Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_172922 (1772 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_172922

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_26014 1 485 bp MLOC_26014.1 Available Available LOC_Os01g61680.1, FRAME:-2, EVALUE:1e-32, 13101.m06573 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_26014






Contig Sequence (1772 bp)

>contig_172922 1772 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCGTCCGCGGGTCGTCGTCGTCCGAACCGGTGCACGCGGACAGGCCGGCGGGGTCCTCG
TCGTCCGAACCGGTGCACGCGGACAGGCCGGCGGGGTCCTCGTCATCCTCGTCGACCTCG
TTGGCGGAGCCAATGCGGCCGCCGCACTTGCCGCAGAATTGGCGCGACCTCCGCCGGAAG
AGGCGCAGGCGGGGCGCGCAGGTGACCTCGTCGGCCTGCGTGAAGCGGGTCTCGTCGACG
GTGATGAAGGCGACGACGCCCTTCTTCCTGATCTGCTTGCCGTACTTGGAGCCGATGCCC
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TTGGTGAACCAGGAGGAACCAAGCCAGCGGCAAGCGGATCAAAAAACCGAAACCATGCCA
GCTAGTTTCACGACGCAAGCACCGGTGGTGCAGGCGCACGCGGCACCGGCAGCACCGGTG
GCTGCGCGAGGCAGGAGTTCGCGAGAGTGGGGGCATGGTAGCGGTTGCCAGCATGGAGAG
TGGGATTAACGGAGGGTTTCGTTAACGAAACCAACAATTTCGTTAACAATGGTATATGAC
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TGTTTGAATTATTTAAATTTGTTGCTTGCATTGTTTTGCGTGATGTCATGTTAAAATGAT
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GTATCTCCGATTAAAATGTTTCATATATGTAACTTGGATAGAAAAATGTGTAGAGCAATA
TGTCAGCATTTATTTTGATGCTTAAAAACTCTAAAATTGTGCATAGGTAGAACAGTATCA
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AACTTGCTGGAATTTCATGTAGTCTCATAATATTTTGTTGCATCCATGATTAACATGTTG
TGGTTGTCATTTGCATGCATTTTGCATTCGTGGCATATTATCTTGCCATGATCATATCTT
CAAGATCGTAACTCCATTTTACGTGATCTATATATGTAAATCGACTAGAATGACATGTAG
AATCTCATGACCCACATTATTTTGCTATTTAATGTGGACCAATTTTGAAATTAACATATG
GAGTCATTTTGAAAATTATGTATGTTGTTTCTGACCTCATTTAANNNNNNNNNNTAGTGT
AGTTTATTTATGCTTCACCATTCATGTTTAACAACATTTAATATTGTCGTGTAAATAAAT
GGGAGTGAGTTAAATGATTCAAGTATGGAGTCTCCTCAATATGCAACTCGTTGCATATCG
AGCTTCATTTAATGTGAAGTAATAAATTGTTGTGCTTTCTCGTGTCATGCATAATTAAAT
GGATACGCATCATATTGCTTGCTCATCCATGCATGCATGTGTTGTGGTGTTTATTGTGTG
TTGATTGTTGTTCCGGATTGTTTCTTCTCTATAGAGTCCCGAACCACTTCGGAGTGAGAG
GATCCGTTCGACTACATTGGTTCGTTTGCTTC