| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_159640
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_21577 |
2 |
1224 bp |
AK249562.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_21577
Contig Sequence (9325 bp)
>contig_159640 9325 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACACAAATGTATAAAAATGGATGTACCTAAAACTAAAATACATCTAGATACATTCATTC
CTATGACAAGTATTTCCGGACGGAGGGAGTACATATTATGGGAATTATGTTTTCCCTTCA
GTGTTTGAATGCAAATGCAGTTTGTGTTCTCAGCAGGGTAGAAACCGAGAGTGCAATATA
TTTGTAGACCCCTCTTCTTGTTTTATGAAGAATGGTAATATAAGTCACAGTGTTGATACC
CCCCTCCTCCCCCTGTTTCCTGGGGACCTATTTATTGTTTTTCTCCGCAGGCACTCCTTG
AATACGAGAAACACAAAATTGAAACAGGCGAGTTCCAAGTGGCTGCATCTACTTTAACTG
AGCGAATTGCTTCTGATAGTCAGGTACAATATTATGATTGATTATGCTAGCTCTTTTATG
TTCTTAGATCAAATAGAGAGGAGTCATGTGCAACTAATTTAACAAGAAATTGTTTCAAAT
ACATTGAAAGTTCATTTTTTGCATCTAAACTTGTGGTCATTCTTTGAAGTAGTATGAGCA
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AGGTGGGTGGAAGCCATGCATCAGGATCCGGAAGAGCTAGAAGAGAATCTGCAACTCGTG
CCATGCAAGGATGGCATTCACAGCGCTTGCTAGGCAACGGTGAAATTGCTGATCCAGTAA
TTAAGGTATCTGTTCCTTGAAGTGGAAGGTCATTAGTAATCTGTGTTCTGTTGTATAACT
AACATCCAAAATTTCATTCAGGATAAAGCGGCTATGCCTGTCTTGAAGAAGGATAAAAAT
CCGAAAAGCAGTGGTAACTTTTTTGGACATCATTTGTTAGACATCCATTTAGAATATATA
TTGACCACTACATTCATATAGGTCCGGCCAAGAGGAAAAGGACACCTACCTTGGAAGATG
AAAAGGCGATGCCATACAAGTCTGAGAAGCTACAGTAACTCTTCTTTTCTCTACTCTTTA
TTACCATCAAATAAATCTTGCAAGGCCTTTTATTCCATCGCTGTTGGGAATCATTAAGAA
TTCCGCAACATTGCCACCAACCCATAGTGTCCATTCTGTTCTTTTGCATGTCATAGTGGA
ATTATGACCCACAATGTCTATCCAGTCAACGAACTAGGTTTAACATGCCAGTGACTAGAT
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TTGGCAGAAATGACTCGACAGTTATTGACATGGGCCCTCCTGCTGATTGGGTGAAGATAA
ATGTTCGGAGAACTGTGAGTATCTCATTTTCTAAGTACAAAATTGTTTCTTCATGGGCCC
TCCTGCTGATTGGGTAAAGAGAAATGTTCTTTTAGTACTCCCTCTGTAAACTAATATAAG
ATCTTGTAGATCACTATTTTAGTTATCTAAAAGCTCGTGTATTAGTTTGCAGAGGGAGTA
CATTGGTACTATTTCTTCACGTTCTCAGTATATTTTTGAAACTTTTGAAGCTGTGCCAGC
