Map Locations of contig_176845 (10578 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_176845

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_26628 1 1626 bp MLOC_26628.1 Available Available LOC_Os07g08170.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13107.m00806 protein ruvB-like, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_26628






Contig Sequence (10578 bp)

>contig_176845 10578 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTGTGGCATCAAACACTCCTTCCTAATTCTATAGGGTTCAAATGGGCATGCCACTCCAAC
CCTCTATTTTTCCTGTTCCTGCGTTTTCAAAATCCTTCAAATCAAAGAGGCCCTATGTAT
GCTGCCCTGCTAATGGGAAGTATGCTGTTCTTTAGAAAATATACTTGCTCCAAAACGCTG
GAGTAAATTTGGTGGATTACTAGCATTTGCTAGCAATTTATCAGGCTGTCTTGTTCATTG
CATTCAATGCATATGATTCTTTTTTGCAGTGAACTATATATTGATTTACATTTGATGCCC
TATGTCTATTTCTGTTTTGGAAGAAGCTTCAACCTTCTCTTGCTATTCTGGAATGCAGGT
CCCTTTCTGTCCTATGGTAGGATCAGAAGTGTACTCTTCAGAGGTCAAGAAAACTGAGGT
CCTGATGGAAAATTTTCGTAGAGCTATAGGCTTACGTATAAAGGAAAACAAAGAAGTCTA
TGAAGGAGAGGTAGGAGTGGCATATATGCTCCTTTTGAAATTGATTTTTTTTTGAATTAG
TGTTTTACTTGATACGAATACTTTCTTTATCATCGTTTTCTAATACAACTAATATTCTAG
TGCTTGTGGCTATATTATTTTGCTTGCCTTTTAGGTTACAGAGCTTTCCCCAGAAGAATC
TGAGAGTTCAACCGGTGGATATGGGAAAAGCATTAGCCATGTAGTAATTGGCCTGAAGAC
TGTAAAAGGGACTAAGCAACTAAAGTTAGATCCTACAATTTATGATGCTTTAATCAAGGA
AAAGGTTACTGTCTGCTACCTACCCTCCCTTGCTCTCTGCCTCTGTTGCTAGACTGTTAA
GTTCCATTTGTATTTTTGCTTTAAATGACAGTTGGTGGATTGTTTATCTTAAGTGTTCAG
AATATTGTCTTTATGCAATTTATAACCCGTGCAAACTCATGGCAAGTATTCACTCATGGA
AACTCACACGTATGATCATATTTCTCTTGTTCATTGTTAGATGTTCTGTTGTGGCATAGC
AAAACATCATGAGACTTTACATTTACTTTCGTTGCTTTGCCTTGGCTCTCCTACTTGTCT
TCTGTATGAAGCTGCTTAACATTTCATCATTTGTATTCGGGATGCAGGTGGCAGTCGGTG
ATGTTATATACATCGAAGCTAACAGCGGCGCAGTGAAAAGAGTTGGCAGATGTGATGCTT
TTGCTACAGAATACGATCTTGAAGCAGAGGAGTATGTTCCAATTCCCAAAGGGGAAGTCC
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TGCATGTACACTTGTTCAGCCAATTCTGTATTTTACCATCCATAAAACAACTTTTTGGTA
