Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1619138 (2300 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1619138

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_23200 2 801 bp AK359461 Available Available None





CDS Structure of MLOC_23200






Contig Sequence (2300 bp)

>contig_1619138 2300 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGAAGCAGCAGCGGCGGCAGCAATGGTGAAGGGACGCACGGGGCAGCGAGTCAGGCTCTA
CGTCAGGGGCACCATCCTCGGCTTCAAGAGGTGAGCGGCCCCTTCCCCCCGCCGGATCTG
GCCCTTCATTTCATGGGCGGCGCGCTGACGGCGGCGTTGATGGCGTGCAGGTCCAAGTCG
AACCAGTACGAGAACACGTCGCTGGTGCAGATCGAGGGGGTGAACACCAAGGAGGACGTG
GCGTGGTACGGCGGCAAGCGCCCGGCGGACGTGTACAAGGCCAAGACCAAGAGCAACGGC
ACCCACTACCGCTGCCTCTGGGGCAAGATCACCCGCCCGCACGGCAACTCCGGCGTCGTC
CGCGCCCAGTTCAAGTCCAACCTCCCCGCCGAGTCCATGGTCAGTGGCCCGGCACTGCCC
TTCATCGTGCTGAAGATGCTCCCCTTGTTTTTCGTCGTGCTTTTTGCTGATGCTGTTTGT
TGCTTTTGCCTTGTGTGCAGGGGCGCAAGGTCAGGGTGTTCATGTACCCGAGCAGCATCT
AAGGTTAGCGCCTGCTGCACTGTCGATGATGTTTGTTTAAGTCTGTTGCTTTGCCCCGTG
TGATTCTACTCTAGCATGCGTGTTACATTTTGTCCTTCGCCTTGAGAATTACTAGGATGG
ATGTGATAGATTTCCATGTGTAGTCACAATGTATAACATGAATGCCTGAAGTGTATGAAC
TTGTGCAATGTGTGTCCATCGAGAGATTGATGCTTTGGGTTGGGTCATTCATTGTGTTGA
TTTGGGATTCTGTGATCTTGCCCTTTTAATCCCTGAAAGATGCATATTGTCATTATGAGT
TATCAATTGATATTTTAGTATCGTGCTCATGGGAAGTTTTATAGATGTTGAGGATTATGC
CGCTTGTCAATTTTCAAGGCTCACAACTTAATTGTATGAGAAGTGGGGAATACAGTTACG
TCAAACTTTCTGTTTTTTCTGGAAAATAGTCTGATTTCGCTTTGGTGGTTTTAGTGTATA
CCTCAAGGTGATGTTTATTTCGCTTTTGTGAATCGTTAGCAAGCAGGTATCATTATTGAT
GTTATGATCGAGTTGCATAATTAAGACTAGAAGTCATCTATTTTACATCATTAAGTTCTA
GGTCAATTATTTCACTGGAATGTCATTCCTTATTTTCAGTAACATAAAGTCGCCATAACT
TCAGAAATGAGATACTGGCTTGTGTTCCAGCTGTGTTTGACACATCCATTTGGTTGGCTA
TGCTAATGTTGCTTCTCCTTCTGTTTTGTTCAATGCAGGTTAATTCGAGCTAGGGCCAGT
AATGCTTGTTTCTTGCGATTGTCATGAGCTGAGAAATGTCATTTTATGGTGAATCGAATC
TATGTTGGTGACTGAAATTGTTCATGTATTCGGAGAACCTGTGGAAGTTTTGGCTAGACT
TGTTTGTCAAATGTGCGGACCATTTTAGTATTTCTATATCAGCACTAAAGCGTAATCTCA
TGAGTTCTTGACTGTTTTGCAATGTTTGTGACTTTGTGTGTTATCTCAGATGTTCTGTGC
TGTTTGATGCTTATGATAATATGTTGAAGAAGATGCATCCGCAGGTAAAGTGGTGATCCA
AAATCCTGATGCCAGCATAAATGTTACATGTTCCTGCTCTATTTCATTCAGCTGCATTGT
GGAATTTGGTGCCCCAGATCAGTCTATGGATTGGGAAAGGGCAGCATCTCTGATACTAAT
AGGGATAGTTGTCAAACTTGTTGCAACCTAGCTCGGTGAACCGGATGTGCCTTGCCTTGC
ATACCATACCCTCAAGGACCCTGACATAGTGTTCATATACATGGATATTACATGAGGATG
AAATGGTGTTTATATACTAGGATGTTACAAAAGCAGGTGCTTAGGTGCCTATTGGATGAG
CATGCGTTGATAAAAAATTACATGTTTGGTCCTTGAAGTCAACACTACAATATGATGGTA
CGTAAATACTCTATGGTATCCAATTGAAGCATCGATACAATGCGTGTAGGTGTCCAATTG
TACATGTATGAGAGGAAGTCGCTCTTAGTTCTGTGATTAATTAGGCGCTTTTACAGCATT
GTCGGTTCGGTTTTTTCTATCAATAGAAAAACATCTATGTCCGAGAGCCCTGTTAGATAC
GTCCAATATACTGTGATGGAGGAGAATGACGTTTTGGAGGCTGAGCTCTGTAGAGGCCTT
TATTTTTGAAAAATTCAAATTCAAATTTTTATGGTTCAAAAAATTCTGAAAAAAAATGCA
TGTATGTAAGGATGTAACCG