Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_172684 (2701 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_172684

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_25990 1 835 bp MLOC_25990.1 Available Available LOC_Os01g04370.1, FRAME:-2, EVALUE:5e-40, 13101.m00396 protein hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed
MLOC_25989 1 212 bp MLOC_25989.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_25990






CDS Structure of MLOC_25989






Contig Sequence (2701 bp)

>contig_172684 2701 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTGGAAAGATACTTGGCTTGGGGACATTCCTTTAGCACTTCAATACCCTATGCTTTATAA
TATTGCACAACGTAAAGAGGACTATGTGTCCACGATACTATAATCGGTACCTCTTAATAT
GCAGTTCAGGCGAGCTTTAGTGGGAGCACGCTGGAATGCATGGTTACATCTGATCAGAAG
ACTTATGCAGGTGCAACTAACTGACCAGACAGATAGTGTTCGATGGACGTTAGCTGCGAA
TGGTATATTCTCAGTAAAGTCCATGTACAAGGATCTGATAAATACTGAACCGCTCTCCGG
ATCATTACATATTTGGAATATCAAAGTGCCGCTCAGGATTAAAAAAATTATGTGATTTAT
ACACGAAGTTGTGGTATTAAACAAAGATAACTTGATAAAACGAAGATGGAAAGGCATACC
CAACTGTTATTATTGTGATCATAATGAAACAATAAGACACCTCTTTTCAGATTGCCTCTC
GCAAAACTATTATGTCGCACAATTCATATAGCTTTTAATGTTACACCACCTACATATATA
ACATCGTTATTTACAACGTGGCTCAGTGGAGTGGACGTTAAAATATCGAAACTTATCAGA
ATTGGGATTTGTGCTCTATTTCGGGCTATATGAAATACGAATACCAGGAATGACATGATT
TTTAATGACAAGAACTTCAACAACTTTTTACAGGTTATCTACAGAATGACGTCTTGAATC
CGTACGTGATTGTTACTCAGTAATGTGAACTCCAGGAAGCTTATGAATATTGGGTACAAC
CGATGAAGGATGGTCGCACGGGTTATCTTTAACCGGTTTGGATGATGTGCTAATAATAGG
CTAGATGTATAGGCATCATAGTCTATACTTTTACCTACACCGGATATGGCAGTTTTTTCC
ATATCATCTTTGTTTTGATTTTAAGCCTCAGAGCTTTATGAATTTATTTTGATTTTAAGC
CTAAGACTATGTTTTAAACTTATTTTAATAAGATGGCTGTGTGCATCAATTGATTCTCGG
GCTTGTTTTCTCTTTTTCAAAAAAAATTTGCAACTCGACCTGACAATTCAAACCCGTTGA
CCAGAACACTCACAAAATTTTATACATGATAAATGACAAAACTTTTGTTTGTGCAGATTC
TGTCCACCCAAACCACAAGCAAAAAAAAGTCCAAATTTTGTGTGTGCACATTCTGCACTG
CACTCAAATTCAGAACGGTTTATTTCTCATTTATTCATTGCCAAATCTGTTGGCGATTAC
ACAAGTACACAAACGACTGAGGAAAGAAACGCGATACAAAGATGTCTCAACCAGACTCGA
CAAGAACAAAGACACAACTGTATTTAGGTTGCAGAGCTCACACACACATCGACCAGGCTA
GCTCCGACCCAAATACTCAGCCGGAGATCTCGATGGCCTTCACCTCAGGCTTCTTCACCT
CGGCCTTGGGTACGGTGACGGTGAGCACACCGTTCTCCAGCCCAGCCTTCACCTCCTCCA
CCTTGGCGTCCTCCGGCAGGCGGAAGCGCCTCACAAACCTGCCGCTGCTGCGCTCCACAC
GGTGCCACTTATCATTCTTGTCCTCCTTCTCCTTACTGCGCTCGCCGCTGACGACGCCTC
CACCTTAACCTCTTCCTTCTTCACGCCGGGAAGGTCGGCCTTGAAGACGTGCGCCTCGGG
GGTCTCCTTCCAGTCCATGCGAGCATTGGCGAACGTGGCAGTCTCGCTGTTGCCTGAGAT
CGCCGGGATGATGGAGCGGAAGGTGTCGAAGGGGTCCGCCCAGAGGTCAGCGAAGGGGTC
GAAAACGTTGCTCCGCCTCACGATCGACATTACCGGTGTTGATTGCTTCGGCTTGTGCGT
TCGGAAAATTCTGTATCGGATCGTCGGATGTTATCTGCTTTTGTTTGACACTGGCTTGAG
TTGGTGTGGATGGGATGGGAGAACAGGTACTTATAGCGTCGCTGGGTGATGCTCTTGAAG
CGTCTCAAGGTTTCTCCAGTCCAGTGGACGAGCGTTTGTTGCTACTTTATCGCTTTCCAG
CTCGGCTGTGAGCTTCCTTTCCCTTTTATTTTCAGCCGATGAAGTGCCCACCGTGTTCTA
GAGTACTCTCCTGCTTTGGTGTTGATGGGTCTTCCAAATAATAAAGCCCTGACTATTTTT
GGGAGTAATCCGCAATTCCTATTTAAGTTACAACCAAACTATTTTTTATGTTTTTCTTTA
CTAAAACCCCTGATGTTTCTGGTAATCAACCCATCATTCATATTTAGAACAGCCGATTTT
TTTTTTGCATTTTTAATAGAAAACCCCTTGATTTCTCGGTTAATCAATCCACGGTTTATT
TAAAACAAAATTATTCGTATATCTCTTAAACCGTTACTTTGATTTTAACATATTATATAT
ACTAAGTTTTACTAGAAAAATGTATAGGCTAACCTACTAACTCAGTGCATCCATTGTTAG
TTTCTGTCTGCTGATGTCTATTTTGCAGGGGCTTTTACCTAATTGTCTGAAGCCCGAAAA
AATTCAGAAAAAATATATAAAAAAATCTGCGAAACATAAGCTTCCGGATCACCAAAGGAA
GGCCAGGGGCTTGGCCGCGTCAGGAGGTCGTCTGGGTGGGTCCCAGCTCCTTCGGTGCCC
TCCTTTGGCCTATATTTAGGGTCCCGAGAGAAAACCCTCACAGACTTTCTGGAATCGTGA
A