ATTGAATCTGAGATAATATAGTGTGCAGTTGCTGCATATTATATGTAATCTAAAGGATCA
ATGGTGGAAGCATGATGCATTTGTTATATATTTTTTGCACATACACTTGTTTAGCCAATT
CTGCATTGTATCATCCATGAAACAACTTTTTGGTAATTGAATCTTAGATAATATAGTATG
CAATTGCAGCATATTATATCTAATCTAAAGGATCAAAGGTGCAAGCATGATGCATTTTTT
TAAGCTGAAGCTTCTTCTTCTTATACTTCTGTGTTGCTCAAGCATGCTTAAATATGTGGT
TTACCTGCCAGGTAGTTGTAAGTTGCTTGCTCCTGCTTAATTCCAGAAAATAGAAATGGA
AAAGCCATAACCTAAGGATTAATAAGATTGCATCAAATACTTGGTCCACATTATTAATTG
CGCCTTCCTGGATAAGAGAACATAAAGTTCGCAAGCTAATAAGATTGCCCGCCATTTTTC
TGATCATCCGCTCAAACCCAGTTAACTATTTTCTTCTGGAATTCACCAATTAAGTAAGAA
TCGTTGTTCTTGTTCTGTCTAAAGAAAGTTAGAATCATTCTTTACGTACCTAGATCCGAC
GAAGGACAATTGAATTCAGCGTGGTTTGTTCTCTATTGTCTCTCGGTGGCTGATAATGTT
TTCCAATAGCATAGAGTGAACAGTCCTGTTTGTGTTGTAACATGGAAGCGTATCTTCTTG
TTTTCAAGTTCAATGTAAGTCAACTGAAAGAAGTAAGTTATATGCTTTCATCTGCATAGG
ACGTTACACTGCATGACCTTGACGCTGCAAATGCCCAGCCACAAGGAGGCCAAGATATTT
TGTCCCTTATGGGCCAGATGATGAAACCACGGAAGACTGAAATCACTGAGAAGCTGCGCC
AAGAGATCAATAAGGTTTCAAAATTCTTGTTATGCAACATTTTATTTTTTTAACTTGGAT
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TAACAGATATATCGACGAAGGTATTGCAGAGCTTGTACCTGGTGTGCTGTTCATTGATGA
GGTATTATATTATTATCTCATGACTGAAGATCTACTTGTCTTGGATTTCCTAATATAAAT
GAGCTTGGGCTTGTTTGTTTCCAACTAATCCTATTGCCAAATAGACAAGTGTCCATCTTG
TGGTGCATCATTGTTCTCCTGAACTAATTGGTTTTATGCTCCTATAAATGGTAGAATTAT
ACCTTACAGTGATCTGATTTCAAATGATAATTTTATCTGTAGGTTCACATGTTGGACATT
GAGTGCTTCTCTTATCTTAATCGTGCTCTCGAGAGCTCATTATCGCCAATTGTAATACTC
GCTACGAACAGAGGAATATGTACTGTAAGGTAAGAAATTTGATTTACCTGTTGTGAACTG
CTCCATGCTAAACTGCAATACCGGAATCCCTGGCAGCGCCTTGCAATTATGCCCACTTTA
GGCGCTTCGGCATCAGGGCAGTGGGTGTGCTCGTCTTACCGCCTTAAAAACATTGCTCTT
ATGTACTATTTTGCCCTTATACATCTTATGATTGTACAACTCTTTTATTCATTCAGGGGA
ACTGACATGACAAGTCCCCATGGTATCCCAGTCGATCTCCTAGATAGGCTGGTTATCGTA
CGGACACAGATATATGGCCCTATCGAGATGATCCAGGTTCCTATTTCCTGTCTTGTCATG
TGTTCAACTTCCCTATGTAGAAATGCATTTAATGTTTGTTTATTGTGCGTTGCAGATATT
AGCTATTAGAGCACAAGTGGAGGAGATTGAAATTGATGAAGACAGTCTTGCATTTCTAGG
