Map Locations of contig_159331 (8120 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_159331

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_21142 11 1814 bp AK248433.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_21142






Contig Sequence (8120 bp)

>contig_159331 8120 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATATTTAGGTACGGAGGGAGTAAATGCTAAACTACAATATTGTTTATTGGATGTCGAATA
AGTCTTGAAAATCAGTTCTTATGAATATGATATCTTATTTGATGTTTTGCAGATTTTTGC
AGAAAAGCCAGCCGTGCATCGGGCATTTTTAGATTATGTCCCGAAGAAGGTAAGATAGTG
CATACTGTATAATGTATATACTATTGTAATGTGCCTTACCATAGGCTTTAGGAAGCTTGA
GCTTAAGTTGGAGTTAGTTTATACTTTATACTATATCTGTGTTGGCATAAAGTGGATTTG
GTTTCTCATTTGCTCTGTTTTTCCTTCATCTCCCATGACTATCCCGAAAAGTTGTCAGAA
AAGGATTTTTGGACAAAATACTGTAGAGCTGAGTATCTGCTTAGGACAAAAAATACTCTA
GCGGCAAAAGCTGAAGCTGCTGAAGATGAGGAATTAGCCATGTTTTTGAAAAATGATGAT
ATACTTGCCAAGGAGGCAAAGCTCAAGGTATAATTCTAGCTGTTTATTGTTCTTATCCTG
CATATTTCCTTCAAATTTTTTTGGTGACTCAATTCTTGTTTACAGATAAAACGAGTTGAT
CCAACATTAGACATGGAGGCAGATGCAGGGGATGACTACATCCATCTTCCTGTCTGTTTG
TGTTCTTGCTACTGTTTTGTTATATCTACAACTTCACAAAAACGAGTCATTTATTCGTTT
CTCATAATGAGCAACTTCTTCTGCTATTTTGATCTACAACTTTGTCTGCTATTTTGATCA
CAACTTAGTCCTATTTTGAAAAGAATCATATTATTCTTCGGGCATCTAGGATCATGGGAT
TCTCCGTGATGGCAGCAGAGAGACAACTGATACTGATAGTGAGTTGGCTAGGAGAACACT
TTCTCAGGATCTGAATCGGCATGCTGCAGTTGTTCTTGAAGGGAGATCAGCAGGTGAAGT
TTTGACTCAACTCAAAAGTTTTCATGCTGTCTCATTTAAATTTTTGCGTACTGAAGTTGA
TTGGTCAAGCATGCTATTACTATCAAATGAGATGATACTGACATGCTAACAGCCTAACAG
TTCTCCTGCAACTGCACTTCTTCTACTGGCTTCCTGTTTGTCTGTCTAATACTTTCCTGA
AAAAGAATGCACCGACAATTGCACAAATCAGCTGTCTTATACTGCTGGTTGGTTGCACAC
TGTAATGTGTAGTGTAGTACCTGCTCTGTACTGGTGTACTTTCCCCTTCGCATCAGAGGA
ATGCCAATAATTTCTACTTTGCATTTGCTTGATGGCTGTTAATAACTTAGTATTAATGCA
CCATATGGTTTCAGTACGGAAGGTGATTGTGTTTGTTATGCGTCTTTTTGCAGATATTGA
ATCAACTGATACGAAGACTGTGGCTGAAGCACTTGCAAGGTCCAAGAAGGGTTAGTAATT
ATATCGCTATGTGCATCTTTTCTCACCCTACTTAGTTCCTTACTAGGCTGATGAGTTATC
AACTGCAGAACCACCTCCTAGCTCTGTTGCTGATGATGCTAGTCATGAAAGATTGGTAAA
GGCGGCCCGCATGACTGAGATAGAGGATCTGCAAGCTCCACGAAGTCTCCCATATGCACT
ACTTTGTATAAAGGTAGTTGGCTCATATGGCTTGATATAATATATCAACTCAAGTAATAT
ATCGCAAGGTTATGATTTTCATGCCTTTCTTGTCTTTATAGGATCCTAGAGAATATTTTG
ATTCTCAGCAAGCAAATGCTCTGAGACCTTTAGGTAGTAACGATGGAAGAAAGGCCCGCA
