Map Locations of contig_1639615 (2600 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1639615

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_24208 8 1459 bp AK357357 Available Available None





CDS Structure of MLOC_24208






Contig Sequence (2600 bp)

>contig_1639615 2600 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACAGAGAGATGCGCAAAGCACGGGTGGCAGAGTGGGAGCCGCGAGGAGAGGTGGGGCCCC
CACCGCGGTGTCGCCCGGAACAGCGACGCGGGGCGGCGGGGCCGCCGCAACCAAGACGCT
CGCGGCCGCCGCCGCGGCCCCCCGCGGGAGCCGCTCTCGTCGTCGTCGTCGGACTCCGCC
GGCCAAAGCCGTGGCTGGCCCCTCGACTTCCCGTTCCAGCAGGCCGTGACCGCCGCCTGT
CTCACCCTCACCGGCGACACGATTGCGCAGGTCCACCGCCGCATCGTCGACCGCCGAAGC
CGCGGTCCCGAACCCGACAGCAAGGTCGATCCTCTGTTCTGCATCTCATTTCTCTTTTGG
AAGCCCTAACTGGATTGTGATAGAGTTCTCTGAGCATTTTGGCAAGTGAAACATCAAGCA
GTTGCTGCCTCGATGCAATTCTACATAGATGTCACATTCAACCTCACTGTATTATCAAAC
TGTAAAGTCTAAATCTGTACTTGCATAATCCTGCAACCTGCACCACTATGCCACAGTTAG
CTAATCTCACAATGCACTGTGATCTTGGATGCTTTGATGAGTGTAAACTACACTTTACGA
TCGTGCTGAGTTCTAGCACTTGCTGGTGTCCTACTTTCAGGCTATTATACCGGATCTATT
GATGAACCATGATTGGCTCCGTGGGCTTCGTATAGCATCTTACGGATTTCTTCTCTACGG
TCCTGGCTCATATGCATGGTATCAGTTTCTCGACAGATGTATGCCCCAGCCGACACTTGC
GACTCTGTCCGCTAAGGTATGGTATGCACCCTCCCATGTAACCGGATTATTCGGGGATTT
CGATCTTAACACATTCTATATTTTTATGTCTGTTGTCGTTCCAGGTCCTACTGAACCAGA
TTGTTCTTGGTCCATGTGTTATCTCTGTAATTTTTGCCTGGAATAACTTGTGGTTAGGAA
AATTGTCGGAATTGCCATCTAAGTATCAGAATGACGCCCTCCCCACTCTTCTCGATGGTA
CTGTTTCCGCCTGAGCGTATTCTTAACGTTGTGCTTGAACAAAAACAATTCATGTTATGG
TATGTCTCTCTTTATTCTGGTATATTGCAGGGTTCAAATTTTGGATCCCAGTATCGATTG
TAAACTTTGGGTACAGTTCCTTAACTTCTAACTCTACCTCTAAATATTTAGCTCAGCATT
TTTGTAATCCTAGTCTTGGTAGTATTAAGTTTTCTAGTTTAGTCGGTACTCTACTTCATG
TAAACAGCCGTTTCTTATGCTAATTTTCAATATGCATACCAGGATGATTCCTTTGCCTGC
TCGTGTTGCCTTCATGTCCTCTTGTTCCATCTTTTGGAACTTCTATTTGTCGACCACAAT
GAACAAATGAGCCTCTAGTTCTCATCTTCAGGTCAGTTCTTGTAGTTCCCATCTTCAGGT
TAGTTCTTGCTACAACTCAGAATCTCTGATGATTACTCTATGCGCGGGTACATTTTGACA
AAAGAGTCTTATTGTTCAGATCTATTCAACTGCAACAGAGGAGGATCTGAAAGGGCTTCT
TTCCTATTATATGTAGTATGGCGGTGGTGCCTTGGGCAATTCCGGCGGTGGTCTCTTGAG
TTGGCAGGCATTATTGCAGATGATCCATAAAGTATGTGGATCCGGTCTGGAGAAATTACA
GTTTTGTCTAAACATCTATGAGCATGTAGCTCTAGTTTGACAGTGCAAGTGTTGTAATTT
GTATCATTTGTTCAGTGACCTTCAGTTATATGACAAAGACATTAGTGCCGGCCTCTGAAT
ACAGTTTTGTAAGTGCAATTCTCCAGGAATATGAATTCTATTTCTGAAAATTAAACTTCA
ATGTGCGAGTTTCAGCATCTTTAATGCTCCCTCCTTTCCGGTTTATAGGACTCATCTTAA
AAATTTCCGATTTTCAATATATTAGACTCATTTTGAGTCTAAATGAGTTAAAATGCTTTG
AGTCTCACGCCATATTTAATTTATAAAGATAAGACAAAAAAAGGCTATGCATGCATCTTT
TCTGCATGCACCATGCAAGTTCAATCGTATTTGTAAAAAATATTTCATTGACTACTTAAA
ATTAGTGCCATCCACTCACAATTCAACTTGATTGATGAGATCTCAGATTTGAGCTTATGT
AGCATTGTTTCCCTTTTTGCAGTTAATACTTATCTTGACATGGTTCACTAATCATTAACT
GTTTCTTAAGCAAAGATACTTCCTCCGTCATAGTTTAGAAGGCATGGTCAAATTTACGTG
CATTTTCATAATAAACAAGGTTTAAGGCACATTGCATTTACTCTTAACAGCTAATTAGTA
CTTCGTTGTACTATTTTTATAGAAAGTGTCTAGAACTCAGCTAGCTGAGACTTTCTATGG
TCTCATTCACATAATATTATTGTATTTTGTATTTATCCTTTTTGTTTCCTTTAGCACATC
ATTTTATTTTTTGGGCTCGCATGTCATATTTTTAGTTGTTGTTGCTATATGCCTCATCTA
ACCGGTTCAATAACTACTCATTCGATTCTTGTTGTTGCACGTTGCATCTTTTAAAAAAGA
AATCGTCGATAGAGAAAAAA