Map Locations of contig_171981 (11074 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_171981

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_25886 3 2138 bp MLOC_25886.1 Available Available LOC_Os01g53560.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13101.m05609 protein phosphoesterase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_25886






Contig Sequence (11074 bp)

>contig_171981 11074 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGAGGGGGAGAGAGCCCCCCTCCTTCTTCTTCCTTGGCCTCCCCCATAGATGGGAGGGT
TTCCCCTATGGTCCTTGGCCTCCACGGCGGTGGAGGGGCGACAAAAAGAATAAACAACTC
ATTTGGTACCCTTTTGTATCCTCATATTATTATTTGTAGTTTTGTCATGCTTTATCTCAT
TTCTTAACTTGTTAAGCACCGAGGTAAAATTCTAAAATAGTTGACAAATCGAGATTTTTT
TGTTAGTTCTCCCATATTGTATTTTTAATGTCATAATGTGTTTTTGCGGTAGATATTATT
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ACTCCGCCATTGAAATAATGCAAATCGTGTGCATATTTGTTAAAAGGATGTTCAACCGGC
CATTACGGTAACTATGGATCACAGGCGTTGAACGCAGTGCGACCCAAATCTTAAATACGA
CGGACGTCGAGCGGACGGCCGATCCAACGGGTGGGCGCGTTGGAGGGAGTTGCTCTTAGG
ATGAGATATCCCAACCTTATTTTCTGCTAGGATTAGAGATGGTTGGTGATTAGCATTGCT
TATTATTATATTCTTCTCCTAAAGTTATATAGGCCCTGTTTGGATACTCTAACTTAGCTA
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TCAGTGGGCCCCATGAGAACTAGCTCCAATTAGCACCTCCTAGCTGGTGGGATAGAGAGA
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ATAGTTTTTTGGATAGTTTAGATGAAACTAGCTCCAATTTAACCCTCATGTTTGGATACT
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TTAGAGCGGACGATGGGGTCGTGTCCGGGCCATTTATGGGACGCGGTGGCCGTGCGCCCA
ACGCGCGGACGCATCCTTGGCCGCATTCCGTCCGCTTCATTTTCAAACACAAGGATTCGA
ATAGCCACGTCTCATAGTTCATGCAAGCGGCCCTAGATCACATCGGCAACACAACCAGCC
TACACGTCCTCGTCCGCAACACAGCCGACCTCCAAAAAAGAATAGGTTTTTCGCCGGCAA
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CCTTGTCTTCTCACTCATCTTGCTCAAGTCCACGCTCATGATCGCCAGCGCCACCTCCTT
TGCTTTGGTTGCGGCATTGGCGGCCTCGATGTCGAGCTGCCTCTGCTTGGCCGCAGCATT
GGCGGCCTCAATGTCAACCTGCCTTTGCCTGGCCGCCTACTTGATGTCAAGCTGCATGTG
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TTTCGCGTCCAGCTTTGCGATTTACTCTGGCGTGAGTTCCGACCGCGGCTTCTTCGTACC
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CGGCGGGGGATCGGCCATGGCGGGAGGGTGGCGGATAGAGTGGAGGGCGGGGCGTGGGAG
GGTTTTGGGGGCAAATGAAATGGAATGGGGCGTGGGGGCGGGAAGACCGTGCTGCTTTGT
GCCACAAACGGGCGGGCCAGGGGAGGACAAGCGCGCGCCCCGCCCGTCTGTGCCGCGTCC
GCGCGTTGTCCGTTTCACCTCAAAACCGGACCAAGTTTGGACCGGGAATGGGTCGAAAGC
