| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_1610603
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_22707 |
1 |
776 bp |
AK355795 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_22707
Contig Sequence (3824 bp)
>contig_1610603 3824 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATTACACATGACTTGAGGTGCAAGGAAAGTAAACATAGACTAATAAGTACTCCTAGACT
AATACTAATAGACTAATAAGGACTCCTAGANNAATACTAATACTTCCTAACAAAGATTAC
ATAATGCAGTACCTGATCTACCAATACATTCAGCACAGTGTGGTTCTCTGACTGAATAAC
TGATAGTACTGTAGGGTGCTCTGTTGTAGGAAGTGAACCATCTGGAATGATCAATCTATA
GGAGATCACAGAATTAGAGTTCATAAGAAATAAACAGAAAATGTCGAAAAAGATAGCCTT
TAATCTTACCGCTGTCTAGTGAAATCATACACAATAATTCGAAGGTTATTGTAATACACT
CTACTCGCGCATTCTCGCAAAACTTGTAAATCCTGATGACACGAGACAATAAATGCATCC
AGAAGCCCTCCACATGCACAATCAACTGCGACAGACCAGGACTCGCTAGCAAGTTGCTGC
ATGACAGAAAGCATTATGAAGATTTGGAAGAAGTAACACAGCCATAACTTACATTATAGA
TAAGGCAATACTAGAACCGGCTATAATTTATATCATTCCTTTGCATTATAAAGTAAGTGC
AGTACCCAAACTTCGACAAGGACTACAAGCATAATTATAACAGCTTAGTGGCATCATCCC
TGATAAGACCGTGTAAAGCTTAAATTTGCTTAAATTTCTATTTCCACGGGATAACATAAG
ACAACAAACCTATTTTGCATTCAAGTTATTTGATGCAATGAGAAGACATATGAATACATT
TGCTCTAATGAACTGGAATCAACAGGAAGGATTGAGCAAATTGTTTAATTTCTGAAGGGA
TGAATGAATTGAGTGGGTCAAGAACTCAGGGTGCAAACACCAGTCAACATTGAGGTTGTT
AGAGAGAAGTACACTCTGTAATATGTTTCTTGTATTTCCTTTTTATATTTTCGGATTCCT
AGTTTATCTCCTGTAATTAAGGTCCTAGAGCTTTGGCAATAAATAAAGTTGATATTCCTA
TAGCAAGTTATCAATAGCCGATTAGATTAAGATCTTTTTTTCCATAGTACAAAAAAAGAT
TGTGTTTATATAAAAAAGATCCATGCAATCTTCTGTCCTTTTGGTGCACCTGCACAAACG
GCCAAAACTTTGCACACGATTTTAAGTTTCCATATTCTAATTTGAAGCACATGTATGAAA
ATCTTGGACATTTCCAGACTTTAGTACTTTCCAGAGTCAACACAGGCTCTACAGCAGTTG
AAGATGCTATGAGGAATAGAGGACAGAGCAATATGGATGACCGGTCACAGTAATAAAGTA
GTTGGATGGGTTAGAACTGCATAAGAACCAATACAGCTGCACTAAACGAACACAACCGAC
ATGTAGCTGGGAACAATAGTTAGGCTGCCACCTATAAAGCCATGGATAAACAAACAGATA
GACAAAACGACATGCTACAAACATGTGAGATGGTAACAAAACAAGACTAGGAGAAAGCAA
TATGGGTTGATGAAGTTTTTTTTGTGGGATGGGTTGATGAAGTGTATTACTGAACACAGC
AGATCAGAACAAATGCTAAATGATATAAGTAGCAAATTATCATTTGCAAGTTACTTCACA
AGGTATTATTAGTACATACTCTAGACTCAAGACTAACAATTTCAAGACAAGAATCATGAT
AAATCAGCACTTTCATACCAGATGAGCCCCTATCGGACCAATAGGCGGGCTTTTGAATCT
