Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_169809 (2632 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_169809

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_25528 4 294 bp AK356234 Available Available None
MLOC_25530 2 981 bp MLOC_25530.2 Available Available None
MLOC_25529 1 590 bp MLOC_25529.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_25528






CDS Structure of MLOC_25530






CDS Structure of MLOC_25529






Contig Sequence (2632 bp)

>contig_169809 2632 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACATGTTGAAATGTTTGTTCTGTCTACGAATTTCAGTACACAGGTACACTTTCCGCGGAC
CAATTCATCTTCTCTTACCTGCAGATGAGGATGCAGTTGTGAGTTTTAATCATGGCTTTG
CTCCGGCAGATGGACCTTACCGGCGTCACTGATGTGCTGTGGAAGAGGTTCTTCCAGCGG
GAATTCGGTGAGGCTGACATGAACGTTGCCATCAAGAGAATGAAGGAGAGCGGAGTGCGT
TACAAGTGGAAGAAACTCTTCGAGGTAATTGTAACGATTGATTCTCTAGTTATTGTTCTG
TTCTTGCTATCTGCTTCGTTAAAATTAATTATGTATGTTGCCTTGATTCTTGAACAATTG
GATCCTGTACCTTTGCAGGCAAAAACAGAAAAGCAAAAGCAAGTTGAACAAAGAATGTCC
GCGGGACTCAGAAACAAATATGAAGCAGCAAACTGTAACTTACCAAGTTTTGTATTCTAT
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CCAAGTTTTATATTCTATAGCTGCAACCTGTAGCAACTTAATAACTGCAACTTATATAAA
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CGTTGTGTTAATTAACAAGCGCAGTTCCAAGTTGCAATATTCCTAATACTTCATGCTGTT
TAATAAGACATTTAACATTCAGTGCCATATAGTAATTCAAATGACTGATGTTTTGTTGTT
CCTATTTTCATCAGCTACATTGTAATTCAAATGTCTGATGTTTCATGTTTTGTTGTTCCT
ATTTTCTACTGCATCCAGATATAGGGATCACGAAATATTTTCAACTTGACAAACAGCAAA
CACACAGCTCAGAGTTAAGATCTGTAATACAGAAGATTTGATATCCTGTAGGTACACACC
CTCTAGCTGCATGCTTACTTCACCTGCATGTAGTTGTGCATTTGATATTCCAGAAACAGT
CATTAGTGTTCTGTAATTGGATTTAACGATCCTTGCATTCAGCGGTGCTCATGTTGCAAA
TTCAACCTAACAATCGACGGCTTGTTTTCAAAGTGATGTCAACCACAGTTTAGAGTGTAT
TAAAATATGGTTATTTTCTGTTTTTATGTCACAGTAATTTAAATTCTGAAAATTTAGTTT
TACACTCGATGTCAACCACAATTTACAATGGAGTGAACTATGGATTTATTGTTGTATGTC
ACAGTAATTTAAATTCTGAAAAGTTATTTTTTATAGTGGATGTCTACCAGAATTTATAGT
GTTCTACAGTATGTTGAACCACAATTTACAGTTTTTAAAATTATGGATTTTCTGTTTTAT
GTCACAGTAATTTAAATTCTGAAAAGTTGTTTTTGCGGTGACAATGTGAGGGGTTTACAG
TGGTTAAGTAGATGGAATTACTCAGTTTTTATAGTTTTCTAGTTCAATCATACAGTTATA
TATGTGCCAAGCTTTTCCTTTTTACAGTGCTCCATTGTCCAAGTTTACAGTAATTTTAAC
AATTTTTACAGCGAATATTTTCTTCATTTACAGTAACAACGTTCTTGAGTTTGCAGTGAT
TATATGTTGTTCCAAACTGGAAGTACATTTTCCGTAGGTGTATTATGCTTGATCTTTTTG
TTCCGGTTAGTAGATAGCCTCTTTCCCGCAAAAAGAAGTAGATAGCCGCTTTCTAGAGTT
TAGTTTGAATGTTCTTTTGTTAGCTACTAAGATAACTAGCCCTTTTTCGAACTTGGAATG
TCTGTGTATTTCTGTTTTGGCCGAATGTGCAAGTAAGAACCCCAGCAACCCATCAACCCA
TTCAACTACTTGGCTTAAATTAGTTTCTGCACATTATGATCTGATTTTCTTTTGTTCCTA
TGATCTGTCACTCTGTGAACCTTTGTAATTTGCGCCTATGTTCTGTTACAATGCCTGATG
ATGTTCAGAAAGAGCCATCTAATGCTCGCAACAACATCAAGTAGATCTAACCCTTGGATC
AATTCATCTATTTTTGTAGGGACATGATCTTGCGGAAGATGGGCGACCATGCTTTGCTGC
CACAAGTCTCCTTCACACAGTGCCGCCGGCAAACATGTCATACAGCATTTGTCGATCAAA
CATGTGTTAGATGATGGAAAAGATCACACATGGCATTTGATTTCAAGTAATGATGTTAGA
AATTTCACGGTGATGACCAGATCTTAAGGTTCCACGGTGATGATGGAAAGAT