GGACAGAAAACGGATAAACGTTTGTTTGCGCCCGCGTGCTCGGCCGCATGGTGTGTCCAT
TTTGCCCTAAACGGACGCGGGCGGACACGAAAGGGGCGCGCGCGCTGGAGTTGGCCTTAG
GCACAAAGAGAATAAACAACTGATTTGGACCCTTTTGTATCCTCACATTATTATTTCTAG
TTTTGTCATGCTTTATCTCATTTCTTAACTTGTTAAGCACCGAGGTAAAATTCTAAAATT
GTTGACAAATCGAGATTTATTTTGTCAGTTCTTCCATATTGTATTTTTTAATGTCATAAT
GTTGCCGCAAACCAACCCGTGATTGGATGGTTATGAGGACCGTGGTATCCCCTGCCCACC
AGAGTTCAAGTCCGAGACTTGACGTCGATGCTTGCATTTTCCTGGATTTATTCCAGGTCT
TTCGGCGATGTACTTTCAGTGGGAGGAGACGTTCCCGTCGACAACGAAGGCGTGAGTGGC
GACTTCGTCAATCTCAAGATGATGTGCCAACTTAGTCTCTCGAAGATGCTCATAAGGGTA
GGTTGTGCGTGCGTGCGATCATAGGGGTGAGTGTATGCTCGTGTATGTGAGTGGCTTCGA
TTGTACTCTGCTAAAAAAATTCCCCATGTTGCCAAAAAGAATTATTTTGGGTCCAGGCTT
TGCTTTAATCTTGACTCCACCATTGAAATAATGCAAATCGTGTGCATATTTGTTATAAAG
GATGTCCAGTCGACCATTACGGTAAATATGGATTACGGGCGTTGAACGCACTACGATCCA
AATCTTAAATACGACGAACGCCGAGCGGACGGCCGATCCAACCGTTCAGATGGGGGCGTT
GGAGGGAGTTGCTCTTAGGCTGAGAGATCCCAACCTTATTTTCCGCTAGGATTAGAGATG
GCTGGTGATTAGCATTGCTTATTATTATATTCTTGCTAAAGTTATATAGGTCCTGTTTGG
ATACTCTAACTTAGCTAGAGGTTAGAGTTAGTTTCTAGCTCATGACTAAGCCTAAAGTAA
CTCTAGTCAAAGAGGTGTTTGGATGACAAGGTTAGATTGACAATATATGTACTTGATGAA
GAGAGAAAGGTGATTTTTTGAGTGGGCCTCATAAAAACTATGTCCAATTAACACCTCTTG
GCTGATGGGATAAAGAGAAAATGATATTTAATGAACCCATAAGAATTAGCTCCAATTAGC
ATCTTTTAGATGGGATAGTTTTTTAATGAATTAGATGCAACTAGCTCAAATCCTCATGTT
TAAATACTTTAGGGCTAGTTATCCCCAACTAGCTCAAACTAAGGGCTTGTTTGAGACTGC
TTCAATTCATCAAAATAAGCTTCACTTCATCAAATTCACCTTGAAGGAGTTTCATATAGA
AGCTATAGCACTATCAAGAGAATGTTTGGTTTCAATGTAGCTCCAGCTTCAAGAATAGAA
AAATTGATGGAAAGAATCTATTTGATTGGTTGAGGGGAAAGAAAATGAAGGGGTATCCAC
TTACTAGTGACAGTGATGGGTAATTTTCCCCCAACTTCAGCTTCTAAGAGTTTTTTAGAA
CACCCTCTTAGGAGCTTCAGAAAAACTTTGAAGTTGTACCCGAGATTCTAGTTTTTTTTC
ACAACAGCATATCATGGAGCTATCCGTTTGACTTGTCTTTTCTGGAACATAGCTGAATTT
TGAGAAACAGAGCAATCCCAAACAGGCTTTAACTCTAACCGGGCGACAGATGAATGGTAC
TGGCAGAAACCTAAAAGCTTGTTTGATTAATCCCTCCCACAAAGGAATTGAAGTGGATTG
AAAGGGATTAATCCTCTCTTCAAACCCATTTAAATTTAGAGAAACCAAACAAGACCTAAA
CGAGCCCAAGTCTAGACCAGTCCACGATGCAGCCGCCCCGAAGCGGCCGAGCGTGACCCT
TGACGCCTGTTCACCAACAGTCGAACAGGACGGCAGGCAGTCGGCAGCAACGGAGAACGC
GCCCGCACCGGCCAACACCACCGCGGCTCGCCGCCCCACCTTCCTCTTTCTTCCCGCCCT
CCCACCACGCCGTGATTCCAGCGCCGACCACCCACACTACACAAAACCCTAGCCAGTCCC
CGCCCCCTCCTCCACTCCATCCCTTCCCCACCTCGCATGCTCGCGCCCCTCTTCCTCCGA
AACCCCAGCCTCCTCTTCCTCCCCGCCATCCTTCGCATCGCCCGGGGAGCAATGTCGGCC