AAACTCCTTATTCTATCTAAAATGTGTAAATCTCGGTTAAATCATGTGGCTATTGACCTA
TTATGTGTTTAGAAACAAGCATGGCTAACCTGGAAATCAGTTGGATCTTTTTATAGAAAA
GAAAATTTATGTTTCCTTGCAGAAAGATTGCTATGAAGTCTATGCATTGGTTCCTGGCCT
TCTTCGTGAAGAGGTAAACAAAATAAATCTTTCAGTTAGCAAGGGTGCAGTGTAGTTATG
CATTAATGGTGTAGTCATCCTTTTGTTTTCTGAATCCATGCTGCAAAAGTTGGAATGATT
AAAGTGCTTACAGTTATATCCGGATACATCTTTTGTTGTAGGTACATGTTCAGTCAGATC
CTGCTGGCCGCTTGATAGTTACAGGAGAGCCTGAACAACTAGATAATCCTTGGGGTGTTA
CTCCATTCAAGAAGGTTTGTGAATAATCTGCATTGTATTCTGAGGATTTTTATTCGCACC
AGATTTGTTGATCAAAATGGTACAATCTGCAGGTCATTAGTTTGCCCTCCCGCATTGATC
CTCATCAAACCTCAGCAGTTGTCACTCTCCATGGGCAATTATTTGTTCGTGCACCATTTG
AGCAGTCAAAATCATGACACTCTACTTGACAAAGCAGAATAATACATGTATGCTTTTGTT
TCCAAGAGACACAGCAATTGCTGCACTATTTTATTCCAGAAAGTTATCATCTCTAGGAAA
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ATTAATAGTCTGTATATACTTATTAATAGTATGTAATAAAAAATAATTGAGTTGTTTGAC
TGAAAAAACACTAGTCGATCGAGTCACTCGACTCATCCAACTAGTTGAGTCGACATCTTG
AGTCAACCTGCCAGTTGTGTCTCATCGACTAGTCGCTCGACTAAAAAACAATGAGCACTA
GATTCTTTCACGAGTCATAAATGGAAAGATTAAAATAATAATAATAACAGTAATAATTGC
TGGTCTAGTCAGTGGACCTGTGTTCATCATTTTCATTTGCATATTGAAAGAACACTTATC
TTACTTGCTCGTGCAGGTTGCCTTGCTGGTGGGATCATATGATGGTTTGCAGGTTGCCCA
CCCCGATCTTTGTTCGACTAGTTCATTACTGCTTCAAGGCTCTTCAGCGGTGTTGTATGT
CCTGTGTATTGATTAATTCTAACTAATTAGATGGCTTAGTACTGTGCATTGCCTGTGACA
TTTAGCGTAAGTTCCAACCTCCAGGCCTGTAGCCTAGATTCCTGATGCTCAAATGTTCAT
GGTTTATTTGTTCCTTTTTCGGTTTAACCATCAAAGGATGATGATTTGTAGTGTTGTAGC
TTTATTCCTAATACTTTGAGTTTGTCATCATACTTCCGAACACGGATGAAATTCTGGGTA
TGCCGTGTAACTGCTGCTGTTATAGAAAACCATTGCATTCGCCTGACTGAAAATAGTGGT
GCTTGAGAGGGCGCCACTTGGCGCTCGCCGTGGGCTGCTACCGGCCGGGGACACAGGTGC
TGCAGGCTGGTGTGTGGTGCTGTGGCGGCGATGCTGTCATGGGATGTGTGGTACAGGCAA
GCAGTCGACGATGATGTTGCAGAACTCATAACCCTGAAGATGTTGCCAGCGCATGCGTTA
CGTAACCATATAATTTAAAATTGCTCGACAGTATTTCTTCTATGTCAAACTTGTATCATA
GCTTTATAGAAGAAAGAGTATATCTACAAAAAGTAAGAAGTGAGCAACTCCAACTCAAGC
TAGACAACTATTCCCTTCATTTCTAAATATAAGTCTTTATTTTACATGTATTGCATATGA
AACAAAATAAGCGATTTTTCAGTTCAAAAAATATTTATATACATCTGTATATAGTACGTA