AGAGGTTGGGCAGCAGACATCTTTGAGGTATGATTCTTGTTGTTTCGGATGATGTCCACA
CATTTGCGTCCCATGCCAAGATTAGAAATGCGAAATTAAAGTAAATTTTGCTGGAATGTG
GGTTGGAAGGACTTTCTTGAGCCTTTAAAGTTAGGACAGTTTCCAACCTGTTTTTTTTGC
TGCCTTCCCACTTTAGTGTTCTTATTTGAATTTCAACATGGCTGTATGTGTAGTGTAAGA
ATTGTTGGTCGCAATGGGTTATAATAGATCTTGAATCTCTTTGCAGACATGCTATTCAGT
TGCTGTCACCTGCCAGCGTAGTTGCCAAGGCTAATGGGAGAGAGAAGATCTGCAAGGTAT
GTGTTGAATTTCAGTAACATGTCATCTTCCTAGCCTGATCTCAGTCACTTGTATTCTGAA
TTCATGATCCTCTGCCAGGCTGATCTCGAAGATGTTCGTGGTCTGTATTTGGATGCAAAG
ACCTCTGCTAATTTGCTTCATCACCAGCAAGGAAAATACATCACCTAGATTACCCTTGCA
CAAGAATTTTCAGCTGTCGGCTCAGGTGACTGAACTCGGTAAGCAGGTGCAGACTTCAAG
AGCACAATTGGGGGCATTGTTTTCGTAGCAGGTGCACTCTGGACTGGACTTCCATTGGTT
CCAGAGGACAATTTGATTCTGGTCTATGGCTTCTGTTTGCCGATTAGATTTAGATTATGT
GTAGGGATTATCGTGCATCTTCGTTGCCATTGCTAATTAATGGTTAGATCTCGTTTTCCC
TCTTCGACTACCAGTCAGCCTTGGATGTATCAGGTCGTGATTCTATTATGGTAGAACTGG
AATTTCTTGGATTATGTCTTGTGTTAAGACCGACTCAACCTGTCGAGCATGTATCATTGC
ACGTTGCCTTGCTCACTTGAGCTCAATAACACATTGGGGTTATGCTGTAAGTTTGCCTTG
TGTAACTTGTTACTACCTCCGATCCATATTAATTGATGTTGGTTTAGTACAGAGCTGTAC
TAACTTTGTACTAAACTAGCATCAATTAATATGACTTGTAGGGAGTAGATTAATTCATCT
ACTGTTTTTTTGCTCCATAAAAATCCACTGCCGTTATAAGAGGCTTTGCCAGTATTTGTT
AAAACAAGTGTCTATCAATTGGTCTGTTACCAAATACTAGCGGGGTGGCGCTGGGCATGC
CATGCCTGTGTTGTTGCCAGTAGTTGCTCTGGGCGCTGCGTAGGCAGTGTTGTATATATC
AGTGCACAATAAAAAGAGTTGATTCCAGTTCAAATATTAAGTGTTGCTGGTTTACCTTTT
GTTTGGTTTCGGTTCAAATAAAAAAGAGTTAAATGACATCAGTTCAAATAAAAGAGAGTT
GCAACCAATGCATATGAAACATCAAGCGCTGCTGGTTTACCTTTTGTTTGATTGATTTCA
GTTCGCTGGGTACGGCACTTGTAGGTTTGTCCTTGCTTTCAAATGAGACGCTTGTGTTGT
AGATTTCGTGGTAATGGGTGTCATAAATTTATGCACAGGTGAATCTAAAGTGATAGTAAT
TTTTTTTATTTTTTTTGAAACGGAGGCAAAAGATTTGCCTCATTCATTAAATAAGAGAGA
AGTGTTTTTAGAGTGTTACAGCCAGCCCCATGCTCCGCATCGCAATTACCAGCACATTAT
AATAGATACTAATTTCTTGGCGTCCGCGATGACCCAAAGCTTGATGTCGTCAATGATGGC
GCGCATGCGCACTCTTGTGACAGAAGACTCTAGCGTTACGTCCGTTTCAAATAATCTAAG