TCTGTGGTTTGATTCTATTAACTGCAAGAGTTTCAGAACTTTTTGTCCCCCGAATGCCGT
TACCTAAGACGAAGCATTAATTGCATATAAACAAACATGTTAGAGAGAAGTTGCTACTAA
AATCAATTACATCCTGAGAAGCAGGGTTATAATCATAAGGACTATACACTGCTTAGTGGC
TACTGTAAAGAGAGAATATACCGTATTACTTTGACGCTGTTGAAGATCATCCATGTGAGA
TTTCAATTCAAGTATCCTTTTATCACTTTCAGCTATCTGCAGAATAAAATTTAATGGCAT
AAATGGTACAAGACCCGCATGTTTCAATGCAGACAAAAGTTGGCCAACAACACAAGAAAG
CATAGAGGACTTTGTGAAGTTCAAATAGTGCAGATAATTATAAGTGATGTTTTTCAGATA
AATGTTGAAGGAACACTTCTTCAGAGGTACCTAATGCTGAACCAAAGCTCATTCCGAGCT
TGAAATCAGCCCACAGTATTTAAACAGGTAATCGAACTTTGAGCCAGATGTATTTTACCC
CTAACTCTGGATTTTCAGCCTCACTCGGAGTTCTTTAAGTTCAGCAAAAGGGAGAAAAAT
GTGATAAAAGAACAGGATTAGTAGAGTGTCAACTAAGTTCTTTAAGTTACGCATGGACAT
GGTGCTCTTTCATACATTACATGTCATGTGCAAACATATTTGGAATTTTAATGAATCTAA
TCAGAGTTGACTTGTACATGGAAAATGTAAATTTAAGCCTAATTATTACTATGCGTAACC
ACATTCTGCTGCTCTTTTTTCCACATCAAGTATTAGGAATCAGAAAGAAGCAAAACATAC
AAGAAGCAGCAAAAACAATCTCTAAGAATAATGTAATCCAGAATACACATTCTTTAAGTA
TAACATTATAAATAATTACATTATCTAGAAAACATATTCCTGTATCCATACATCAATAGG
GAATGGATGCCACCAAGGAACTATGAAATACAAAAGGTAATATAGTTGTTGCTCGTAAAT
TATTCTCCAAACTGACCAAACAATATCTTAATGGAGATTTAGGTCACACGAAAATGGTAG
AGTACATTCCTCAAGAAATACATCCATAAAACAAAACAAAATATGATTCAATTTACGGTT
TAGGGACCTTCCTTTAGCAAATGTTTCTAGTCCAAAATGTGTCTTACTAGTGACTCGGGT
GGACGAGTAACATTATCACATTTATTGTGTTTAGAGTTTAAAGTTCAGTATGCAGGAAAG
CAGTATTACTGGCACCACATTGAGTTTAATATCATCACCCTGTACTAAGAATGGCATTGA
GTTTAAAGTACCTCATTTGCTATGTCACTGATAGATTTTTGGATGCCCGATAACTCTTCT
GAAAATTCTTTTTCATCCTCTCTTAACCTGAATGGCACACGAGGTGGAGTCAAGCAACCA
AGATATTTACTTGGACGTAGTTAAGCAATGTAAGAAGTACAATTAATAAGAATGACCTTT
TAACATTTGAATCAAGATAATCAATCTCTCGTTGTATGTTCTGCATGTCTTCCTCAATTT
GAGATGCCTCAGCCTTCAGATTGATAAAGAAGTGATTCAGACAGAGTAGCTAAACTCAAA
CATACAAAGCCAAGGAAATACAAAGAAATCAAGAGCATGCTATGGCAGCGTATATCTTTT
GGAACAACTGATATCAAGGTCCACCGATTATTGCATACTTATGGGATAACCCAACTTCTT
CTGAGGAACAGGTTATCATCTCATTTGACAATATAGGTACAAAGTGGTCATAGTTAGCTA
TTGTGGAAACCAAAAATGTGATTAGTCCAGTTAATAGAGCAATGCCTCCCCTTATTTAAA
ATGAACTATCACCTCCGTTCACAAATATAAGATGTTCTACTTTTTTCTGATTTGGATGTA
TAATGTGTTTGTTTACTCATTTCAGTTCGTAGTTAGTCCATAAATTTTTTGGAGTATTTG
TGAATGGAGGGAGTACTTTAAGGTAACACTAAGATTTGTGTGAGGGGTCCAATCTGTTAA
GCTTCATGCACTAGCNAACGCAACCAAAAGTCCGAACTGATGGA
