Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_183231 (4093 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_183231

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_27442 4 3972 bp MLOC_27442.1 Available Available None
MLOC_27443 1 3238 bp MLOC_27443.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_27442






CDS Structure of MLOC_27443






Contig Sequence (4093 bp)

>contig_183231 4093 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCACTTGTGTGGCTCTCATCTCTATCCACCAATATAATAATCAGCATGCTCATCTACTA
AACCTAGATTCACATAATCCACCGGCCATCTTTTACTAGCTCCTCAAAATCATAATCACC
TAATCCAACCAAAACCTTGTAATCCACCGTAAAATTAGGTTAAAAGATCACAATCACCGA
ACTAAATCCAAACTGTTCCAAACTAAATCAAATATATTTTTATCCATCAATATAACAATC
ATCATGCTCATTTATTAGACCTAAAATCTAATAATCCACCAAACATATTTGATTATCTTC
ATAGGACACAATCACCTAACTAAATGCAACTAAAATCTCATAAATCAAAGAGAAATTTGG
TTAAAGATCACAGTCACCTAAGTAAATCCAAATTGTTTCAAACTAAATTAAATATCTATT
TATGCACGAATGTAATAATCACCATTCTCATGTACTAAACCTAAAATCTCATAATCCAAC
AACCACAATTGGCTATATTCTCAAGACACAATCACCTAACAAAATCAACCTAATCTCATG
ATCCCTCGTGAAATTTGGTTCAGTGTCACAACCACCTTATTAAATCCAAATTGGTCCAAA
TGAATTCATCCACCAAACATCGTTGATTATCTTCTCAAGATCACAATCAAATAACTAAAG
TCATCAAAGATCTCTTAAACCACCATAAAATTTTGTTCAACATCACAACCGCCTAACTAA
GTCCAATTTTTTCAAGTTTATTAGAAGAATATTTATTTATCAATAAAATAACCAACATGC
TCACCTAGTAAACCTAAATTCACATAATTCACCAAACATCTTTTACTAGCTCGTCAAGAT
CACAACCACCTAACTAGATCTAAATTCTTTCAAACTAAATTAAAGATTTTTTTATCCATC
AATATAATAATCACCATGCCCATTTACCATACCTAGAAATCTCATAATCCACCAAACATG
TTTTACTATCTTCGCAAGATTAAATCACCTAACTAAATTCACCTAAAATATCATAAATCA
CCGAAAAATTTGGTTCAATATCACAATCCACTAGAGATATTAATCCATCAAACATCTTTG
AATATCTTATCAAGATCACAATCACCTAAGTAAATCCAGCCAAAACCTCATAATCCATCC
TAAATTTAGGTTAAATATCACGACACCTAACTAAATCTAAATTGATCCGAACTAAATTAA
ATATCTGATTATCTACCAATATAATAATCACTATGCTCATTTCCATACCTAAAATCTCAT
AATCCACCAACATTTTGACTTTCCCAAGACACAATCACCTAACTAAATTCACCTAAAATA
AATCACCAAAAAATTTGGTTGAATATCACAATCACCAAACTAAATCCAAATTGTTCAGGA
TTAATTAATCCACCAAACATCTTTGACTATTCCCTCAAAATCTCAATCAACTAATTAGAT
CCGTTTAAAATCTCGTATTTCACCATGAAATTTGGTTAAAGATCACAATCGCCTAACTAA
ATCCAAATTAAGCCGAGTTTACTAAAAATCCATCTATCCATCAATATAATAATGACCATG
CTCACTTACTAGACATAACNNNNCACATAATCCACCGAACATCTTTGACTATCTCGCCAA
GATCATAGTCAACTAAATAAATCCAACCCAAACATCAAAATACACTACGAATTTGGTTAA
AAGTTCACAATCACCTAACTAAATTCGAATTGTTTCAAACTAAATGGACGGTCAGTTTAT
CCACCAACATAATAATCACCACGCTCATGTACTAGGCCTAAAATCTTAAAATCCACCGAA