TCGCCGGCCGCCCAGGCGACCGTCTCCGTCGAGTACGCCAAGTCCGGCCGCTCCTCCTGC
AAGGGCTGCAGCGCCGCCATCGCCAAGGGCGCGCTCCGCCTCGGCGCCACCGCGCACGAC
CCGCGGGGCTACGACAGCACCAAGTGGTACCACGTCGCCTGCTTCCCCGCCTCCTCGCAC
CCGCTTGGCCCCGTCGAGGAGGTCGAGGGGTTCGACTCCATTAAGGTCTGGGGGACTTGC
GTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTATTTCATTTTTTTCCGATCTGTTTGCTACTTTGCTTTG
AGGCTAAACTTCGGGTATTTGGGGGTTGTGCAGGATGACGATCGCGAGGAGCTGCGAGAG
CTTGAGAAGGTAACGCATTCCTCACATGTTGAAATGCCCGTTCTGTTTGTGGTGTTCCTG
CCACTCTTGCGCTGAATATTTCTGCCTGCAATCTCGAGTAATGTTAGATCATTCTACATT
ATTCCAAATTTCTATCCAATAGGCAGCTTATTATAGAATTAATATTTTTTTGATGAGCAA
ATGAATAAGAGATTTGGCTTCTTCCCTCACAGAATGTAGTTTTGCTTCCTAAAATAAAAG
TATGGACTGTTCCATGAAATTGAACATTCTACCATTTTCAGAATAATAAGAGAGACCAGA
CTGCAGTAAGTCCATTGGAAGTACCAAGTCCGAAGAAAGCAAAGGTTTCACCTAAAGCAG
GGGTGGCTGAAGAAGGAAGTGTCTCTGTTGAATACGCCAAGTCCGCGCGATCCACCTGCA
AGGGCTGCAATGCAAGCATCGCCAAGGGCGCTCTTCGCATTGGCGTCTCAGCCCATGACC
CCCGTGGCTTTGACAGCACCAAGTGGTACCACGTCGCCTGCTTCCCCACCTCGTCGCATC
CACTAGGCCCTGTTGAGAAGCTCAAGGGGTTCGACTCCATTAAGGTTTATGCTCTAGGAG
GCTTCATTTCATTGTTATTTAGTTCTGTTGTGTATTTTCCTTTGGGGGCTAAACTGTTAC
TTTTGGCCTCCAGGATGACGATCGTGGGGAGTTACGGGAGCTAGAGAAGGTAACACATTC
CCCACTTGTTGAAATGCCTATGCTGCTGTATGCTGAATATTTCTTAGTAGTATGAAATGC
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CCGCAGTCGGTCCAGTGGAAATACCAAGTCCGAACAAAGGGAACGCCCATATATCTTCAC
CTGAAGTGGAGGTGGCTGAAAAGGCAAGTGTATTTTATGACATCCAATATTTATTGTGGA
TAACTTTGCGGGCTTTTATTCTAATGAAGCTTGGACGTCGATTGTTTGAAATTTGTGGAT
TCGATGGGAGGTGACCGGGAAGTAACAGTTTAATCACTCATAGAGCTAGTTTAAACAAAG
TGGCACTGTCACTACATGATATTCGACACATTAGTAATTGGCTCACGTATGATTCTTTTT
AGTTTGTATGACATGTCATGTCTTACATCACAGTTTGTTTAGTTCAGAATGCTTAGTTTG
ATTCACCATGTGTAGAGGTAAAGTGGTTCGCCTACTTTCAAATACTTCTCCTTTTGCATC
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CTTACTATGGTTGGACAAGCTCTATGATAAACCATAGGTAGCATAAGATTTATTTTTTCT
GAATCAGGTAGCATCAGATGTTAGCCTATCATAACTTGCACTTTACCCCATTATATATTC
TTATACCCAAGGTTGTGAGGTGGTGAATGCTGATCCTTTTATTTTGAGAGTCCCTTCTAA
GGAATGACTAGTACGCATCTTTGTATCTTATACGTTTTCTGAAAAATCCTACTCTCCACT
AAATCAATTAAATAACAAAGGCTGTGAAGTGGGATAATGTCGACACGACAACTCATCAAC
TTCTTTTAAGCGAAGAAAGGTTTATACTGTAGCCACCTCCTTCATTTTTTTCATTTCTTT
ACTTCACCTCAAGGCTCAACTACATGGTTATTTATTTGATTTATAATGCTGGTTTTGTTT
TCCACAACAGTCGTCTCCCGGGAGCAAAAGAGTTGGTACATCGATACCCTTTTCAGCTTC
TGATATCAAGAAAGCATACAAGGTAGTCTTGCAATTCCTAGCTAGTCTTACTCTGGTGGT