GTGAAATCTTCTTCAAGACCTATATTTAGGAACAGAGGGACTACTCAATAAGGACATATC
TAGCTGTTGGAGTCCCAAGAACATCACCGAACCAAAGAAGTTGGTGTCTTAGGGGTTAAA
TGTTTCATTTGGCATAAATAGAGGTGCATGAGGAGGGCATCTCTTCAGCCATACCTCATT
TTAATAAAAAGTTGTGAGGAAAATGATTAAGTGGGCCAAGAAAAAGGACACGTGGGGAGA
CATGATTCGTTTAAACTTTCATCGGCGCCCCCAAGAGTCCCTCAGCGTGGAGTTTTGTCT
AGGTTTGCATTTTGGCATCCTGGGGAAGCGCTGGGGTGTGGCTGGACCGTTTTTCGATCA
AAAAGTGTCTCAAACCTAATACCAAACCTAAAAAGGTGTCCTCGGAGCATCCGGGAGGGG
CATATGGAGATGCTCTAAGATGAGATACTCGAGTGGCTTGTGCCCTAGCCCAAAGGCCTA
GCTCTTGAAAAATAAAATCCACAGTACCCCATTCATTACATATCCCAGTCCTTCGAAAAT
CCTGTCATTCCTTTGTTTTCAAAGACATATGAAATAGATGAGAATTGTGAATCAACCTAT
GATTGAATGGTTAGAGAAACAATGATTTTTTGAGTCCATCAGGGTTTAAGTCCTGGTGCT
TGCATTATTCCATGATTTATTTTAAAATTTCTGACGATGCACATTTAATGGGAGGAGATG
TTTCCATCGATAATGAGGCACCTACGATGATGCTCATAGGGATAAAGCGTGCATATGTGC
ATTTATAAAGATGGATGTATGCACGCTTATATAAATGCTTGCGTCTGTATCATGTTAAAA
AGCAGATTAACATCATGAAAGTGTCAAAACCCTTTTGATGCATTTTTGGGATGTGTTTTC
TTGCGATCGACCACGGGTCCTCGATCCTAGCCTAGTCCGCATGGGCCACCCTGGTAGTCA
TAAAAAATGATGCATTGTTATAGGCCACTCTGGTAGTTATAAAGTATGCATATGAAGGCA
CGTCACCATCACCCTCCTCCCTCATCAGAAGGAGGCAAACCTTTTGTACTCCATCCGTTT
CTAAATATAAGACCTTTTAATGATTTTACTATGGACTATATACAGAATAAAATGAGTAAA
TTTACACTTTAAAATATATTTATATACATTCGTATGTAGTCCATAATAAAATCTATAAAA
GGTCTTATATTGAGGAACAAAGCAAGTAGTTGACAGTTGGGAAGTCATCATGTTAAGAAT
CGAAGGACGGGAGCACCAGTATAACATCCATCGTTGACGAAGAAGAACGTAAGTCGGAAA
GACTATACATGCAAACACATGAACGACCACGAGATTGAATCCAACTAGATAGGCCGAAGA
CCAACGCTGACCCGAGCTAGGCAGATCCGATGGAAACACACCTCCATGTGTCCTCCCTCG
TACGTAAGCACATCGCCAAAATGGGGTTAAGATGGAGAGGACATTATTTGGACACTAGGA
CGCTGTCACCCTCAAAAACACCAATCCCGAGAGCGTCCGCCACAACAGCCATGGTCAAAG
CATTAGAATGATTCAACAAACCAAACTATGAGGAGAACTCCAAACTACATCCACTCTACC
GCTAGATCTAGGACAACCCCCTTACCCCAATGTCGAGGAGGCCGACTCAGGAGAGGGGAG
GGGGCCGACGAAGGAACAAGGGGAGGTTCTCATGGGAGGATCAAATGCTATTTGGTATTC
CGAACTGTTAGGGCATCTCCAATGGCGTGCATCAAAATGGACATGCGCCCATGAAATGCG
GATAGGGGGCGACCATCCAACTCCATGCACCAAATGTCCGTCCACATTTCAAACGAATAG
