Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_161869 (2361 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_161869

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_23172 1 206 bp MLOC_23172.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_23172






Contig Sequence (2361 bp)

>contig_161869 2361 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTATCTATGCTACCAGGGGCCAGTGAAGGAGTGCACTTTTCTTTTTTCCTTTTTCTATGT
TGATCCTCTGTTTGCATGCTAGTATGCCACTCGGAATGGTCAGGTTGTTATCTAGCTGCA
TCACATATGATGAATCGGCTGGTACTATGCAATGAAGTCAAATTTTTGCTTGCATTCTGG
TAATATGTTTGTTCTTGTTGCTGTTGATGTTCATGTGTTTTGTCTGTGAAGTTCTGTGCC
ATGATGATTGCTGGATGTTTTGCTGTCACTTGTCAGGGCAAGCATTAAGGGTATATGGGG
ATTTCCTGTTGGTGTTGTTTTATCATGTCGGCTTGCATGATGGACCTTGAGCTGGTAGGA
TGTTACAGTTGTTACTTGACCAGTACTGGGTGTGTTAAGTAGGCACGATTCTTTGTTATA
GACTTCTTCCAGTGCTCACTTATAACTAAACATAGAGTTGTGTTCTCATTTTGAATCTGC
TACTTTTTGCATTGGCACTACCTTTGCATCATGAGCAAATGTTTTTGAGTCCTGCGCCGA
TAGCACTAGGACACAATGATTGCTTTCCAGTTTCCACAGAAATACAGTAGTGATGATATA
TCGATAATATAGCACTGGGACACAAGTACTGTTTTAGCTGTCCTGCATTTGCTCATGTAT
GTACAGAAATACAAAGAAAGGGCCTTTCTCAACCACATGGAAACACTATGAAGAGGGCCA
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GGGTATTGATTGAGTGTTGATCATTCATACAGGTTGGAGGATAATTCAAGCGAAGACAAT
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GGTTGCGTTGTGATAATTTACTCAGAGTACAACAACAACAACAACAACAACAAAGTCTTT
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TGGTTCTGACACACAAGCTTCCACGCACCCCTATAGCAAAGAAAAAGAAGACAAATTCAA
GAAAAAGAAGACAAATTCTGAAGCTGGGAAAGAAAACAGATTATCTTGAAATAAAAATTA
TTATGTGCTTGCTATATTGCTAAACAATGATTTGTCAATTAATAACAGTTTACAGCTTGC
TTGTTCTGTGCTTACTATGTTGCTAATATTATTCTAGGGGAATTTGAGGATTCGCCACAC
CTTTTTGCACTTTGAGGATTTGCCCCCGTTAACCCTGTAACTGAGTATAAGCCACCTTTT
ATTGCACTTTGAGGATTTGCCCCCGTTAACCCTGTAACTGAGTATAAGCCACGTATTTGC
TGTAATCTTGAGGATTTGCCCCTGACGAGATCGGACCACAGCAAAATGACCATCATGCTC
TCATGTTGATCTACGTGAGCAGCAGCCAGCCCTGATCGCTCTATCCCACATATCACGCTC
GTCTGATTCGACTTGAGCGGCAGTGACGAAGGCGACCTCGATCTCGACGGCGGCTGCGGC
GGCGGCTGCTGCCTGGTAAGATGTGTCACTATATTTTGTTCCTTTGACCACCACCTGCTC
CCCTAGGGTCGTTGTTTCTCTGATGCAACATGTCGTCCACCTTTTGCCTTAGTATGAATC
TGAACCAACTCCCCCTTTTGCCTTAGTATGAGTCTGAACCAACTCCCGGATTATCCTCAA
AACATAGTTGATCAACAAACTCCAAAAAATAAATAAACATCTCCAGATTTTCTGCAAATT
CAGAGTCATGCCATCATCTGCCACTTGATTGTTAATCTTAAGAAACCTGAAGATAAAATA
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ACAACCTAACCGTGAACTTAAAAAAATTCACTGTAGGGCGAAGCAGCCTGTTCATGTTAA
CGCTAAAGTTAGAGTTCTTCCATATTGGGCCATGCTTGCTGATGGCGCTGAGGAACAAAT
GGAGCGGCAGGATATTGAAATGCAGATTAGATGGAAGGGGCTCACTTTAAAAAAAATGCG
TATGACTTGAGCCAATACATACCATGGGGGCCATGGCAGGAGGTGCATCTGTTTGGCTTA
TGATAAGGATTCTTGATGAGGAATGCAAGATTGGTTACCACTAAGCAATTGAGAAGCCAT
TTGGTTGACCATAAGTGGGGG