GCTGCAGCCTTAGTACGGATGATGCATTCCGTCATTTAATGGATCAAATATCTTCCGTGA
AAATGAACTGTCCGGTTGTTCAGTCAGATGTTGCTCTAAAGGTAAGCAGTTTTACTTGGG
ACCTGGTACCAATGTTCTAGAGTCAACTTTACGGGGATTAGGTCCTGTTTCCTTGAAAGA
TGCATGTCTGTAGATATATCTGACTTACTAGTACTATTTCGTAAGCAAAATTGTTGGTGT
ACCTCATCCAATGTAGGTCAATCTTGTTTCCTCTGTAAACGGGATGTTGGTTCTTTGTGT
CTGTACATATTGTACATATTTTACTGGAAGAGAGTTTGCTCTTCGAAAACTAGTGAAGTA
TTTGCATAGAACTAGCCAATCAGTTCCCAACCATTTCTTTGGACACAATGATAAGCCCAA
CATTCTAAACGGTACAAACACTTCTACTGAGGGGCGTATTAGGTATGACTATGAGAAAAG
TTGATGTTTGTGTAACTGTTTTATATATGACTAACACCTTATCTGGTCCATAACTTTGCA
TTGCCAAAAAAGAAACAGTATCCATTTTGCAAATGAAACTAGTTTACCTTTCTTTGTTTT
GTTCCAATTCTTAATATTCGATTGTCATTATCAACATCTCAATACTCCCAAGTTTTCCTT
ACAAACACACGTTTTGCATGCTGTGGCTTCTCTATTCTTAAGCTATTAAATTGCATGAGC
AGGAAAACCTAACTACCTACATGGTATGGGCCTAGGTTCTTAATGAATTGAATGAAGGAA
TTTCACGTTCACGGAGGCTTAATCTTAAGAATCCCCAAGACAGTCTCCTTGGCCGTCTTC
CTCACCGAACACGGGATGAACTTATGGATGTGAGATACTGCACCTATTTACCTTTTACGC
AGAAACTGTACCATGCTTCCAAGCTGTTCTAGAATGTTTATTTTCCGGGTTTATCTTAAT
GTATCTTTATTTATTTATTCATGTATATGTGTCCGACATTCTAAAATCTTCTTATCATTG
CACTCAATCTTATTGTACATCTTGTATTGACAGAGTTTCTTGTGACTTGTCTATTTTTGT
AAGCATTGGATGGCTATCCAGGAGTTGCTGCGCCATTTTTGGTCATCATACCCAATAACA
ACCACAGTCCTTTGTAATAAGGTGTATTGTCACTCCTATCTTATCTGTACTATTTTGTAA
CCCACAGGTAGTATTTCAGTAGAAGTTGGTAAAAGTAGCTCAGTTGCTGGGTACTTTCGT
GCTTCAAGATAAGAACAACATCAGTGCATATTATATATGTGAATAATAACTAATAACAAT
GCAAGTAGAAATGTAGTCATGAAGTCTGATGTGCTGCCAACGTGGTTTTCTGTTTCCTTG
CTATCAGTAATTATGGAATTCAGTGTCATACTGTCATGAACTCATGACCGGAAATTGACC
ACCACCAGGTTCTTCTTATTATATTATTGGCTATCAAAATGTTGCATTTAACGACCCCAT
TTGTTTCTAGCTTTTTTTCATACTACATTAAGTCTGTTAATAAAACCAATCACTTTTAAA
TAGCAGATGTTAATATTGTCTTATACAGTCTACTATTGGTATATTTGCGTACACAGCGTA
ATAGTAAGTCAAGGATGCCCAGATTGATGGTTATGTTCTTACTGTGGTTTTGTCACTAAT
TTATGATCTAGATACCTGGTAGGACTGCTATATCGTAAGCTATCTTAAGCAGTTAAAACA
CCCAGAGCATTAATGCCTAGATGTTTATGTACTTGTCCGGTTGTTCCACAGGTTCAACGG
CTTAAGGAAGCAATGACACAGATATATCAGAAGTTACAGGTTAATCTTCCACAGCACAAT
TGATATTTGGAATCTAATTATAACTGAAATTGCCTTTTATTATATTTGTATGCATAATTA
TGGAATTGTTTTCCTTGTTGCTAAAAGATTGGTGGCGAGGTTTCTTCAGCATTAAATAAT
GCATTGTGTGTGCAACTTCATACGTGCAGGATATAAAGGAATCTGCACAGCCTGATGTAC
GGCATGAAATATCTCAACTCGTAAAGCCCATGACGCAGGTGCCTACGGTTCCTTACTGTT