AGACAAGCGTAGTAAAAGAGACCAAATCACGTCGATTTGGATTGTGCAAACCGGTCTGTT
TATCCAACCATTCCAAGACGGATCCAATCCAAATGCCAGGAGGAGGTGGTCATGTGCGCG
AGGGAGAATTGGAGAATGACCGAGTCCCACAACCTAATGGTGTGACATTTGTAGAAGAGA
TGAGCACCTGTCTCGTTTTCACACTTGCAAAGCAGACAAAGCCCACAGTTTTCCCAAACA
CGCCGTTTCAGTTCGTCGGCGGTCCAAATCCGATCTTGGATAGCAAGCCAAGCAAAGAAC
TTAACTTTTGGAGGAGCCTAAGCTTTCCAGATCATGAAGTCCATTGACGGGAGCGTCAGC
CCAAGGAATTGAGCCTTGTACGCGGTGGCCGCCGAATAAACCTCGTCGTTAGCATGCTTC
TAGATAATGTCATCGACGGTTTGATCATCTAGGTGTATGTCATGCAAAAGCATCCAAAGG
GTGAAGAATTGACATATGTGGTCGGCAGTGACGACGGTGTTGTGCTTGATCTTCAGAATC
CAAGCATTCCCGTTGAGGGCATCCCTAACTTTTAAAATCTTGCACGTGAAGGCCTCGAAG
ATTAAAGGAGCGATGTCTTTTGGCTTCCTCCCAAGAAGCCAGGGGGAGTCCTACAAATGC
GTTTTTGCTCCGTTGCCCAAGATGATGGTCGTTGAGGCGTAGAAGAAGTCCATATCCTCC
TTCGTGCATGGGTTCCCAAGACCCACCCAAAGTTTGCTCGGCTCCTTCCATTCAAACCAA
GTCCATTTGAGGCGTAGTGCCCTGGTGAATTTGCTTGTGTTCAAGACCCCAAGGCCTCTG
TATTCTTGGGGCGGCAGACCAGCTTCCAATTTACATTGCATTTGGTTCTATTCGAACCTC
ACCAGAGAAAGGCTCACTCTAATTTGTTGATTTTGTGAAGGGAGCTAGGCGGCACGATGA
GAAGCATGATGGCATAAATTGCATGGGAGGCGATGACCGATTTGACAAGGGTTGTGCGTC
CAATGGTGGTGATGTTTTGCCCGTCCCAAGTGGCGAGCTTGCTAGCCGCCTTGTCCTCTA
GGTATTGGAAATCCACTGACTTAAGATGCCAGACTGAGAGAGGGAGGCCAAGGTATTTCA
TCGGGAAAGTTGCTCTGGCCACCGAAACGCCAATGAGAATGTGATCTAGATCAACGTCGG
CGCACCGAATGGGCACGACCGAGCTCTTGTGGAAGTTAGTACAAAGACCCGTGACCTCAC
TAAAGCCCTTCAAGATGGTGGAGAGGTTATCAATGTCGTTTTTAATTGGTGCCATGAAAA
TAGCAGCGTCGTTCGCATAAAGGGAGGTTCTCATCAGAGCTCCCCGTCCTCTAATCTTAT
GCAGAAGTCCTTTTCTAGTTGCGAGTTCAAGAATTTGATGGAGCGGATCAATGGCGAGCA
CGAAGAGCAACGGGGAGATCAGGTCTCCTTGCCGGAATCCACGCCCATGTGTGATTGTGG
GGCCAGGGAGACCATTGAGGAGGAATCGCGAAGATGACGAGCATAAGAGTGCGGCAATCC
AATCCCGGGATTTGCTCGAAAAGCCCCTTCGTTGCAAGAGGTCTAGGATGAATTCTTACT
TGACAAAATCGAAGGCCTTCCTAATGTCCAACTTGAAGAGGAGGGCAGGCGTCTTGCGCT
TGTGGAGGCGGCGAGCGTAGTTATGCATGTACATGAAGTTGTCATGGATGCTCCTCTTTT
TTATGAAGGCGCTTTCGGCGTTGAGGCAAGAGTGTCCATATGAGGAGCAAGACACAACAA
GAGAACTTTAGCGATGATCTTGGCGATGTCATGGATGAGGCTAATGGGCCTGTAGTCAGA
