Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_181433 (1629 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_181433

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_27207 2 1629 bp None Not available Available None
MLOC_27206 2 1446 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_27207






CDS Structure of MLOC_27206






Contig Sequence (1629 bp)

>contig_181433 1629 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATGGAGATTATGTTTGGCGCGAATAACGAGCTTTGTTGGTATAGATGCGTGGAGGTGGA
GCAGTTCGTTTGGTTTCATTTCTGTTTGTTATGGCAGATTGGTCTGGTCGGTTTAGTTGC
TTCAGTGGAGACATGATCCGAACGAGAGATTGAAGGTTGTGGTTTCAGTTTGGCTTGGTC
TGTTCAGTTCAAGGTGTTTATATTTTTGCGGCGAAAAACAACGGGTTGGAGACAGTTCAC
AGTCAAAATTCAGCTGTTATTTTGCTTTTGATCCCGTTCCTTCATACTTGGTCAGACTTG
ATAAGAATTAGTGGAAGTTGGAAAAAGGTTTGCCAGGTCTATCCGGATATATTTGCTTTC
GCCTAGCAGCCTATACATGCCAGATCATATGAAAAGGATTGTGCTATATTACCATGTTGT
AAACTGTGTGGACATGCTCATGGCGGAGGTGATTCTTGAGTGGCTATATTTTGGTGTTTC
ATTTCAAGATTCCTAGGAAAATCGGAGGTGCTTGTTTTGTTTGCATTCTAGATTTAATTT
TCCTGGGAGGTACCTTAAATGAACATGGAAGTTTGCTTTTGAAGTGATCTGTTTGAAGGT
TCTTTCAAGTATACTGAAGATGCTCTTGGATTGTCTCTGCAGAACTACTTTACTGCTGCT
CTGTTTTTCTCTTGTGGTATGTCGAGGTGTATTCAAGTGCTGGTTACTGTGATGTAATCT
ATCAATCCTTCTGATCATTAGTCTGTTTGTTTGATTTTCTACATGGATATTCCGGTTGGG
CTTCAGCTGGTTTCATACTCTGTCCGGTGTTGGATTAGTCTTGGCTTGGTAAATAGTATT
GCTATTGTAATCTGTAGCCATGTTCTGTTAATTAGTTTGTTTTAATGCAATTTATATTGT
AGCACAATTGTCAATTATGCATCTGCTCTGATGTTGCAAATTGTAACTGATGTAATTGTG
GAATGCTATATATGGATGCCATAATTTAGCTCTTCGTCGTCGCTTGGTTGGGTGTATAAA
ACCTGTAACCTAATAGCAACTGAATTTCATAGCTTGATGTTCTTCCTCCCTGCATAAATT
ACATTTTTATTCATTGTTATCTGTTCATTCAATGAAGATTGTTGTGAGCATCCTGTTTTT
GTAGTTCCCACGATCAGTTAGTAATGTTGACTATTGACCTAACATTTTGAATGTCGTTCC
CTTATCCTTTGTTATGTTGTCCGTTCATCCGTTTGGTCAGTTTAACTGTGAAATGTGATG
CCTGTATTTTCTTATTCTGTCCTATAAGGATGCACAAGATTCATTATTATCACATGGGGT
GCTGTGCATCTTATTTGCACAATTCATGAGTATCATATTATGTCGCTGTTTTACATAGTT
TGGTATTAAGCTTCAAGTTAATCTCATGTTACTGTGAGAGTAATGTTGTGAGATAAGTAG
GGGTTAGTCCATATGAGTTCTATGTTTGCATTATTTATAGTCTGCTTTTACTCTTGGAGT
TTCCAACCTGGTTATTGTGAACTAAGATTTTATACTGTTCATGGGCGTAGGCTATATGGA
ACACCTTATATGATGAGTAACAGTTTTCTATTCAACATAGTTTCAGTTTTGAGCAAGTAT
TCAAAGGCA