GTGTTTCATTACCCCATGAATTATCTGAACTTTGAGAAAACTACCCACCTATACCTTTGT
CATGATTTAGCTGCTAGATGCATTTCCATATTTGTAAAGCGGAAGGATATGGCTCAGAGC
AAGTATATTTTAATGAATGCCTTTATTTTCATTTGCTGGTTTTGGTGCTCATTGGATACT
TCCTCGCGGTTCATGCCATAAAACACATGAATACCAGTTTTCTTTCAATAATTTTTAGCA
AGCTGATTATATATAATTCCCAGGCGCTGGATGCTGCATTCAACCATGAGCATGACCAGC
AGCAGAAATCTTCAAAGGCCGGGAGCAAGCCTAATGGTTTTTGAGCAGAGAACACCACCC
ATAAGGATTCAACCTGATTATTGCTAGAGCGTGTGAGGGCTACCACACCCACACCCGTGA
GCTCTAGGCGGCAATTGAAGAGGCACTTCTGGAGGATTTGATTTTGCCGTGTATTTTTAT
TCACACGTGGCACATAATAACATGCTTAGTTGCAAATTTTGCCCTGGACATGTCGTATCC
CTCCTAGCTGTTTCAAGATAGAATCATCATTTTGGATCTTCATTTTATTTTATGGATGGC
CTATTTGTTATGCTCTACCCTTGCTATGGCGATGTGCAAATGGTATAAATAATTAAACCC
CAACGGAAAGATAGATATACCATGATTGATATATCAGCAATTTTTGTTAGGCATTGGAAT
AGCTTGTAACGTGCATCTTCTTCTATGGGTGTTTTCAAATTAATGTGTTGCATTGCCAAC
AAGAAAAATGTTGGTACAAAATTAGAAGGGTTAATTGGATTCATGCCACTGCAACTTTCA
TGAGTTGGAATAATGCCATTATAAAAACTGAAGTTGGAAATATGGCACTACAATTTTCTC
ATACCTCTACATATGCCATTTTCTTTACTTAGAATATCGGTTCAAAAAAAAAACTTGTAT
CTCAGTGTATATTTCCAATATTACTGAGGTTGGGGAATCAGCACCCGCATCGGGGGTCCC
CTTCAGCCGCGGCTTGCCCATCACGCCCTCCTTCATGGCTGCTGCTGAAAGAAGGAAGCA
ACCGACCGAATTCACGTCAACCTCTCCATGGTTGCTGATGACAAAGCTTTGAGGAGTAGC
GGCTTGTGCACAATGGGAAGCGATTTAAGGAAGTTGCACAATGGGAAGCGATTTGAGGAA
GTGGGCATCACACGACAGCTGGGAGCTGGCAGCACAACCGTCGAGGAGGTAGTGGGGAAC
GACCGAGGAGCTCAGCATGGGGAATGCAGCATGCGGCGTTTGCTTCTGTCGTTCGGCTGC
AGCGGGGCACGGAGCGACGTCCTCTCGCGCATAATACCCCTGTGTCTAGCGTCCTCCCGC
CGCTCCACTCGCGATAGGGATAGAGCATGGCGAGCTCAGCTTTGTGGGCGACCTTGTGCA
CGGCGGCGTTCACCTTGAGCTCCTACAGCACGGACGTCCTGGAGCATGCTGGTCGCGCTG
AGTGGTTGGGCTTGCCATTGACTTTGCCGAGCTCGAGTTCCTACAACCCTCGAACCGGTG
GAGGCCGTGAACTTGTTCCTGTCGAAGGTCACCGAGCTCGTTACGAACTGTAGGCTGGGC
GACAACGGCATCGAGCCGGGGAAAGGTGGAGGGGCTCGGCATGGCGGATGCAGCACGTAG
GTGGAGCCGTACAACACCATGGCACCATGGGACACCCGCGACAACCAACACATGCGCGCA
TTAGGCGTAGCACGGTGGCCTATTGACATAACCAATTCATAAAATGAACGGTACATGAAA
AAAGTTTCGTTGACCTAATCTTTTTATGTGACGTCTGACAAAAAAATGCCACACTACATC
ATGTGGCCTCTTAGTCCTAGGCGTCGCACCTCCGGCCATGCTGGCATCCCTGCCAGGCCC
GACCCCACCCCACCCGCAGTGTGCCGCTTAAGGCAAAGGCGCCACACATGCAAGTGTGGC
GCCTTGCTCTTAGGCGCCACATTTTAACTTATTCAGCTGCAGGCCGACCCTCCACCCCGT
CCCCCCGTCCCCACTCCCACACATCTCAAGAACATCAGCTCCGCCCCTTCCCCCTAGTTC