TTCCTGAACCAGTGAAATTCATGAGAATCAGACGAAATTTAGGAAAGTTTCATATGTATT
ACATGCAAACCCTATTCTATTTAATAAGTTCAACAAAAAAACTGAAAATTAAACTATGCA
AGGTAACGCAAGGTACCCCATGATGACCTCATAGGCATGGCCTCCGAGGCTATCATCACC
TCCATTGTTGTCCGTGTCGCCATCCTTGTCTTTGTCCTTCGAGTGGCGGACAACCTCCCA
TGGGCCGCAACCCTGATTGGTTGTCGTCGTTCCGCCTCGCGCAGACGATTGATCGCGTTG
TCATCCTTGTCGTCGCCCTTCCAGTGGCTGACAACCTCCCATGGGTCGCAACAACCCTGA
TTGGTTGCCATCGTTCTGCCTCGCGCAGACGATTGACCGTGTCCTACTCACGACGACAGT
CGGGTGCAGACTCTAACCCATGTCACCCGCTCTTGCCCTTACTATTGCCAATGGGGGCAC
GAGTGGTGTGCTCAGGCTTAGCGAACCTGATCTTGTAGAGTTTGTTGTTGATCCGACGTC
AGCGACATGATGACGTCTACGCGTGGTCCTGGACCGTTCCTCGACCCGTGACAACACGAG
GTCCAGTCGGCTGCTAAGTGCATTTCTACACTCATTTTCTCCATTATAAACTGAATAACC
CTAGATATTCCGAGAAAATAACTCAGATACTTCTAGTAATCTATATTTATACCAATAGAA
GGAGAGCGAGTTGTGGAGATCCAACAAATCTCGCGTGTTCAACCGCAACTATGCAACGGT
GGTCAGCGCTTTGGTGTTTAGTGTTAAACATGTTTAGTAGTGAACATGGTACCCTACTCT
AATTAATATCATGCCTAATATCAATGCTAGCATTAACTAGGTAATTATATTCTACTTAAT
ACTAACATGTAATCTATATCTTGCCTAATATTAGCATGCAGTACATGTGCACAATTACTA
GTGACTAACAAAAGCATGAAATTGAAAATCCCTCCATTTATTTTGTTTGCACCAGGAATC
GACAATTTGGAGGGAGGAAAACAAGGAATATTAGGAAATATTAAGATAGGCGATCAATCG
AGAGCAAACGGAGTCACCACAACACAACCATGAGAGAAGATCTTGTCGGTACCACCCTCC
GACGGCTCCGTGCTATTAACAAGATTAGTTCCTATAAGGGTGGACCCCCCATTGTCAATA
GAAAATTGAAACCCTAATCCATAGGCATCGCCATTCCCATCTTCATCTCCATTTCCATAG
GAATCATCCCCTTGCCATACAATCACTTGTAATAGAGATACATCACGACATTGCAAGGCT
ATCATCAATCATTCATCTTATATCTAGGAATAGACAAAAGATTCCCCCAGTAGCGGCTAG
GGTTAGCTCTCCTCAAGCGATTCCATCGCCCTTGAGTTTTGCCAATGTTTGCCCGCCCCT
GACTGTTTACTACCTTTCGATATGGATTCCTCCGTTGACGCCCACTCCAAGGCCGGAAGC
GGCGCTCGAGGAACCCCCCGACAATTTGGACTACTTCTTTGGTTAACTTGACCTAGATGG
AGAAGAGTGTGATGATCTGGTTGTTGATGAAACTAATTCGGTGATCACTGATCACACGTG
ATGGTTTGCACCCGTGAAGGTTCACAGCAAAAAGACGTTTAGCCAAGAAACTATCTTCAA
AGATATGTGTGTAACATGGAATCCCGAACATGAGGTTCACTAAAAAGTCTATGCTATTCC
GTGACGAAACCTTCGTGATGAACACAAACCGTCACCTAAGAACTATTTCTTTGACGGTTT
TCCGACACAAGCTATGTTCCTCCCAGATCCGGCATGTTGGGTGCATTGCTCACGTTCCGG
