Map Locations of contig_159898 (6541 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_159898

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_21802 1 1631 bp MLOC_21802.1 Available Available None
MLOC_21803 4 1296 bp AK359213 Available Available None





CDS Structure of MLOC_21802






CDS Structure of MLOC_21803






Contig Sequence (6541 bp)

>contig_159898 6541 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCAACCGGGACTAAAGGTCCCTACCCCTGGCACACTCTGACAACCACGTGGAAGGGATTT
AGTTCCGGTTCGTGGCAAACCGGGACTAAAGGGAGGCTTTAGTCCCAAGTTAATAGTTCC
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CGTCGGCATATCCCTTCAGTCCAGTAGAGACTTATCTTGGAACGGATGGAGTACATATTA
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AATTCTCCCAGCTAAAATGCTGAAAATGGCAACTTCAATGCACACGCCCACCCACTGTCC
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AATCTATCCGCCCTCACCATCATACATCAGCCACCACTTAACATGTGAGCTTGCTTTACA
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TTACTACGAGTGTAAGTCCACTTACACACATACTAGCTATTGCTCTGGATTCGAGTTGTG
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AGAACCGTTCATAAGAATCTGTATCTAGTATTGGATTTGTGAAACCAATTTGGCTAAAGA
ATAAGCTGCCTCTCCCCAGCTTACTAAGCCGTTCCTTCAATTTGTTGAGACTTCTAAATT
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ATCATCACTCATCCCGCTAATTACCTTGTTCTTTGTGGGCATGTAGAATTGTTCATAAAC
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ATATATTTGGGTGGTTTTGACCGCGTCAGCTTCGGGATGATTATCTAAGTGACTATTGCT
CTTGTGTGTTAAGGTTTTTCTTTGTTCTATTATAAACAGCTTGAAAGATCTAGTACCCTA
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CTGGGGCCTCATGACTAACCTGTGATGTGATAGTACTTCATTCACTGATGATGATGATGA
AGATAATGGAGCATCCTCGGGAAAAATATGAAAATGGAGTAAACAATAAGCCCAAAGAGG
AGGCAACGTACAAGAAGCTTTCCGGTCTTGCTGACAGAGGCCTCGACTGTTTCCTTGTCC
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ACTGATTGATAGTCAGGCACAATTTATTGAACACTGCGCGAGGTAATGAAGACATGGAGA
TGAATCAAGATGGTAACATCCAAGAAGTAACACCAAGACACACAAGTATAATTTGCAATG
ATTTGCCGTTAAATGTTATGGATAACCAGAACAACATTGGTATTATCGCTATGCCATGAC
GGGTGGCTGTAGTCACAATTCCTAGACCTAGATTAGCATGTGCATTCTGAAACGCAGAAC
TGTCCGAGTGTTTTGAGTGTTTTACCAACTGTCTGCTGATCATATATAATCAAGATCAAT
TAGCTCCAAACCTTTTTTGCCGTGGTTGATTCAGGGCAAATAGGATCAGAATTTTTAGTT
AATTCTATTTCATTGACAATATACAAATATGTTATTTTTTTTCTATAGTTTCGGCCATGG
AAGCATTAACTGAATTTTGCATTTAAGAACTAGCGTGAATAACTGACCTTTGAAGCATCT
TCACATGCTTGTGCCAACACTGCAAGTTGAGCTCCCCAACCAACAAGTGTTATATCACTT
CCTTTGCGGATCACCTAAAGTATAAAGATTGCATAAATATTTTTGAGTTCCCTCGTCACA
AAAACAATACGCATGATGGAGAGACACGCACTTCCGCCTGGGATAAAGGCAGCATATAGT
CCCCCTCAGGAACTTCTTCAACAGCCAAACGGTACAGCCACTGTTAAGAGAGGAAAGCTG
CTTGTAAGAGCATTCCAAATAATCAATTCAATATTGTCCATCAGCTGTTCTCTTGCGCTT
ATTCTACCAGATGGATATATACGAGTTTTAACCAACTGAGGAACTTCTTTCACATTTTTG
CTCTACCTTTGGCTCGAAAAAGATGACTGGGTTTGGGTCACGAATGCTGGCCAGCAAAAG
TCCCTTGGCCTCACGTGGACTCCGAGGTATGACAACCTGAAATAGCATTTTTCTTAGTAC
TCAGGAAACATGAACATAAATTTCTGTATACAACTTCAGAAATGCCGTAGAGCGTCAAAC
AAGAGTACCAGAAAATGATGCTTGATATTGTTATACTACCTGATTTTACAAATAAAAATC
TTAGTCAACTAGGCAATGTGGTTTCCACTTGTATCCTAACTATTTACTGTAAATGATTAC
AAATATTGGCAGAGAGCGTTAGATATACAAACTAACCTTCAGGTCAGACATGGCAGAAGA
AAGCCTCTGGTGACTATGAATGGTAGTGACCACCATGTCCAACAACTCCATATGGAGATC
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CTGCAGGGAAAAATGGTTACCTCCACAGTTAAATTAATTTCCACTTCGGTATCTGAATTT
AGCGGCTTCGTTGACAATCTGCATCAGAAGTGGTATGAACAGGTTGGAACAAGACATTGA
TCAAATTTATATAAATTGAGTCAACTTGACAATGTTCAAGAACTAAAATGGTTTTATAAC
TGAATGCGATAGTGACAATGCAGATTCCAGAGTCCACTAAGAAAGTGAAGCTCCAATAAT
CTCGGGCAACAAGTAGACAAGGTACTTCCATCAACTAAGATAACACAGTAATATAATGCA
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