TCTCTACGTTTGGGTGTTGATAAACATTTTATTGTACTGAGATATTCGATGACACCTTGT
TGTCTGTTGATGCAGGATGCTAGCCTTCCCACTCCTTGGAAGGCTTTTGATACAGTTATT
TTCCGTGAGCAGGTGTGTTGAGTAAAAAAAACAGTTCTCAAGAATTATTTTATCCTTAAA
CAGCCTATATCGCTCTACTACCTTTGGTTATATACCATGTTGTAAAATTCTCAGAAAGTA
ACTTTGTGCAATTCTAATGTTCAGGATGATGGTCTTCATGCTTCAGCTAAGATTGCTGCG
TTTGATTTCGACGGGTGCCTCGCCAAAACCTCAGTGAAGATGTATTATACCATATAATTT
CCCTTTTAAAAATATCTTGCGTAAGATCGTTTGATAAGTCTGTTCTGCCTTCTTGTTCTG
CAAGTACCCGTATCCCACATTCACCGTTTTATAATGAAGACACATTTGAATTGGCTTGCT
AAAGAAAAGATTTGCATTACAGTTCGGTTCTGCGGGCAATGTTTTTCTGGTTGGTTAATC
TCATATCTATCTGTAAGTTATGGACTAATATGGCTTACATCTTGCATAACTGGAAGTGCA
GAATGATGTCTGTGAAAATCCAAAAGGCTTCTTATTTATATGTGAAAATTTGATTAGAAA
AAGTTTGATTCATTCGTGCATGACATGGGCTCTGTACAAGTGTACATATGGTGCTCACTA
CCACACTTTCCTGAAGAATCTTGAACTGTAGGAAATCACAACTTTTCATCATTCATCATC
ATTCTGTCTTGGTGCTCTTGACCTAAGTGGTGTCTTTTTTTTTACAAATGTCTGATTCAA
GTAACCTTCTCTTGAGAAAAAAATATTAGGTACCTAGATCTACTAGAGTTGAGTTGTGAA
ATAAAATAATGCTTGCCTGATGGTCTGGAGTATAACAATTAGGTGCTGGCTTGTGTGATA
TGCTCTCTGGAGACCATGACTTCTTATAGATGGAGCTTTTTTGATTTGAATGCTTCTCTT
ATTGTGCGGTTACACTAGGAAGAATGTTGATAACTTTTGACCTACTGCAAATGTAGCATT
GGTGCAGACAAGTGGTCTCTACAGCATAAATCAATTCCCGACAAGTTGCAAAGCCTGTAC
AATGATGGCTACAAGTTGGTTAGTTCCTTTCTTGTTTTGGTTCCATCACTGTATTCTTCT
TCTATATCTGTGTACTTCATTTCAAGATGAGTATACACATAGCATGTTAACACAAAATCA
TGTTGTATGGTGTTGGCAGGTCATATTCACCAATGAGTCAAACATTGAGCGCTGGAAGAA
TAAGCGGCAGCAAGCTGTTGACTCAAAAGTTGGACGCCTTGACAACTTTATTGAGCGTGT
TAAAGTCCCTATTCAGGTATAATGCGAACCCATCTTCTTTTCTCTAATATTTGTGTTAAA
ATGTGTCTGCTATGTTTCTGATCGATCCTTTGACATAATAAATCATCACAATAAAAGAGC
TGTAGCTTATTGTGCTTGTTTTTTTCCTGCAGGTTTTCATTGCATGTGGTACAGGGAAAG
GAAAAGGCACACCAGATGATCTGTTTCGCAAACCAAATTCAGGAATGTGGTGGTTGATGG
CAGAGCATTTCAATTCTGGAATTGACATCGACATGGAACAGTAATCATTCTATTTCTGAT
TTTGTTTCCAGAGTCACCATTTTGAATTGATGAGTTTTATAGGGCTTAAGCTTAAACATT
TAATTTTAAATTTAATTCTGTTATCTCTCTGCATGTGTGCATGACTCCATTCAGGACAAT
TGCTTCTTGGAGCGATGCCCCTGTTGCTAACTTGGTTATATATCAACCACACTCACAAGG
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TCCACACAAAGACTAAGGCCTCCACAGCATTTTACTGTGTTCATATCTGATATCAGGGTG
ATCAAGCTTAAACATGAGTTATGCTGTTATGCAATAGCCAGTATTGCCACCTTGCTCTTA
TAGTTTAAGTTTATGGGTCTGTTCAGTATGTTGCTGCGGGAATTCATGTCATACCTTTAT
CTCCTTAGGATTTGGTCATGCTACATGCTCTCCTTCTGAAATTTCCCGTGCCTTTTCAGA
TCTTTCTATGTTGGAGATGCTGCTGGGAGAGAGAATGATCATAGTGATGCAGATATCAAA