AATGCCTTCCACACCGTCCTTCTTGGGCAGCAGCACAACATTGGCAGAATTCAATCATTG
AAGGTTGGATCTGTGAAGGGAGTCAAACCGGTCTATAACTCACATGATATCATGTTTGAC
AACCTGCCAACACTTTTGAAGAAGACCCTCGAGAAGCCATCCGGATCGGGGGCCTTGTTA
CTCGGCATCTCCTTAATGGCCTCCGAGACCTCCTCCTCCGTAATAGCGGCTTCAAGGGGT
TGCAAGTTGGCAGGTTGAACGTTGAGCTCCTCCCAGTTGAAGTCCACATTGCTTGCATCG
CCCTTCCCCATGACCGTCGAGAAGTGCTCGCGGATTTTTTTTTCCTTTTCGCCATGGCCG
GTAACCCATGCACTCCCAAGTTTGATGCGGTAGATGTGATTCTTCATTTTACAGGTGTTG
ATACGGTGGTGAAAGAACTTGGTGTTAGCATCATCCTCCTTCAAGTTGGCAATCCTAGCG
CATTGGTTTTTCCATGCCCTATGAAGCACTGCCAATCTTATTACTCTACGGTTGAGTCTG
GTACGGAGATCGAGCTCATCCGGTGATAGGAGGCGAGTTTCCTACGCCATATCCAGATGA
AGAATCACGAGAAGCGCCACATGGAAGTGGATGTTTGCCTGAGAGAATAACCTCCGGCTC
CATGAAGTGAGCCGACACGCCATCGTCAGAGCTTATGATGTAGAATGTGATAAGGCTCCG
TGTGTGGCACAACCTTGACCCAGGCTTGCTGGACCACCCCATGGAATCCCGTTAGTGAGG
CCCAAAAGTTCTCAAACTTGAAGGAACGCGACCCCTTGTACCCCTGTCATCGGCTAACAA
AAGAGGGCAGTGGTCAGAGAGGGACGATGACAAGGCGTGTAACACATGCGTGTTGAAAGT
AGTGTCCCATTTAGCGTTGCAGAAGAAGGAGTCACGCTTGCAAAGTGTGGGGTTCACCAT
CTCATTGCTCCAAGTGAAGCGTCTGTTCTCAAGGTGGGCGAAGGTGGGCGGCGTTGAGCT
CACATGATTGCAAGGCGACACGAAAGCGGTTGATCCTGCTACTACATAAAGGGAAAGAAT
AAACGCAAGATGAAAAGCTGATTGGGTTTCTTCCTTCCATGTTGACTGAATATTGTGCTG
AGATGTTACACACCTACCACACTATTTCTAACTATATCCCTATTTCAGTCTATAATTGGG
CTTTGAGTTGAATCAAACTTTTTATCAACTCTCTGTATTAATTTTTGAGACCTGATGAAT
AAATTACCTGGCCAGTGGCTTGGAAACGGCACACGCACAACATCTATAGCTGTAATTCCC
AATTTTAATTTCCCCCACCATTCCTTGCGACCTATATACCACCCAGTGACGAATCCAGCT
CAACCTGACAAAATGGTCCAACACTGTAATTCTTCATAGAAATATTTTTTTTCTATTTTT
CTATGAATATAGACTATGTGGAAATTTCCCTGCCCACCCCCTAGATCAGCCACTGATACC
ACCAGTCGTTTTCGCCTAACATTATTCAAGTTACCTCATTTTCATTATGTAGCTCATCAT
GCATGTGCAAAGTTATATAGTGTTAGATCCTAACAGAGTCATTTTATTAACTTGGAATTT
TTTATACATGGCAATTACAGTAGCTTCTGTAGACTGACATCGACTCGGTCCCGCTTGTTA
CATTTCAGTTTCATTAGGGATAGACCTAGTACTGAATACAACATATTTTTCATTCGGTGA
GTCAATTGGGGTTTCATGCAAAATAAACACAATAATTTTAGGCACAATATAGAAAACGTG
CTCACTTATCCAAGATTGCCGACACCTCTAGACCATCAACATTGATGCGCCATCTGGTGG
