Map Locations of contig_159693 (8528 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_159693

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_21634 1 1647 bp None Available Available None
MLOC_21632 1 1790 bp MLOC_21632.1 Available Available None
MLOC_21631 1 138 bp None Available Available None
MLOC_21633 1 712 bp MLOC_21633.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_21634






CDS Structure of MLOC_21632






CDS Structure of MLOC_21631






CDS Structure of MLOC_21633






Contig Sequence (8528 bp)

>contig_159693 8528 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGAGGCAGGCCGGGACTAAAGGGTTCAGGCCAAAGGCCCGTTTTCCACTAGTGCCCGTTG
CGCGCCCAGACGAACGCGAGGGAGCCGGAGCCCTTGCCACACGCGAAGGGAGGACAACCG
GGGCTGCTCTGGACCGTATTGAAGGTGGGCGCCGGTGTCGCACCGGTCGCGGTGCTGCGT
GCCAACCCACTCCCCTGATACACTTTCCCTTTCTCTCGATTTCTTGGTACCATATTTAAT
TTACCAAGCTGCCATATTTAGTCACACCTCATGTTCCCCTTTAAAAGCATTTGTTGTAGA
TGATTCCCTTGTACATACGCTAGGAATTATCTTTTCTTATTTGTGCAGTTCTAAATCTGT
GAGCATTCATATAGAATCATCGGACCAAATAGCAAGTGTAGCACAAGTAATTGCAAGGTA
AAAGGTTCTTATCTTTTTCTCCATCTGAATATGGTTTCTTGATTTTGGTTCATATATCAA
GGGTTGTTGGTGCAGGCAGTGGATATGAAGTACCAAAGCAGATAATATGAATTTTCACAT
GTTTCCTTTTATTCGTAATGCAAATTGTAGTTATTTGAGAAGGTTATCCAGGGAGTTATA
TGATCAAAGTGACTGTACGTATACAAATTTGCTTTGTGGATTTAAACAATACAACCTATA
GAGTTACATGAAGTATTGATAATTTTATATATCATTGGATTCTTATCCTAATGTAGGACA
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GTCGGACTACCGTATGTTGACTCTGTGCAGACTGATTTAAATAGAAAGAAACGGAAATTT
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TTTTTGTCATAATTTGTTTTCCTTTTTTTAACTGATGCCACGTGTCTTATTCTGCCAGTT
TCACGGCTGACTTCTTCATTTTCTAACGAAGATGTTGCCCTGTTGAAAGGTGGCTTGCTT
TTTAGTTGATGAATTTTTGTTCTTCTTTTGTCTTGCCGTATTTGAATTTATCAATTTCTA
CTTTTTTTACAGTTACTGTTCATCACCGATTCGATTGGCGACCTCTAGGAGCTACTAATT
TCGCACACTGATGCATATAGGAACTAGGTAGATGTGTACATACTTTAGGATAGTTAATAG
TTTGTTTTGCTTTTTAGGTGATAATTATTGTAAAATTTCCTTTGTTAGTTTTCAGTTGAA
TGTAACATATCCTGCCAGTGGAACTTCAACTACACAATACTTGTGATTATTTTGGAAGCA
CAAGTATTTTCGTCATAATTGCACAAGTGTGTTGGTTGATGTTTGGCTCTAAATGAAAGC
ATTGGGAATGCTTATTGTCAAAGTACCTCCCTTTGTTGTTTTGCCTCTCTGTAATTACTT
CATGTTGGTTTTCAGTTGAAAACAACAAAATTGAAATAAGTGATGTTTTTACAGACTTCA
TCTCATTGCAATATGTTTACCTCTACAAATTTCCAGTAGGAACATAAAAGAGAGAAAAGA
