| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_184095
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_27538 |
3 |
1484 bp |
AK374933 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_27538
Contig Sequence (2776 bp)
>contig_184095 2776 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGCTTGCGGTCAACTTTATAAAGAACCAAGTATTGTGTGCATTGTCTGTTAGGTTGTCAG
TATCTGATGGAGTAGGTATAACAATATATAGGTTGCAAAACTATCTTTTAATGCAAACTT
CCTTCCCAACAGCAGGATGACGAATTTGTTTGTTGTCGCTATGGGGAGGGTAGTTAACTG
CAAATAGGTTTTTTCTGTCAAAAAATGGCACAAATTTCTGATTACATTGTGGTGATATTT
TTTCTTGTAGGGAGATAAGGAGGAGAAAACGCAGACGTCCTCTTCACATGATAGGTATAG
ACTTGGCTAAGCGATTAGTGCTACCGCGGTTCATCTACATTGATCTTCCACATTGATTCT
TGATTTACCCTTATTATTACCATTTGCTAACTTAACCATCTCTATCTCTCATGCTAATTC
TGATTTTGAAGACCTTTTATGTGTCATGTCGAGAATGGTGTTTGATAAGAAGTTCAAGCA
GGCTGCATATGAGATGAATCAAGGTAACCTATATGATGTAGTGAAGGATAAACTACCCTC
CCCAGTGTTGTTTCTGGATATGTCATTTTTCAGTGAATTACTACTCAAGCATTGATTTAA
GACTATTCTTGGTCATGTAAGAAAGCTGAGATTTATTTTGGCCATGTGATTTCCGTAAGC
ATATCTTGTGAATTTTTTCATTGGAAGTTTCCCTTCTATCAAACTGTTTTATTTCTCCTA
CACAGGAAGTTGGTACAATATGCAACCTTCAAACCATAGGTTTGTGAATTTTATGCCGAC
TGAGCCTCTTTCATTTTAATGCTTGAGTCCTAATATTTCATTTGTCCGAGATTTTGAGCT
CTTGAATAATTGCATGCACAAAAATGATCCATAATAATTCCCTTCTAAGTCCAGAGATAG
CTGCACACATCATTTATTTATTCCTAAATTACTCCATGCTCTGAATTACACCCGTGGTGC
ATTTTATGCCCCCCTTACATGTATGTTGTCGTACTTATATATATTTTCGTAGTGTGTGTG
TGTACATATGCTTTTCCATGTAATCATCCTTAATGAATGTCATGTTCAATCTATAACTAA
TTATCATGGTATTTTCTGACTTTTTTACGTTGTCGCTTACTGGTCTTAAGACATGGAGAG
GAGAGGCCAAATAGCATCTACCATGTAGCTATATCATGCAAACGAATTGAGACTGTAGAA
AGTCACTAATTGTATAAAACCAGAAAAACAAATTGCAGCTCGAGCATGAAAAGAGACAAT
TGCGCAAATCAAACACATATTCAAGTAATAAGTTAGTGAGAGGCTCATATTTATCTTATA
AATGCGCATCTCGAGTTTACTTCACCAGCGTCAAGCTGATGTTTAGCAATCATGGACCAA
GTTTATCTTTCGTCAATTGCACAATTACGTGCTAATAATCCTCATTTTCGTACAATCGCA
TAGATTATATACTGACAGGTTCTTAGCAACCATGACTCCACCCACAACCTGGAGGAGGCG
GCTCCACCGACAACCTGCTTTCCCTCAATTTGTTCAGTGAGCATTGTTATCTTATTCTCC
TTACTCTTACTATCATGAGTGGGTTTGGAATTTGGGCTTTTTAGTTCTCGCGTTTGGACC
AAATCACTGCGCATTGACATCAATACCAAGGAGAAGTATTGGAACACAAGTTGACAATGA
AGGAATTATTGTCGATGGATATCAGAAGTTACTCGCATTGACTATAACTGTAGAAGTTAC
ATTCAGTCATGTAGAAATGAGTTTTTTATATCAAATAGGATTGTCAACTTATATTATTTG
ATTGGATAAATGGGGATGTGAATCACTTCAAATTGACTGCAATAATGACCCTTTGTTCAC
AGAACAAATGAATATGTAGGTTACGGTGCTTGTAGTTTTTTATTAATTAGTTCAAAGAGT
CACTGACTGTATCATCACACTGACACAGACGACAACCAGATATTTAAGTCAATTTAAATA
GAGTACCCAGGTCTGTGTGTTGTCATCAATTTAAGTCAATTGCTATGCTAGAAGTGGACA
TGTTTCTATGCTTATCTGAATTTTAACCGGAACCAAGTGCTTGAGGTTGTCAGGGTTTCG
GTCAGGTTTTCAGAAAAGCATTTGGGGTGCTATGCTAGAGCACTGTTTTCAGAAAAGCAC
TTAATTGATCTCTAGCTTTTTTCACAAGACCACCACCGGTGAATGATTGCAGAATTTTGC
ATGTCATTATACACCACTATTTTTTTCTTTGGTACGACTGTTTGCGCTACTAAAATCTTC
ATTTCTTCTCAGGATAGCAAAATTTGCATGTGTACTTATATTTGCTTGTACTGAGCGATG
CTACTTTTACGAGAGCATGTCATAATTAAATTTCAGTTTGAAGTAATAATTATATCTTCA
TGTCATGTTCTCTGTCATCTCTCACCATTGTGTTGCAAACCACACAGACAAGCAATTTTA
GGAACCACCACCATTTTAGTGTGAACATAGAATAAATATAGTATGCCTGTTTAAAAATCT
TCCATTGAATGTATGGAATTCTAAAGTGTCAATAATGTTCTATTTCTACAAGGATTTTTT
AGTATCAGGTATAAAAAAGAGCACCAACGAAACATTTAGCGCCCTAACCTCCTCACCAAT
CCCCCACCCCACGTACCCACTCGCACCTATCCAAACGGAACAACGGTTCCTACGATAGGT
ACACCGCCCGACGCGCCTCAGCCCATGCAGTTGCGGCCGCCCCACGCGACGCAACCGGCA
GAATGGCACCACCGCC
