Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_167348 (2295 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_167348

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_25143 1 449 bp MLOC_25143.1 Available Available None
MLOC_25142 2 1413 bp AK361539 Available Available None





CDS Structure of MLOC_25143






CDS Structure of MLOC_25142






Contig Sequence (2295 bp)

>contig_167348 2295 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCGCCCCGCCCTCTTCGTGGCCGCCGGCAGCGCTCCCTCGTCGCGCTCGCTGCCCCG
TCCACCATTCGCCTCCCGCGCAGCCCTGCCTCTCCTCTACCCAGCGCCGCCAACTCCGGC
CCACCCCCAAGCACCATCCGCCCCTGAACTTTGCCCCCGACGTCATCCGCAGGCTTCAGC
TCCACCACCAGAGCTCAAGCGCCCCCAATCAGCCGCTCCCTCCCCGATGTCGGACCTCAC
CGTCCACATCCTGCTGCCATCGGCGGTTGACCGTCCCTTGTTCCGCAACCTGAACGGAAA
CAAGTGAAGCTGTGTAAGTTGTGTCGTTCGATCATTATTAGGCTGCCGGATACTTAACTA
GTTATGTGTGTTAAATTAGCTACTACTCTGTTTTGTTGTTCTGGAACCTAACCCGAGACA
TACATTTATATTTATGACTAGGGAAAGATTGATGCGAAGATACATTTCTTACCTGTGCTT
CAGTTTGATACTGTACTGCTGCTGATAATTCTTAATTGGCAAGTTCATGATAATCACAGA
TTGAAACGATGCTACTTTAGTGAGCAAAGCTATATCCGTTTCTCTTGGGAGAAATGGCTT
ATTTCTAGACACTTCTGTTTTGGGAGGATACAGACCACACCACTAGAATATCTTTAGAGG
CTTCGAGAGCTACAGATGGGGAGGACACAACTTACATATTTCATATTTTAGTTAGAGCCA
CCTACCAAACATGCGAGGAGGCCTGATTGCCAAATCCAGATATGCTGGTGCTTTCAATCC
TAGGTAAAATTCTGTTAATTAGCGCTGCACTTTTACAGTGGTGACTGTAAATACTTGTAC
TAGTAGTTACAGTCTTCGTTTAATTCATGAATGGCTGGTTGAGGACCAATCCGCATAGCT
CACTTTTGTTACCAGCTGCAGTGGTTGATAGATTTTTACCAGTACTCCAGTAGCAACGTG
AATGCTGACCCTGTTAATCAGAATTCAGAAACACATGTAATTGTAGCTCAAATCATGCTG
CAATGTTCAGTTAATCCTTATGGTGAAATTTCATGCGGTGGAATGGCAGCCGAATGCTTT
CTGCCATGATATCATCTGATCTTGTTCTTGCCACGCATCGAAATGTGGTCATATCTTGAC
TTATGTTTAATTCGACTCGTCCACCTGACACAGGATGATTGGCGAGATTGGGTCAAAGCA
CACTGTGTTTATACCCGACATGATGCCCTCTCTGTTGGATCTTCTGAATGATGAGATGCC
CGCGGTCGCGAGACAGGCTGTTAAAACGGGAACAAACTTATTTGCCAAAGTACTGCAAGA
GCTCGTTGTCCAGGTAATGCTAACAGCAGCACCTACAAGATTTGCCTGTGTGTAGACTTT
GCCTCATATTGCTGTCTGTTGGTCCTAAATCCAGGGTTCATCTGGTCCTCCGATGACAGG
CTGCTGTCTGAATCTAGACACCTGGCCCTTCGTCCGTCCGTCTGTTCGTCCGCGTCATTA
CTACCCTGAACCCTTTAGAGTTTTAGTTGCTTGTTATTGGTAACTGTTGTTGCGCTCAAG
ATGTCCTGTTTTGGTGTTGCCCATGAAGACTTTGTTTTAAGTGTGGATCTATATGAGATG
TTATGTTTCATCTGCTGATTCCTGTCAATAATAGATCTTGTTTGAATTTTGTTCAGCGTT
ATTACCTCCTGAGATATGTTGTCCATTGTGTTCTAATATTATTGTTGAATGGTTTATATA
TAGTCTTGGGTGGTAAACTATACCGCATCTCAGTGTAATGATTATTTAGCTCTGTTGTTC
AGGTTATTCTACTATAGCCTCGTTTAGAAGTGCAGTTAAGAATTTCCATGATTGTTATTG
TTGGACTGTTCGACAGTATAATCGTAGCTACTTCATGCTATCCCTTTTGTAACAGTAAGA
ACTGGCATTGTTTTACATGATATTTTGTGCTATAGGATGCTATAATACATTGCCTATTGG
GGAGTACCCTTGCGATGTCTTTATTTTAGTTCCATGTGTGTCCTTGTATAAATGTACCTT
TGTTGGCTTACATTGTTAATCCATCAGTTGTGTCCTCAGTGTCATTGTAATGTGTTGTCT
TTGATTGGTCTCCTGGGTGTTAATTTATATTTGGGAATATACCTCTGTGGGATGGACGGG
ACGTCGATCCGTTGGTATTCCAAATGTGTAGGAGATGTTTGTGCTTTGCGCGAGATAATC
ATGGTTGGTAGATTCGGGCATGAAATTAGATGCTTGTTTTGGCCTGTGCCTTCTCCCTGT
TTCGAGTTCATGACG