TTCACCTTCGCATGCTCTCCAAGTGAAATCATCAATTAGATTGTAGAAGCTGCTAGGCCA
CTTGGTCTGACCTTCAAAAGAAAATTATAAGTTATTCATATTTCTTACTGCTCCCATGTT
CATATTGTTCCAGTCAAATCAATTGCGTAAATCTTTCCATGTACGTTCGCTTTGTCAGAA
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CAATAGCCTACAGTGTTATGCCAACAAAGCCCAAGAACTATTTTATATGTGTAGCTAATT
GCGTATTGCTTTGCTAAAGTCTTGCTGAATTTAAACAGATGTTGAATGAACCATGTTTGG
CTGTTTTGTGAGTGCCAGTCAAGTTTGCACTGCAACGTCTCCATGTATCCACGTTTTCCT
GGATTTTTGTGGACATCAAGCTATTTTCTAATATATGACATGATAATTCACAATTCGGCA
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AAAAATTATTTCAAAGTAAATTTAACTCGTGTATTTCTTCCTAATCCGACAAATAACCCA
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ACATAGGATATCTCTAAATCAAGTGGCATGTCCACCAGAGAAAACCTCAGGTATACCATC
TTTCACCTTCTTTTTGTGTCACCATTTCTTATATTTTTTATGTCTATCTATACAGGTTAA
GAACGATGGGCCTAACTTATTTAAAATTTGATAATTTCCTGTGTATTTTCCCTTTGTATT
AATGAGTTTATACAGATAAGATTACTGTGTCTATTTATTCATAGACAAAAAAAACATCTT
CTGACTTTTATAATTTTCCATATACTTTTCTGGAATTTTCACATACACAATTAATATATA
TATATAGTTTTTAATCATCCAGATTTATTATGAATCTCAACAATCAGCCTTTTAAAGACG
TGTTCATGGGTGATGTACAGCTGCACAGGATGTGTGCCATGTGGCACTACCGGTACAAAT
CAAATGCTTGACACTGATGCCAAATACTTGACACTGAAGTTAAACCAATCATCCACAGGA
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GACCATTGTGAAACTGTAGGTATTCAAATTAGCAGGTGAAAGGAACACTCTCTATGCAAA
CGACGTTCTGCAATCACACTTGATGACAGTTCCAACTTGCAAGCGACCAGAGAATCACAA
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AAGAGTAAGTGATGCAAAGTTTGAACGATTTGGTTATCCATGTCAATAATATGCAGCGTC
CTTTCTTGGCTGGTTATATAATTAAACTGCTGTGTAAAAACTATAGTGATGACACCCATG
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GCTCAACTCCTCTCCTGATTCATTATTCCTTTTTATTTCAACAAAATAACCCAAAAAAAT
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CTTGTTGTCACATTGTCGTCGAAGACAGCAGGCTCCACCTACAATGTCATGTCTTCAACT
CTTCATACAAACCGGCCACCTAAGCAGAGCCGCTGGTGCATGCAGGCACACTGTGTATGT
GTAGTCCGACATGCACCGGCCCCGCTGTAGCACGCACCAGCACGACTTCTGCAGTGTGTG
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ATGTAGGCCCTGTTTGGTTTCAGACTTAATTTACCACGCCTAAGTTTAGGTGTCAGCCAC
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TTTCTATTGAAGAATCCCTCATTCGTTGTGGCGAGCCAGACCTTAGTACGGAAGCAAACA
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AACAGCTCCGTAGTCCTCCGCAGCTTGCATGCAGCGTGACTTCTGGCCAGTGGCCACCAG
