Map Locations of contig_161395 (3709 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_161395

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_22914 1 1638 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_22914






Contig Sequence (3709 bp)

>contig_161395 3709 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGAGGAGAGGAAGGAGTATGAGAGAAGGAAGAAAAGAGGTGGGGGGGGGGGGGGGG
GGGGGGCGGGGGGGGGGGGGAAGAGACCTTGAAGAGCTCGAAGAGGGCTTTCTCACGCAG
TTCTGGGTCGCAGATGTCGATCGCGAGCTGCTCTGCAGACACCATATTCCAGTCCCTCCC
GTCGACGGCCGGCACCGCGGTCGACCACCCGGGTGGAGGCAGGAACGGGGGCGGGGAGGG
TGCATCAAAGGAGGGGGTGGTGGCGAGGGACGGCGACAGATTCGCCATTGAGGAGAGGAG
GGTGTAGTGGTGTGAGGGAGAAAAAACCGATAAGGTGGTCACGAGGAGGAGAAGCGGCTC
TGCCCCTAAAGGGCCAGGTTATATTAGCAACAGTATGCTACGAGGAGGGGCGACACATGG
GATCGACAGTTGTTTCCCAACTTTGCTACTTTGTCCTTAAATGGATGAAATATTTTTTCA
ACCATCTTTTTAATGCCTTGCTATGGTATCACACACATCCTAAAAGCTGACATAGCAGTC
ACGACATGTTCGGTTGGACTAGCCGGTGGATCTATTTTACTAGCCGTCCTTTCTAATGCC
TTGCAATGGTATCACACGCATCCTAGAAAGCCGTCATGGGAGCCAAGGCATGAATCCGAC
TGGACTCGTGATCCATTTCTCTAGTCGTCCTTTATAATGCCTTGTTATGCTATCACACGC
ATCCTAGAAGTCGGCACGGCAACCAGGGCATGGATCCAGATGGACTTTACGATGGACACT
TTTTCCATTCCTTCTCGCCCACCATCCAGATGGACTTTACGATGGACACTTTTTCCATTC
CTTCTCGCCCACCATCTCCCCACTGAACGCTTTTCCTGTTGTTTTTTCCGATCTTCATTG
ATCTAACATTTCCTGAGAAATGTACCTTCTTTGTGGAGGTCGTTGTATGCCTTCGTTTTG
TGCAGATCTATGTCATGCACGTCGAGTGAGTGCGCGTGTGTCGTGCAAGCGTTCAGGGAC
AAAGACAAAGCTGACATGCGGGTCTCGTTGTCATTGACATAGATAGATAGGAGAGAGAAA
GAGCTCGAGCGCAAGGTTGGGCGTTGGATCAAGATCTGATGGTCGCGATAAAATGGAGGC
GTACAATTTGGCTTAAGTGGTTGGGGTTGTGAGCACTTGCACTACTAGGAAAACCCCTAT
AGGTAACCACTTAGTAGTGGCGCTGCCTATCTGACTAGCGCTACCGCTACTTAGTAGTAG
TGTAGGTTCAAATCATGCGCTACAAGTAAGGCGTAGTAGTAGCATGGGAACAATGGCCCT
GCGCTAGTGCTAAGTGGACACCATCGTGCCACCTCCCCCCTACGGATATGTAGTAGTGGC
ATATAGTCTCTAAGTGTGACTTTGGTAAGTAATGACAATCTATATGATCTATTGCTTCCA
GTGAGATATATTTGAAGGTATAGTACATAGGTGGTGCCTTAAGGATGATTGCCTTAAAGA
TGAAGATTTGCTCTTAAGCTTTGGTATTGAATGACAATTCCTATGGAGCATCAATGGAAT
TGTATATTATATGAACAAATGTTCCATAGTGATGCATGAAGCATGTTCGATTTCTGTGTG
AAGAGTTCCATTAGAAGCCTCTCAAAGAAGTCCTCGTGGTATCCTCTCTGCTTACCCGAT
