Map Locations of contig_161306 (7347 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_161306

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_22862 1 3341 bp MLOC_22862.1 Available Available None
MLOC_22860 2 4712 bp MLOC_22860.1 Available Available None
MLOC_22861 2 2073 bp MLOC_22861.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_22862






CDS Structure of MLOC_22860






CDS Structure of MLOC_22861






Contig Sequence (7347 bp)

>contig_161306 7347 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAATAACTGGAATGGCTCCTTATTATAACTCGAACTATTTTACCGGGCAGAAACATTTAT
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GGTTGTTATGTGTGCTGTCTTGATCCCACATCCCGTGTTCCCTTGCTGAACGACACCATA
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ATCTTTGACTATCTCACCAAGATCATAGTCAACTAAATAAATCCAACCCAAACATCAAAA
TACACTGTGAATTTGGTTAAAAGTTCACGATCACCTAACTAAATTCGAATTGTTTCAAAC
TAAATGCAAGGTCAGTTTATCCACCAATATAATAATCACCACGCTCATGTACTAGGCTTA
AGATCTCAAAATCCACCAAACATCTTTGACCATCTTCTCAAGATCATAATAACTTATCTA
AATCCACATAAATCATCATGAAACTCGATTCAATATCGCAATAGCCTAACTAAATTCAAA
TTGTTCAAGATTAATTAATCCATCGAATATCTTTGAGCATCTTCTCAAGATGAAAATCAA
CTGACTAAATTCATCTAGAATCTCATAATCCATCATGAAATTCGGTTCAAGATCACAATC
GCCTGACTAAATCCAATTTTTCTTAAGTTTATTAAAAAAAATACTTACCAATATAATAAC
CACCAAGCTCACCTACTAGACCTAAATTCACATAATCCACCAAACATCTTATACTAACTC
GTCAAGATCACAATCACCTAACTAAATCCAACCAAAAACTTATAATCCATCGTGAAATTT
CATTTAAGATTGCAATCACCTAACTAAATCCAAAATCTTTCAAATACAATTAAAGATATA
CTTAACAACCAACATAATAATCACCAT