TCTGGTGTCGTGGTGGTCAAGGAGCATCCGGTCACAACACAGTTTGCCATGGTCTCATGC
TTTATGCTCACTCGAAATTCGGTGGATATTCACGAACGGTCAATCCATATTGTTTCTTCC
CTCATGCCTCCTAATCCACATAATATATATAATGGTGTATGAGAAAAATGGCACCAGCAC
TGATTGACAGAATAAGTTATGTTATTCTAAACTTATGCCAGGACTGCTTATGGCGTAGGT
ATGTCTTATATGATGATGGCCAAATGGGAATGGATATATGTTTAAAAACACATGCACGCT
GGTGCGTCCTACTAATTTCTGTGGCCCAAGTATGGTCTTCGGCCTAGTGGCACACTAGCA
TACCTCTTGTGTTTATCAAGCTTTATAACCAGTTTTGGCTTGTTCCATCTTTATTGTCGT
CAAATACCACATCAACTTCAGTACCTTTCTAGATTCTTTTTGAACTACTAGTAGTGCAAA
CGTTGAGGCTTTACATTGTATAAAGCGCTGACCAACTATACATTAAAATTCGAGCAAAAT
GTGAACTCCGAGAAAAATAAACAACTCATTTTCTTGGTATTTCATAAAAGCGTCGTACCC
TCTATTTGGTGCCGCATTGCAGACCAGAAATTGAATCGCATGGGTTTCATCTACCATCTG
GATGACACCACGTTTATTGAACTGCTGAAATCCATTACTACGCATGTACACTACTCCCTC
CGTTTCGATTTATAAGTCATCTTACGAAAACCAAATAATCCCAAAACAGGTAGGCGAGGT
GCATTAACTTCCACCTCGTTTTTTGTTTTTTGACATGAATAAAGGAATCAATCAATAAGA
GACGCGGGGCATGTATGTTTTTGATGACTCGAGACTAGCTAGCACGTCATGCAGTGGTCA
ATTCATTGCATGCAATGATATTAATTAGTATATTAACATTAATTTCTCTCGTTTTCCTCT
CTATTCTAGTTGCGGTGCACAACCTAAGATGACATATAAACCGAAAAAGAGGGAGTACTG
TTTCTATCGTAAAAGGCTAAAATATTGCCTATGTAACTTAGCTTTTTTAAATAATTGCAC
TTGCCATGCACAGGCTACCGTCCTAGTCGACGTAACAATATCTTAATTATCACAAACTGG
AGAGCATGTACAATTAGCCTTGTATGATGTTGTGCAGTGAATCTAGGATTTCCAAAGCCA
ATCTCGAGCTGGTTTGGGGATATTGCTTTGCAAAGTATGACATTCAAATGCCCTGTAAGA
GCCCAGCTCCGCCTGGAACATGTAAACAATAGCATTTTCTGACTTCAATGTATTAATTCA
ATCATTTTTAAATACAAAAGTACATTATTACACATATGTTTCCATCGTAGGTATTTGGGA
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TTTCAGGCTTAGCCTTGCCGGCCATACTGTCCTTGCCTTACGATATTCCAATCAACAGAA
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ATGTAATGTGACTGTCCAACAAGTAGGTGGAGCCCGATGCACCTTGACAATGTTCTCATC
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TCTATGTGGTTAATTAGTCTTTCCACATTCTTCAAAAGTAATGAAGGAACAGCTTCAACT
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TTCATGGACACAGAGAACACTTGCTTATATAGTATCGGGAAACATTCATGTTTTTTTGCA
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GATCAAATCATTGGATTTATTGTAGTACCATGTTTCATGTGCAGACCTAGGCACCATAGA
AGGCTATAACAAAGGCCAAATCATGTTCAACAAATCGTTTGTACTTGTACTTGTTAGTTA
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ATCTTGATTGTGGATTGAACATGATCACATGAACATATCCGAATTGAAAAATGTACTTAA
GCTCCTATTACTGAGAGTATAGAATGGATATGATTGTTTTCTGATAGAGTGTTAAGAGGA