GCACACGGGGTCGAGGGGTCGTGCCTACGGGGTCTAGTTAAATATCTCTAGACACCTCAT
GAGCACGGGATTCTTGACCCATGTGCACACGAGGTCGAGCGTTAAACTCTCTGGATACCC
CGTGCGCACGGTTTATCTGACCTCGTGCCGACGGGGCCTATGGTTTAACTCTCGTGGTAT
CTTGCCTAGTGAGGATAGTAGTTGGTCTTTGGATGTTTCTAATGAATCCATCAAGTTTGA
TTTCAATGTCTAAATAAATATGTTCAAGGTGGAGTTGATTGGAGGAACTCAAAGGTTGAC
ACATTTGGGCTTATAGGGATTAAGTTCTTGAGAGTATAACTAAAGAGAAGAATTCAAGCT
ATGGTATCAAGAGAAGATCATGATGAGCTCATGTATTGGGTTTTAGTTGATCATGTCTTG
AAGTAAGCAACTAGAGTGAAGAATTTATTGTGCTTCTCAAGAGTTTGTGATGGGGCATTT
AGAAGAGGAATCGATGACCAATATGATGTTCATGGTGAAATTTGATATGGTCATGAAAGA
GTCTTTGGTGATCTAGTCTTGAAGAAATGAAATAAAATGAAGAGGTCATTATGGCTTCTA
AGAAACCAATATAGAGCTTGAAGTAAAGATGTCGGTTGACCAAGATGAAGCTCAAAGATT
GTATCTAGCTAGATAGTCAACACACAAGGGCAAACAATGTACCACGTGGGATGAAGTGAT
CTAGTTGTATGGTAAGTAACTGTGAATTGTGTTTTATGCACTAACCCCTGCTATGTGTTT
GCTATGCCTATGTGGGTTAGGTGTTTCTCATGGGCTTGTATCCACATAAAGATTTCGAGT
GGCCTATGTGAGGATGACATCAAGTGGTGATGGTTATCGAGTTTGGGGAGTCTAAGTGCA
AGATGAGAAGCCGGAGGTTATATGCTTTGAAGCTTGCGGTCCACACCGTGGTTATGTACA
TGTGAAGATGTGCTTAAGAGAAAGCTTCTCATTTTGCAATATGAGAAGCAATTCAAATAT
CTTCACCAAGTGATTGTGGTTAAGAAAAGGATTCCAACTTGAGGCAACCATTAACGTCAT
CAACAAGCTCAAGTGGAATGTGTGAGGCAAAGGTATACCTTAGCTAGGTTTTCCACCCAA
GCATGGATATGATTGCTCATGATGTGGCAGCTCTTAAAAATAAAAACTACATACAGTTGA
CGATATGGCTAGAAATATGGATAGGATTGCTCATGATGTGGAAACTCTTAAAAATAAATA
AAAAATCCACCCTAGCATGATATTAATGAGTCCATTAAATGTATCAAAGTCTATATTAAT
GAAAGCAATGAGAGAAATGCTAGGTTGATAGCTAAACGAGAATTCGTAGTAAAAGCTCTT
CCATCCGGTTTTTAACGTAATCATGATGAAGATATTAAAATTATTGGTGTTTATCCTATT
GAATCTTTATTTACTAATCTTTAAATTCATGATAAAGGGACTGGAGATGAGTCAAATTTA
GCTAGAAGGTGTCCCATTTGTTTGGAGAGTGATGATCTTGATGATAAAAATGGAAAAGGT
TGGTTTGGACAGGTCAAAACTTTAACTAGTGATGTGCCCACTATTTTGGNNNNNNAGGAC
TTTAATTATGAGAGTTGTTCTTTAGTAGAATGTATTTCCTTGTTGCGATCAATAATAATC
TCACCCAATGCTTATGAACAAAATAAAGGTTTTACCAAACATATCATAGAAACGATGATA
AAAGCTCATGAGGTGAAACATTAACTAGAAGTTCCTATACTTAGAAAATTGCATGATGAA
TGTGAACCTACTATTAAAATTAAGCTTAAATAATATGAATGTAATTCTTTGCGTGACCTT
GGTGCTAGTGTTTCAACTATACGTAAAGATTGTTCCCTTAATTTGCATCTTGCGAATTCT
ACCATTAAGATATTGATGTCCCACAAGCGTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNATTTGTTGGTTCGCACGAGGGGAAGCGAAAGAATATT