CATCTTGACTTTCTCAAGACACAATCACCTAACTAAATTCACCTAAAATAAAATAAATCA
CCAAAAAATTGGTTGAATATCACAATCACCGAACTAAATCCAAATTGTTCAAGATTAATT
AATCCACCAAACATCTTTGACTATTCCCTCAAGATCTCAATCAACTAATTAGATCCGTCT
AAAATCTCGTATTTCACCATGACATTTGGTTAAAGATCACAATCGCCTAACTAAATCCAA
ATTACGCCAAGTTTACTAAAAATCCATTTATCCATCAATATAATAACGACCATGCTCACT
TACTAGACATAAATACTCATATCATCCATCGAACATGTTTGACTATCTCCTCAAGATAAC
AATCACCTAATTAAATCCAACCCAAACATCAAAATCCACTATGAATTTGGTTAAAAGATC
ACAACCACCTAACTAAATTCATATTGTTTCAAACTAAATGAAAGGTCGGTTTATCAACCA
ATATAATAGTCACCATGCTCATGTACTAGACCTAAATCTTACAATTCACCTAACATGTTT
TACCATCTTCTCAAGATCATAAATCATCGTGAAATTCAATTCAATATCTCAATAGTCTAA
CTAAATACTAATTGTTCAAGATAAATAAATTCATCGAATATCTTTGAGTATCTTCTCAAG
ATCACAATCAACTAACTAAATTCATCTAAAATCTCGTAATCCATCATGAAATTTGGTTCA
AGATCACAATCACCTAACTAAATTCATTTTTTGTCAAATTACTAAAAAATTACTTATTCA
CCAATATAATAACCACCAAGCTCACATGCTAGACCGAAATTCACATAATCCATCAAATAT
CTTTTACTAGCTCGTCAAGATCACAGTCACCTAACTAAATTCAACTAAAACCTTATAATC
CATCATGAAATTTGATGTAAGATCACAATCAGCTAACTAAATCCAAAATGTTCCAAACAA
AATAAAAGATCTATTTATCCATCAATATAATAATCACCATGGTCATAATATCATATCTAA
AATCTCATAATCGACCTAACATTTTAGACTATCTTCTCAAGATTAAATTACGTAACTAAA
TCCACCTAAAATCTCATAACCCATCACGACATACGGTTCAATACCACAATCACTAAATCT
AAATTGACCCAGATTAATTAATCCACTAAACAGCTTTGACTATCTCCTCAAGATCACAAT
GAACTAAATAAATGCATCAAAATCTCGTAATTCACCATGAAATTTGGTTCAAGATCACAA
TTGCCTAACTAAATCCAAATTGCTTTATGTTTATTAAAGAGCCATTTATTCACCAATATA
GTAACCACCATGCTCATTTACTAGACATCAATTTTTATAATCCACCGAACATCTTTGAAT
ATCTCGTCAAGATCACAATCACCTAACCCAATCTCCATTTCAGCTCCATTTTGTAAAACC
TTATTTTCAGAATCATCCCATGGGCATTGGTGACACCCTTGGGTTTCTATAAAACTTTTA
TGAGTACCAAAGATTCTTCCCGGGTCTTATGATTTATGCGACTAGCATGGCTAAGCATTA
CTATTGAACTTGCACATATGACCCAAATTTATCTGTGACCACTGTATGGTTAGAAAGGAG
GGGTATTAAGAATGTCAAAGGAGGGTGTCAATATCAAGCACATAAAGCATAGATAAACCC
TAGCTAATTTAATTAGCATAAGAATGTGAAAGGGGTGTCAATGTCAAGCACATAGAGCAA
AGATAAACCCTAGCTAATTTACTTAACATAGAAATACTAGTAAATAATACTTTATGCATG
AAAAATAATTCTAGGTGTAATGCAAATATGGGTTCAACATGATCAAAGTAGGTTGCTTGC
CTTGCTCAACAAAGTCTTCAATGGTTCTGGTCATTCCTCGAGCGTCCTTGAATCTTTCAA
TGTTACAAAAGATAATGATTTCTATTGATTGGAAAAATAAAATTAACACACAATCAATAA
ACAATATGTGCAAAATGCTCCAAAATTTACGGAAGTAGTATCATTGGAAAGAGGGAAATT
TTAGATGAATTTTGGAAGTACCCTAGATTTTAGAAAAAGAGAAATAGTATTGTGGGCCAA
AACGGGTCTGTCCGATTAAACAGTACTGCACCAGGGAAGGGGGTCGACGTCGAAGTCATT
AAGGAGAAATACGCCTTCACTTACGCGCCAATTTAAACCTGCATTGGGGAGATCACACAA
GCCACACATGAGCAGCAAAACCAGGATAATCAAACAATATATAAAGCTCACAATCAGGCA
ATAACAAATAAGA