTTAACAGTAG
ACCTTCTAACACTAGAGGTTATTCAAATGTTTCTTTGCCCACCCACTTTAACTCTTTTAG
GTGATGAGCATCCTTCATTTCTGGCGACGGATTCAAGTTATAGCTGGAACAAAATTAAGG
ATTTAGGGGCTATCTTTTTCTTGCTTGTTCCTGTGGGAATAAAAAGGTGTGGTGGATATG
TCCCTGTTCAGTTCTAACATATGAGGAGTTTCACCTGAAAGCTTGGGGACCCAGGATTTT
TTTGCCTCAAATGCAGTAGATCCTTAAGTCTTGTTAATCAATAATTTTCATGATACTGGA
TAATAATTGTTAGTATTAGTGATAGAGATCTTTCCTTACTCCTTGAGTGTGAAAAGTGCA
CATTTGCAATCACGTAAATACATTGGTTTTGTAAGGCCTCGTCTTTTCTACCATCTGTTT
GTGTTCTAAGTTATTCTAAAGTTATTATGAAAATGTCACATTTTGAACTTAATTTTTTCG
CCTTTATTCTTTTGAATTTGATAACTATGTAAGATACTTTTATGTTATACTGCAGTGGCC
TCCTCTGGTGGAAGTTGCAGAAACTCGGCAGCTTCCTCCTATGCTGATTGAGAGATATAA
TGCAGCTGCTGGTGAAGGAACAGCACTTTGTGGAATATTTTCTGAAATACACCGGGCTTG
GGCAACCGTTGACAATTCATTTTACGTTTGGCGCTTTGATAAGTGGTAATTCATTATCTT
TGCTTGTTCATTTCCCTTTTGCTGACACACACCTTAAGCTAAAAAATGCTAGCAGCTAGC
TGTACCTTATGATGTGACTCTTGTTACTTTGAATCTCAAAGTTCTTGCCATTGTTATGAA
TAGTTTGCCAGGTGCAGCACAGTTACTCTGTAAAAAAAAGTCCTAGAGAATGCCTTAATC
TTGAACAGTTCTTATCGGTCTGCATATTAAACTGAGTTAACTGTGTGATGAGCCTACGAT
GTGTTATTTTCTGTACACTTTGGAGTTGCTTGTCTAACTATGCAACCATACTTTTTTGAC
CATTGATCTTAATGTATTATTGGGTGGGGGGCTCTGTAACCAGCCACCTCTATTAAGCCA
AGCATCTATTGTTGTCTACGAAGTTGTACCTTCTTTTATTGTACGTCACATTTAGGCAAC
ATGACTGTTAGTAGGTGTTGAAAATTATCTTCCTGTGTATGTATGTGTAACCGCATAGAT
GGCAAAGATCAGGTAGTCAGCAAAAGTATCTTCACCTTTATATAGTTAAATTAAATTTAT
TGGTTAGCACAAATGATATTAGGCTCATTAAAATTCTTAGTAGCCCCCCCCCCCCCCCCC
C