Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1594085 (1963 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1594085

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_21294 1 553 bp AK362737 Available Available None





CDS Structure of MLOC_21294






Contig Sequence (1963 bp)

>contig_1594085 1963 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTGTCCATGGCTAAGTCTTTGTCGATATGTTAATTTTTTAAGCGTCCTAATTTATTTTT
TCTTGGATAGCTAGGGCCCATAGGTAACAAACGTTTTAACATAATTCCATTTGTAGGTGG
TGCTGCTATTTTCATGTATACTAGCATTTCTATTGAACTACACCATCTTTTGGAATACTA
TCCTGAATTCTGCACTCACACAGTCAATGTGTGGGAATTTGAAGGTACGGTCTCCATCCA
ATTCCTCCACGCAACTCAACGTGTGTGGCATTTTGATATCATCTTGAGTGCCGATGCTAT
TTCTGCAGGATTTCTTCACTGTTGGACTTGGCTGGGTACTCTTCGGTGGGCTTCCTTTTG
ATCTGGTGAGTTTAAGCTTGTTGCTCGCCTATTAGCTCTTCAATCTCCTTTCCTGAATAC
TGACTTAATTTTTTTCATGGCAGCTTAATGTCATCGGCCAAGGGCTTGGCTTTGTTGGCT
CAGGCATGTATGCTTACTGCAAGATCAAAGGAAAATAGATATTGATGTTTAAGGGACTAA
AGGGGAGTAGATATTGATATGGGCAGTATGGGCTTAACCAAAGTAGCGTTCATTATGCTG
TTTGCTCCTGCATATGGGAGAGAAAATTTTGTAGGTTTTCCTGGGTGTACATTTATAAAC
TCCAATTCTCCTGGGTAGAACATGAATGAACTGCCATTGTTTGGCCAAGGAAATATAGAA
TACAACAAGATTTCAGCATCTCTTTACCATCCTTTTGTCTGTTCGCATTGCCGTATTTGT
CTGAAATAGATTACAACAAGATTTAAACCGCCCCATCCATCCAAAATATTGGGCCCAAAG
GCACAACAATCAAGTAATAGCTGTGTTGAAGACTTTATTATTTTTGTTTTTCTCAAAAAA
TTGTCTCGCTAGAGTGACCGAGCTCCAAAAAGCAACAGAAAATTTCCAATATATCAGAAC
TTTTTTTTGAGGGGTATATATCACAACTAGCAAGAGGCTATTGTCACCGTGTTTGTGGAA
AATATTTCCCTCTTAGGCCCAGTTGATTTGGATTGGGTGTACTTTTTGTGTGCTGGCCAG
TATTTAGTTCAAACTTATACCGGGGAGCACGCTAATTTTCCACTCAATCCAAACAGGGCC
TTGGTTTCAAATTACTCCTCTCTATCCAAATAATTGTATTTGGAGAAAATTAGTCTAGTT
CTCCTCAACTACAATTATTTAGGTATAGAGGGAGTATTGACATTCTAGTTTTGTCCTAAA
TCAAACATTCTTAAGCTGTACCAAGCCTTCAAAAATATCGTTGTTGTACATATATAAGCA
TATGTGTTATATAGATTTGGTCATATAATATAGAGAATAAAAAATGAAATATGTTTGTAC
TTGATGAAACACACGTCATCCAATATTCCAATTCACGATTTAAAAAGATTTAAAAAGACA
GAGAGATACTGACTTTTTTAGAATAAGCTCAAATAAGCTGCCCCCTACCCAGCTTATTCT
AGAAGCCTAATCAAAATTATTCTTTTAGAAGTCTACTAATTAAGACTTGACTAGTAGGCT
TCTAAAAATATATTTTTAGTTGGACTTTTAGAATAAGCTGGGTAGGGGTAGCTTATTCTA
GAAGCCTAAAAAAACTATCAAAAGAACTGGCCCTAAGTATGTTTGACCTAGGACAAAGCT
AGAACTTCAAATAATTTGATATGCAATGAGTATATCAAAATGCACGAATTTAAACAACGT
GTTACTCAACTGGTGCCAAGTTGCCTATATTACAACTACCAAAATCTATATCTATACCTA
ATAATAAAGTGGCTATTGCTTCCGTCGGAAACCCACCACGGTAATTTTATAAAAAAGCCC
CTGTAATTTTTGTTATTCAACCCGCGCTTCATCATTTATCTGCAACGCAAAAGGAAAAAA
CGATTTGCTGCAAAAATTATACCCGTACGCATCGCCTCCTTCC