CCCTCTCCTCCCTTCTCAAATATCTCCCCAAATCAAGTAGATCTAAAGGTTTGGTTCGGG
GATATCAACCCCAATCCCTCACTTAAGGTAATCTTCCCCGACCCCCTCCTTCTGATTCAA
AAAAAATGCTCTCACTTGCTCACTTTTTTGCAAGTTTGAGCAAACCCTAGTTTTTCATGA
ATTTTGGGATTTGTATGCTTTTGTTGCACTTTGCTAGGGTTAGTCTTGTTTGTATGTAAT
GGCCATGGGTATTGGTATGTTAGGATTAGGGTTCTTTGTATGTAAGGGTTAGGGTTATGT
TGGGGTTAGGATTATGATGGTGTTAGGTTTGTTCAATATATATGTTAGGAGTAAGGCTTG
CTCTTTTGATTTTGCGAATGTTGTAATCTTTGGATGGGTGCTTATAGAATATATTCTATA
TTGTGTTGTTCAATTTTTTTAGGGATGGAAAAAACATGTGTTTATCTTCATCACGTGGAC
ATGGATGCCTTTTTGAAAGGCAATATTGATCCGGATCTGGATGAGCTAGACATGGTATTT
GAGTGTAGTCCTAGCTATGCCGAGTTGTTGAAACAAGTGCAAAAAGATTTGAATTAGATA
GACCCAAGTGATGTTATTGAGTTTGATGGTAGGCTTAATGTGGGATTTGGAATGCACATT
CGTTGGACGACCCTGCATGTGAATTCCGAGCAACGTTGGGTTGCATACAAGGAGACAATG
GTCGAATCACTAGACAAGGCTTTAGAGTTATTTGCCATATAAAAGGTTGATGCTAACTTG
CTTGGATTTGAACCGGGTTGCCTCTCCGATTGTTGATAGTAGTCCTCCAGCATGAACCAA
GATGACGTGATTGAACCTATTTTGACCCAACAAGTGAGGCCAACATTGACCCCGATTTTG
AATATCCATGATGAAGCATTGCAAGAGGAGAATAATGAGCACGAGGATGATGAGAATGAT
GATGTTGTTCTCCCTGACAACAACGTTGGTGATTTGGACAAATACTATTTGCAAGAGACC
AAGGACCATTCCATTTTGTACTCCCGTGGCTATGCATCGGAGTTGGATGATGATGGTCCC
GATGAAAAAATTGACGAGGAAGGGTTCACGACCAAGGAGGCCGAAGCTTTCAAGAAGGTA
TTCGGCAGGATCACCGTACACCATTGTTCGACGATCTTAGTCTTGCCGATGAAGCCGTGG
TTGACGGCGGCAAAGGCATATTGCTTGGAGTTAGACCAAGTTTTCACCGGGCTGAACATG
GGAAGTACGATATTTTTCCCAGGTCAAAGTTTGAAACATTCCTGGAATTGAAGATGTGGC
TGGATGACTTTTTTGTTATGAACTATCGTCCACACGAAGTTGTTCATTCGGACATCAAGG
TGCGTTACACGGTTGCATGTGAGGATCTAGAATGTCCATGGATTGTGCGTGCAAGACCAT
GGAAAGGAGGCCTTGATGGCACATTGTGAGTTGTCTACCACTTCACATGTGTCGAGGCAA
GAGGGTTGATGGCGAGCTTGTCTCCCAAAACCATAGACAACTCACCTTGAGTTCATTGCT
TACAGGCTTTCTAACTCCATCTTCTCACTTCCAAAAATGAGCATAAAGAACGTACAAGAC
CTTGTGAAATCCCTCTTTCACTACGAGGTGAAATACGGGAAGGCATGGAAGGCGAAGCAA
GCTGCATTCAAGATGTTGTATGGTGATTGGGAGCAAGCATACAATCGACTCCCTAGGTTA
TTGTGAGCTATGGTTGCCACTAACGAGGGCATGGTTAATGTGGTCGAGTCGTACGGGAAA
AAACAATGATTCACAACGGAAGGACGGTCCGAGTCTTTAGCCGTGCATTTTGGGCATTTG
AGCAATGCATGAGGGCTTTTCAACACTACCGACCAGTCATCTCCATCGATGGAACCTTTT
TGACCGGACATTTTAAGGGAACTCTCTTGGTTGTAATAGGAAATGATGCCAATAACCAGT
TGTTGCCTTTGGCTTTTGCCTTGGTTGAGGCGAAGACCAACGATAACTGGGAGTGGTTCT
TGCGTCTTTTGAGAACCAAGGTATTACCATTGTAGGATCCGAAGTATGTCTAGAGGGGGG
GGGGGTGTGATTAGACTACT