CCAATTAGACTAAGTGACGATGTTAATATACATTCTGTAAACCTCTAGTTGTCCACCATT
GTCAGAAACCTTTAAATTAATATACATTTTGATAAGGATGGCGGCTACAGTTTTAAGAAG
ATGTATTTATTTTAAGAATGGTGGCTACTCCATAAGTATGTTTATTATGTTGTTTAAGCA
TATATCTAAAGAAATCCTGTTGTGATTTAGAAACTTGTTCAAGTCGAGTGTGAACCATAA
AAAAGTACTTACATAAACCTTTAACATCATTAAAAATTCTAACTAGCACATCACTCAACT
TTTCAATAACAATAGAATCATGTTTCATATGATCACTTATTTGCATATCAAAATTATGTT
GTTCAACAACAAATTTATCAATTTTTATAGGCATGAGTACGAGACTTATTATAAGGAATA
TCACCTTCATCAAATTTATTGAGAGAAAACACCTCTACTACCTTATTTGGAATACCAAGT
CCATGCATCTCTTCAACATGCGGTAGATTCTTTGCATCTTCAGATCTAATACATTTTTTC
TTTCATAGATTTCTTAGCTTCTTGCACATCTTTAGGACGGAGGAATATAATACATATCTT
CTTTGGAGTTGGCTTAGGTGGTGTTGCGTGAAGTTTCCAATCAACGTTACTTTTCAGTAA
GTTATTCAATAGTTCCCGAGCTTGCTCCCTTTTCTTGAAAACACAACCAACACAAGTTGC
TTAAAGTTGTATAAAACACAAATAACACAACTAATGCTAGATTCAGTGGTTAGTCCATTA
TTAAAGATATAAAGAATTTCATTCTTCTCAAGAGAATGATCTGGCAAAGCATTAAGTAAT
GTGATAAGCCTCCCCAAATCATAAGGGAGACATTCTTGCTCAAGTTGCTTAAACTTGTAT
ATATCATGCGAGACAGTTTGTTTCATATGAGCATGCAAGTATCTAAGTAATGGATCATAT
CCTGTGGACTACACACACAATCAGAAACAAGATTATTAAATCACACTTTAGTATCACATT
TCTAAGAGAAATGAAACAACTTAATATAATAGTATTAAATCTTTTCCTCTTGAGCAAACA
CAATGGCAATATCATTCAACTTAGTCCATTGTGCAATAACTTGTTCAGATTCAAAACCAT
GAAATGATTAGATTCTACCAAGCTAATAAGTTTAGGATCACCAAAGAATTCATAATACTT
ACCAGTAATAAAAATAGGAGAAGTAACAAATTTAGGATCAAGTTTTATCATCTTATTCAT
AGCTTTCTCCTTAAGTATAGCAATCAAGCCTTCTATATCATTATCAGTATCATAAGCCAT
AAACTCCCTAGGAATCTCCTCATCAAACACATATTCAGGATTAGGTACATCCAATATCTT
CTTTATAATAGGAGTACTAAGAGAATAAGAGTAATAAGTGATTCATACTTTTTATAAGTT
TTAATTTCTTTAGCTTTAGCAATATGAGCATCAAGTAACTCACCAAGTGACATAGTGTTA
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CATCATGTAAAGCATGTGGTGATCGTGTCACAAGTTGACTCAAAACACAAGGCAAGTCAA
TGTTCGAATTGAATCGGCTTGGCCCATGTACAAAATTCTGAAATCTCAATTTGAGCCCAT
GAATAAAATGGCAAGTGGTGGTGCTAAAGTTTAGTTCCATACCGTCAGTGGAGGAAGTGT
TGGACCTCTTTATATAGTGAGTTCTCCCCACTACTCTAAGTGTGTGTTGAGAAGAGAAAG
GAGAGAACCACACGCACG