Map Locations of contig_180461 (2787 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_180461

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_27081 1 128 bp AK370822 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_27081






Contig Sequence (2787 bp)

>contig_180461 2787 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTGCTGATTATTGGGGCATATATTGCGCCCCAGTCTATGGAAAGTCTGCCGATGGTCAAG
TTTCCGTCTCCCTCTCTTACTCTCTATGTGCATCCTTGCCTGCGTATTTCTTTGTGTATG
CTATTATTATTTTTCCCAATCATATTCTTTCAAGTAGAGCTCCCTTTCCTTTGTGGAGAT
CCTAAGCAACACTCTACTCCATACTCGGTACTCACTTGCACCATACCACATATCCCACAA
TGGCCAACTGGCACTCAAGAGTGGTTTCTCTGCCTTGCAACTGAAGCCTATCCAGTATCC
ACACAAGCATACAAATAAAAAAACAGATAGAAATATCTCAACATCTCTGCAATTTTTTCC
TCCTTGCAGTTTTTGTCCAGTTATAGGAAGGGAAAACAAATTGTTGGAAGAATAGTGGTG
TACTAGAGTCAGAATCAATCACCTCACCTAAATGTCCTGATGTGATGACAACAGCCTAGT
ACTATTGCTAAGACTACTTTTAGCCTGATACGTTGTCGACTAGTACCATCGGTCATTTGC
TAGGGTGTGAGGATTGTGAGGACAGGGGTGGCGAGGTGAGTTTGGTGTGGAGCATTATGT
GAGAGTGCCATCAGGCACTTAATGATGGTAGCTACTTTGAACATTGCTCATGGACATATC
TTAGGTGCTAGTGCCATGTACCTGTGTCTATCATGTCTGTTCATTTTTGTTTCATTTCTG
TTCAGCTCATCACTGGACTACACAGGAAATTTTGCACGTTGTTGTTGTTTTCGGCCAATC
AGCAGATGTGGAGGAAGCAAAATACCAGCATGCTACAACGAAAACAAGATTTCCTTTAGG
CGGCACTACAAACTAAAGCAAGATAGTATTAACCATTTGTTAGCTCCTAGTAACCCCCAG
ATTTCCTTGGTTCTACACTCATAAATTGATGATGGCCAAACTATCCTGGTCTAATAAAGG
GACATACTGTGGGTAAAAATAGAAGAAGTTGATTTTATTTATTCATCAAAAACAGGTGTG
CACTCTTAACCCTTTACTTTGCTTTGTTGAGAACATATAGCCCGTATGGCGAAAGCACTG
CACTCAGTGATCAATCTCAACGCCCCAGTTGCAATCTCAGCTACATTGAGATCTACCTAA
AAAAAGGAGATCATTCAGGTAACGTGTACCTGGTAATTGCCCATGTGACCACTTCCATAG
AAATTTTATGTTGTTGCAAAATTCCATCCCTTTTGACCTTTTACGCTTTGCCTTGTAGTA
AGCTGCAGAATGAGGCCCTCAAGGAGGCCATCACCCAGGTGGTGGCGGATGCCAAGGAGA
AGAACAGGAAATTCACTGAGACGGTTGAGCTCCAGATCGGCCTCAAGAACTATGACCCGC
AATAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTCAAGCTGCCCCACATCCCTCGCCCTAAGATGA
GGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAACACGTGGGAGAGGTATGGACCTACTGCTACTGTT
AATTAATTAGTTATCCTTTTCCTCTGTAATAACATAGGTGGACTTCGAGGTACGCCTCTG
TTCTATTTCAGGCTATTGAGCTTGAGACACATGTTGTTAAGGGAGTGGGGAAAGTTCATG
TGAAGTAGTCTCCAATTGCTACAGCCTGGTAGAGGATGCTCGCTGAGGTAAGATTCTTGT
TATGGAATTTCAAGTAATTAAATGTCAAGTAACTGCAAAATGTTCGACTCCATTGATGAT
TGTTGTACTATCATGTAAGTTGTTCTTCTCAAAGAAATTAAAGATGGTGATGTTGATGAG
CTAGCGAAAAAATGCCCAGTTAATGTTTTTGACATTGAAGACCTGGGAAAATGTAACTTG
TCCTTGACTTCCTATTTTGAAAGGCTGAGAAGTTTTAGCAGCTGCGGATGTGCTTTTATA
TTGACTGTTGTATCTTAGTAGCGTAGCAAGGGAGGGGTTTGTCAATCCTAGTAACACCAA
GTCTACCAGATCATTGTTTTGTCATATCGCCTAAATTTTAACACTGTATTATTTATTTAC
AAATAAAAAGTCCTAGGCCTAGTAATACATTAAAGAGGGAACTTTTGTGGTCTATTTTAG
ATAAAAGGGGACATATAATTTTCTCTATATAATGGCATGGTGCTGATTTAACGCTGATAT
GACGTTACAACAATATTACATTGTAGTGTTTTCTGCATGGTTTCGTATCACTAGTTTCAT
GTTGCCTTCACATTTGAGTCTATTACTTGTTTTTTGTTTTTATCCTTGATTAGTATCATT
TGTTGTATTGTAGACTTAAAATTGTGTTAGTATGAATTGTTTTTGTTTTTACAGAAGCTC
AAGTGTGAAGTGTGAAGCCGTGAAGTGTGAACCCAAGTGTGAAGTTGTGAATTCCTACTC
AGTTTAGAGTAGCATATTGTAGCACATCTGTGTTGTACAGATTGTAATAGATTTATTTAG
ATGTATATTTGATCAATTTTATGTGTTCTTAGTTCTATTTGAAATTCATTCTTGGATTGA
AAGTGGTCCAAAAGACAATATATTAGTATAAAATTTAGGTTGATTCTAAGTTTGTGATGT
CACCTGTATTGGATCAGATATATTTGTGCCTTCATAATGCTACAGATCAAAATGTAAAAA
TCTCAAGTCCCAAAATTTGACAAAATTTTGAGATCAGCATGACATGTGGGACCAAGTTAT
GATATTTATTTGACAAAATGTGAATTTTTTTACGTGTGGGACTAATTTTGAGATCAACAT
GACATGTGGGACCAGTACAAAAATAAA