TTATCCTTGGCCTCTACATCAAGTGATGCACAAAACCATTTATTAAAAAGAATGAAGTAC
AAACCAAAAAGGATAAAGGATAAACCAACCATGCTAATTATTATGATCGTGTGATGTAGT
TAGGCTCATGCAAGATTAGTATACTCTTAATCGATATCAGGGAAACAGGTTGTGCTAATG
ATCTTAGACTAGGACACTCACAACTTATTCACATATTCCATTAGATAAGAAGTACTCTGT
ATTCTACTTTACATACTATAAAGCAGGCCACTAGTAAGATACTAAAGAATAGTAAGATAA
TTCTGCATCTGACTATAAGTATAATACAACGATCAATTTTAAATTCATTAATGTAGTAAA
AAAAATTACTAGTGTGAACTTATAATCCAGCAGTAGATAAGTTAGCATAAGAGGCAAAAC
AATTGGATCAACTAGATTATGTTCATGAATTGAAATACGTTTGAAGGGAGTGAATGAGAA
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TTTAATCAATTTAATAAGAGACGTACATTACAAAAAATATATCATTAGAAACTTTAGATG
TTCTATTTTCAAATGATATAATTTTTATGTTAAACAATTTACTTTATATAAATCAAATTA
ACGACCTAGATACACGTGTAAGACTTATATATATACTAAGATGAAGGGAGTACTATCAGA
GGGAGGGAGCGAGAGAGAGAGAGAGATGATGGGGTCTTGTCAATGTCATTGCAGCGCCAC
AGCCACTTACCGCTGTCGACGTCATCGCAGCGCCCGTCACCATGGACCATTCCGTCATGG
ATGACACCCTCGCAACATCGATCATCACACAGTCTTGCCACACGAAGCAGCCACCTCTTG
AGGTAGACATCACCTTCATGAGGTGGATTACCACACCACCATCTTCTTGCAGCATTGCAC
CGTGACCGCCAGCGGCATCAAGCCACCAACGGCATCCCTCCTTAAGCCGTCGGCCTCCAT
CTCGCATAGAGTCTACCACGCCGCCGCCGCCACCTAGATCTTCAAGGCCCTGATGCCAAT
TATTTTAGATGCCTCCTCACAACACTTCTTCTTTCTCTATCTCAAACATCTGTCTTTGGA
TTTTCTCACACAACACAAAGAATACACACACAGGGCAGAAGACACACGCGCACAGACACT
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TCCAAGCCGCGTTGCATCTCCAACATCTCACCTTTCTTGCCGCATCACACGGCTTTGCCG
GCTCGCGCAGCACCGCAGTTTCACGCTGTGATCGGCATCTCGTCATACTCGCCGTATCGC
GCGGTGGCCTAGCATCTCGCCGTCTTCGCATGCCTCCGCTTAAGCCTGACCGGACTAGCT
ACTCTCTAACCTATGCTACACGCACTAGTAGAAAATGGGTCTGTCGGCTAAAGTTGAAAA
TCACATTAGTCCCGGTTCAAACTAAAACCGGAACCAATGCCAGGCATTGGTCCCGGTTCA
GTTTGCCAGGGCATTGGTTCCGGTTCGGTTCATCTCATTAGTCCCTATTCGGGGCAAAAT
TCGGGACTAAAGATCCAACAACTGCCATGTGACGTGCCGCGGAGCATTATTTCCGGTTTT
TTGCCAGAACCGGGACTAAATGGTAGGCTATTAGTCTCGGTTTTTCTCGGTTTTTGTCTA
GTTTTTGTCTAAAACTTTGTCTAAAACCGGGACTAAAGTGCTGCCTATATATACCCTGGC
CCCTCTTCTCTGTTTTTGGCTGTTGAGGTATGCATGTCAGGCTCTTGTCACCCTTCTAGT
TCATGCACATAAGGTGTTCGATGAAATGCCCGAGCCACATCTTTTAGCTTTCTCCTCTCC
AAGCTCGACCTCCAAACTCCATTTTCCTCAATATTTATCTAGGTTTGGCCGTGCACCAAC
TACACAAGTGTCCCGTGCCCGTCCTCACTGTTGTCGATCGCCCGCGTTGATCTCGTCGCG
AGCACCATCGTGGTGAGCCTCTTGTTCTTGACTTCTTTTTAAAAGAAAAAAAATTCTTAC
TTGTATGGTTTAGATAGATACTTGTATAAATTACTTACTTTCATTGTTTTTTGTTATTAT
ATAGTACG