TTCGCCAAGGTATGGTGAAAAGTCTTCTACCCTTGAGCTGCAATGCATTCGCATTTCTTC
ATTTGAATTCAAACATTCCGTAACTTGAAATCCCCCTCATAATTTTACTTGTCATTTATA
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AGCTTGTAATGGAAACCATCAGATTAAGCACGACTGTTTCATTTGGAGTTTGAAAAGCTA
GCCTCAGAACCTGGTTATAATCAGGATTTTTCGGCCATCTTTGTGTGTAGGAGAACTTGT
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TGAATAAACTATTTAAACATCCTTTGGTGATAGTAGGAAGCCCATCATAATAAACTCAGT
GCGCTCAGAATTTGCCGGGCATGGCTCTGGGAACAGGTGCAGATTGAAGTAGAATTGCCT
TAAGGCTCTGCTTGGATCGTCGTTTCCGTTTCAAATACGCGTGTAAAAGATACAGACCTC
GGGCTGTCGTTTTGTTTTCAGCTGGAGATTGTTCAGCGACCAGTAAAATGCAAGTGTAAA
CTAAATACCCCCGTATTGAAATACGACCATCCAAGCGCGGCCTATAAGGGATTTTACCTG
TTGTAGTTCCACCCATCAGGTTTATGCGAAAATAATTTCAGTTTTTCCTCTAGAAAACTG
GTTTATGTGATAATAATTTCAGTTTTTCCTCTAGAAAACTGGATTATCTCATATATAATC
CCACACATCAGGTTTATATACTTCTTTGGGGTGCCTTGTCTGGCTTTCCTATATTATTTG
TTCCATCAAATGCTGTTTATTTTGTGAACGTTTTTGTCGCTCGGCTACTTCATGGTCAGT
AATTAACCGGTGAAACTTTGATTGGCTTTATATTGTTTGCCTTCCCGTTTCTGACGTTCT
GTTGTATTTTCCATTATAGGCCATCGGTCTGAAGTTTCACGTTCCTGAAGAATATTTCGG
TCCCTAGGCGTTCATTGTGAGCAGCTATGCCAGGTGGTGAATAAGATGGTTTACTGATTG
CCATAGTTTGGTGCCTCATGTTCGGAACCTAAGAATGGCATGGTTATTCTGACATGGAAA
TCTAGCACAAGATTGGTGTTTAAACTTGCTGTAGTCCCCTGATTCACTGTTTACGGGCAG
TTTCTATCTTAGAGTATTTTGGGGCCGATGGTTTTCAGTTCATGTTAGTACAGAGACACT
CCTGGCTTCTGAACGAGGATTCCATGTATCATGCCTGTTCCCCTATGATCAATGATGTCT
TACTGTGGGACATGAATCAATGTACTGGGGCGGGTAACTGTTGGGATCTGAGTCAATGCC
ATACCGGGACTTGCCGATCACTGGTTACAAGCCTTAATGATTCTGTCGCTAGCGAGACCA
TCGTTTGATCAGAGTAGGATCGATAGATATTGCGATAATTAGTTCATAGCAAAATGAAGT
AGCATGGATGTCGTTTCCTGGTAATTGGGCATTTGGAAATTGGAATCATGCTTGCTTGTA
CAAGGTCGATTAGAGTCTTGTCCCTCGCAGGGCTGTTGAGGTTACTCATGCACTTGCACG
GGTTGCTGCTGGTAGTGTAGTCCGTTTGGATCGTTGATGCAACGTCTTATATTTCTGAGC
AATTACTGTTGGATTGTAAAGACATTACCATTGCTTAATGATAGCTCTGTTAATCCGCAA
ACAAAGAAAAGTAAAGAAAACCAAGCCGTAGAATCAATCACCCTATCAGTCAGCAGACGG
TAGAATCAATCACACTATTAGTCAGCAGAGGCAACATGATGCGCCAAATTCTTCATTTCT
GTCCCCCAGAGACGTATAATTGTCACAGGTGTCGAATGCGCGCGAGAGAGGATTAGATTC
AACGCATTTGATTAAGCTTTAGGCTGTGTGTATATATACAGTTGATGAGCGAGGAGCTGA
TCATGCATGCGCCACTACCTGCCTCCACTAGCCCACGTCCAGGCACTACTCTAGTCTCCA
CTACTCCACGACATGGGCCACGATTGGTGCTATACAGAGCGCATGCGATAATAGCCTATG
CAACCTGTGGCCTAACAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCTCGTCCCGCCGCCTCCCT
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTCCCCCCCCCCT
CCCTCTCCCTCTCCCTTTCCCCCTCCCTCTCCCT