Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_163317 (2596 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_163317

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_23962 1 339 bp MLOC_23962.1 Available Available None
MLOC_23961 1 424 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_23962






CDS Structure of MLOC_23961






Contig Sequence (2596 bp)

>contig_163317 2596 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGGCGGATACCACGGACACCACTGAGTCCGATCTACAACCGACCTGCCCAGTGCTGAA
ATCTCATCACCGAGTTTGTGGTCTCTGTGACAGTGAGTGATCGACGTTGGTATTTATGAT
CAGTTTGCATGATGTGCGCGTGTGTGTCAAGCGAGTGTGGGGGGTGTGGTTGGTGTGTTG
CTTTATCAAGATTTTGTAACTTCGGTGTGTTTTCTCGTACAAGAGATATTTATGAATCAA
ATAAGTTAATGAAGTGCATTTGTCAACCGAAGTACGGTAGTAACTGTTCTGAGACATTGA
CATGATAAAGGCAATGTAATTTATTTATTTATTTTGCGGGAGATGGACAATTTGATTTTA
CCAATACTTCCGGCCAATTTTCAGATCCGTCAACTGACACTGAAGAGAAATTCAGGCAAG
TGGGCAATGGATTTGTCATGGCAATCCATGGCATTACATTCTCCAACAGCTAAAGGCAGG
ACGCACGATGGGCTATGCCGCATAGGCAGAAGGGGCTGGTGAGGGCATTATTTTTTAAGA
TTAGCTAGAATTAATCTAGCTGAAACATAATACTCCAATTATGGTCTCATTCACCTCACC
GTCATCCTTGTTGTAACCCCGTTTGTTTTTGTTTTTGTGCTGGCCTAATGCTTTTCTTGT
CCTTTTTTAGCCTAGTTCCATTTTGTGTTGTGCCGTAAGAGGCTTGAGTAGGCTGGCCTA
TTCGTTATTATTGCGATGCTAAATAAGAATATAACTACTAGTTGTGTGTAGTGACGAGGA
AACTAGGTGGAAACTTGTGTTAATTTCCTTTTGTTCCATTACGCTATAATACTTTGGCAA
TAATGGTGCCGCAAGTATAATAATAAAGCTATGCGAATTTCATGTTGCTCTATTTCCACA
TAGACCATGTCATTTTCTATTTTGAAAACTGTTTGGTCATTTAAAAATGTTCATATATTC
AAAGAATATTCATCAAATATGAAAATTGTTTGTGAATTAAAAAATGATTTTAAAAAATGC
TAGAGAACTTTAAAACTATAAATGTTAAAAAAAATCATGGAATTTTAAAAGTCATGAATT
TGGCGAAAAATAAAAATTTCTAAAATCGTACGAAGCCTCTTTTTTGAAAATACTCATGAT
TTTTTTCTAAAATAAAACGAAAACGAAAAAATAAAATAAAAATAAAAAATATTAAAACAA
TGCAGTTGCGACCCCTCTTGAAAGCATGTAGTTGCACCCCCTTGAAATACATGCAGTTAT
GACATGGCTTAAAAATATGTGTTGTGACCCTATTTAAAAACTTACCGTTGAAACCCCTCT
TGAAACACATGCATTTGTAATCCCGTCTTGAAAACATGCAATCGCGACCTTTGTTGAAAT
ATGCATTTGTGACCCGTTTTGAAAACATGGAGTTGTGACCAACCTTGAAAAACATGTAGT
TTCGACCCATCTTAAAATGCACTACTTGGTCGAGATAAACACAGCCAACACCAACACATA
CACAATGAAATCACGCCATACAAAGTCATCCAAGACTGAAGCTCTATCAATTAGAAAGTC
ATCCAAGACCGAGGTGGAGGAAAAGAAAACAAAAACTCTGAAGCGATTGATGAATTACGA
CAACAATAATACATACCAACCATATCTTGACATCACAAGGACCATGAGAAATAGTCTCCA
ACAACAACATCTAGGAAGAAAATGACGTGCGGGCACCGTTGTTGTTGGATCCGACTATCG
AAGGCCATACCATGGGGTTTCACCCTAAAGATCAGGCCCGAGTAAACCCCACAAGCCATG
CAATCAAGAACGAAACACAACCATGGCCAGGCATGACCAATTAGGGTGAGACATAGGGTT
GTCAGCCGGAGCTTGAGACCCGGTTCTTGAGAAATACCACCAAATCAAAGTTATAATATG
ATGCCGCCTCCAATTTCCATGATCTTGGTAGGTAAATGCATGCACGATCAACACGTGATA
TGTGACGAAGATGTGGGGTGTGTCCAGTGATTTGGGATTTGGGATGTCGTAAACATATTA
TATTATTTCTTCTCTGTATATCAAATAATTTACTAGAAACCGCTATCAAGATATTTTTGA
GATTTAATGAAACACACAAAGATACATATATTATGTCCATGTGAGTGTCACAAATTAATA
TGCAAAAGCATGCAATGTTATGTATTCTTATTTTCTCATGGTTACGGGAATGAGTTTAAA
TAATAGTTTACGACGCAATCTATTGAATAGAAATAAACTAATCAAGTTTAGCATAGGACA
TGCACATTTTCCAATGAGAGACTTAGAACTTAGCATAAAATACTATTATTTATATTGAGA
ATAATTATCATAACTAAATATAAAAAATAACTAATAACTAAAACTAACCGTTTTGTAATA
GTGACTTATAAACATGTATAAAAGTTTAATATAAATATTTAGTTTATTTAGACTTGATAT
GTGTCTACATAAGGGTGGGAAAAAAAGGATACACTATAAGAAATATGCTAATACACGACG
TTATTTTTTCGTCGCTAGCAGATTCTCACATATGTTAACTGTGTCCTTTGTCTTTCCTTC
AATATTCAGAAATGTC