CCTTATTTAGGTGACACATTTGGCCATCACTACGTATGCCCACATTCTTTGGTGATTTGT
AGTATCACACAAAGTGTTCGACGGGTTGGGGGAAAGGATAAAAATGGTGTGGTGGCTTGA
AAACGTAGTTTTGGGTTTTTCTAATGGATACGAGGTGAGATGCTCGTAATGAAATCCATT
ACAAAAATCCATACATGCTATCATTTTACTAAACTGTGAAATGATATATAAATTCTTAAA
AAAGCATGAACAATAAAAAATGATCACACCACACAATATAGCATTGAAAGTTCTAACATA
CAACAAACATTTAGTACATGATCAAAGTCATTCCCAAAAGTATTGCACATCACGAGTAGG
AGTGTTCGAGCATGAATAAGAACTTCATAAACAACATATGACCACTATTCATCAAATTTT
GAAGATTAAATATATTTCCCAAGCATCGTGTGACAAAGAGGAGAACCTCACCACCTCCTT
GGTGGATCACAAGAGGAGTCTGTCCCCAACTGCTATCTTTTATAAGCAAAGTAAATTCTT
TTAGCCATCTAGTAGACAAAGCATCCATCTTTTCTAGGTGTTGAGTATATCAACCATAAG
TCAGTATCAAGATAGATAATAATTATCATTTGACCATGTCGATCCATTTGATCAGGTAGA
ACACAACTAAGGAGGCTCTATTTACATGGTATGATGTCATATTTTAAATATGTCGGACCC
GATCCTAAGCCAAATGAATCTAACTCTAACAAACCGTATAAGTACCCTGATACCCACGCA
TGGTTCAGACGACTTCCGTCTTACCTTGGCCGGACCGTTTGCACCTTTTGTCTATAGCTT
ATATGAATAAGTCACTAGCAACCATATGACAGAAACCCAGATCGACATGATTAGCTACAG
ACCAAGATGACACAATCGTACAGGGACAGACATAGGTAACCTAGCAATGCATGTGTCAGT
CATCAATGTGTGTAACTTAGCCATAGCAATATACAAGGACTCCGATAAACACTGTGTGAT
ATTTCCCCGTAGGGATAGACACAAGAGTAAAGAATGATACATGTCGCTCAATCCATGTGT
TCCAGATTAGTAGCGAGCTACCAAGGCTCAGTGGAAGCACTAGGAGGCATTTCCCTATAA
TAAGGGCTACCAAAGGCATACAAATAGGTGTCCAACCCCACACATAACAATATACATCAC
ACATATGCATAATATGCAAGTATGTGTTGGTAGAACATGGCATCACAATGGAACTCTACA
AACTCAAGTAAAGATAAGGCTCGAAAGAGCCATACATAACATGGTTATTACAAACACGGG
TCTCATGACCCAACATACAAAGCATACAAGCAACATAAGCATAACATGTCTGAGTACACA
CAACTAGAAATGAAAAAGGCCGAGGTAGACTGTTTGTCTACAAGATCCTCCATAAGAGCC
ACACCTCTGTCTGGCATTCAAAGCTACCCGATCATCGTGGAACTACTAGTGAGGCTGAAG
TACTGTTGGATTGATAGAAGGGGTGTCTAGAGTGGGAGGGGTGAATAGACTACTTGCATN
NNNNNNNNNNCTAGCCTTTTCCCAATTTTAATGGTCAGCAGATTTTAGCAATTTTAACAA
GTCTAGTCGACCCTACACATGCTACTCAACAAATATGGCAGCGGAAAGTAAAGACATTGC
ACATTTAAGGAAGGAGTAGAGTTTAGGAAGANNAAACACAAAGATTGACACGATGATTTT
TGGCGTGGTCTCGATAGGCGGTGCTATCGTACATCCACGTTAGGGGAAACTTCAACCCAC
AGAGGGTAACGACCCCGAGTGTCCATGAAGGGCTCCACCCACAAGGGTTCCACGAAGAAA
CGACCTTGTCTATTCCACCATGGCT
