Map Locations of contig_1592865 (5164 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1592865

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_21029 3 1938 bp AK375497 Available Available None





CDS Structure of MLOC_21029






Contig Sequence (5164 bp)

>contig_1592865 5164 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCCCCCGTGGGCCGGCCCCCCCGGTTCGCCGCCGGGGGGGGGCTGGTGGTCGGGGCCGC
GGCGGCCGGCGCCGCCACGCCCCGCACGTTCGCGGTGCTCGCCAGGAGGTACGTCGCCGC
GGGATTGACCAGGCAGGCGGTGCGCGCGTTCGATGACATGGAGGCTTTCCTAGGGAGGGA
GCCCGATGCCCAGGAGTTCACCACCCTTCTCGACACGCTCTGCAAGTACAAGTACCCCAA
GGTTCGTCATCTGGATGCCTAGGTGGTAATCTTCTTGATTTGATTGATTGCGCATAGTGT
AAGGTCTCTTAACACTGCATTTCTGGTTTCCGTACTATGCTTGTTGTAGCTTGTAGCCTC
TTCTTCTATATTGAAGTGTCTGGTATGATGAGGGGCAACTTTCATTGATTTGTTTCAAGT
TTTACAAGTGTGAAGCTTCGATGAGTATATGAATACATTCAAGTGAAGATTGTGTTGGCT
TGTTATGTCTATAAATATATGAATGTGCTCCCCCTTAAGCTGTTTGTGGTGCACCATGAC
TCTTGGCTTTGCATTGTGATTTGGTTTTTGTGATCTGCAGTTTGGTAGGTTAAAACTGAA
CATTGTTGTAGTTTGATGAGACGTTTCATAGTAATGAATTGGTGCAGTTGCAATTAGGCA
GATTCAATCTGCAATTTTTTCTGTTTTCGTCTTAATATCATGTATACAATTGATTGATCA
TGGATTTGCTTCTTATTTAGTGCAGTTTGTGGTGTCCAATTTGCTTAAATGCTAGATGGC
ATAAGCTTCAGGTTTAGCTTCTTGCGAATCTAGCTAACCGTAATGATAAAGATCTACAAG
AAACTGAAACCTTTTGGTATCTCTGTGAACAATCCTTCAGGGAGCAATGACAATATCACA
GTTCATTTCTGGAAGGGAAAAAATAATGGCAACGCTACTAATTCAAAGAAATTATTATCT
AGACGCAATCTTGTCTGTCAGGATTTCAGCATAAGCATTATCATGTCAGGTTAATGAAAT
GCTTGGCATGACAACTAGATCATGCTTGCAAGATGGCAGAAAGGATTAAGTGCTTAAATT
GCTTCCTTGGTTGATCATGCATTTTTAGTTTTTTATGAGTATTATAAGTAAGATTTCTAC
TCCAGATATTTGATTTTGGACATTTCCACGTGTACAAGGATTATGCTGAGCAATGGTTTT
GGAGTTTCCATCTGGATGTGTTTACAAATTACAAAGCTTGACCTCTGGGATTTTGATGAA
TTTGGAGTTACCCTTTTGGTTTTAGTCTCATTTGGATGTCTTCCCTGTGAATGTTTATGG
CTTTATGCAATCTTACACAACAATTCAGGAACTGACTTTTTTTTCCTTGCTTGAGAATAT
GGTGTAAATGAAGTGGTTTGCCCTCATGTCCTCATAAATTTTTGTATCTGTAGCTTCAGT
AGCCAGTAGAGAAGCATTTCTGATTTCTTGGGCCTGTAACTTATGTGATGCCATAATAGA
TCAATTTTACCAAGTGCTTGCATCCTAATGCTTTTGGTTTGGCTGGAAGTTTTTACTTCA
ATTTGATGCTCAAGGTATGGTAGAAAGTTGTAGAGATATTTCTGGACGAAATAGAAACAG
TTGACTAAAAAGTATCTCTATTTCATCTACAATAGAGATGTTATTTGCTCAACAAGTGTT
TGAATTGCATTAATCAGCTGTCACACACCTTTGGTGGGGCTGATAATGTATTTCTAATGT
ACCCACTCGCATTTTTATCACCATTGCAGGTTGCTGTGGAGGTATTCAATAAAAGAAAAT
ACAAATACGAACCAAATGAAAAGATGTACACTATCCTAATTTATGGCTGGTGCAAGGTAA
ACCGAAGTGACATGGCTCAGAAATTCCTAAAAGATATGATTGATCATGGGATAGAGCCGA
ACATAGTGACATACAACATTCTCTTAAATGGTATCTGTAGGCATGCAAGTTTGCACCCTG
ATAACCGGTTTGATAGAACAGTTAATGCAGCTGAGAATCTCTTGAAGGAGATGAATGACA
GGGGAATTGAACCAGATGTAACGAGCTACTCAATCATCCTGCATGTTTACAGTCGTGCGC
ATAAGGCTGAGCTATGTTTGTGTATGTTCCGCTCGATGAAGGATAGAGGCATCTGCCCCA
CAGTGGCAACCTACACTTCTGTGATCAAGTGCCTTGCTTCGTGTGGAAGACTGGAAGATG
CTGAGAGTTTGCTCGGCGAGATGGTTAGTGAAGGGGTGTGTCCCTCCCCAGCGACCTACA
ATTGTTTCTTCAAAGAGTACCGAGGGAGAAAAGATGTTAGTGGCGCTCTTGAATTGTACA
ACAAGATGAAGGCTCCTTGTTCACCAACTGCGCCAGATATTCACAGTTACAATATATTGC
TTGGAATGTTCATCAAATTGGACCGACATGAAACTGTTATGGAACTTTGGAATGATATGT
GCGAGAGAGCCGTGGGTCCTGATCTTGATTCATATACCTTGCTGGTTCATGGTTTTTGTG
CCAAGGAAAAATGGAGAGAGGCATGCCAGTTCTTCATGGAAATGATAGAGAAAGGTTTTC
TTCCCCAGAAGATCACCTTTGAAACACTGTATCGTGGTCTTATACAAGCGGACATGTTAA
GGACCTGGAGAAGGCTGAAAAAAAGGGTTGATGAAGAATCGGCAAAATTTGGCGATGAAT
ACAAATCGTATCACATCAAGCCTTACAAGAGATGATATGCTGCCATCGAAAAGATAGCAT
GTATATTCTTTTAATTTCTTGCAATCTTACCATCGTATGTATGTCAGCTTGATTGGAGCA
CAGTTGGAAGATGTATCATGGTATTATCATTCCAAGGTGACCTTTCTACCAAACATGAGC
TGAGGAGCAGGCGGGAAAAAAGGAAGGGCGAGCAGACATGTGCCATTAATACACTGATTT
CATCCTACTCATGCATCTGCTGTCTATACAGTAATCTGGTATAATGATTCTTTGGTGTGA
TCGGGTGGAGTTGAAGGTGAAGTGCTGTATTACTGATTTCAGATATTTATCTTTAATTTT
TCATGTGAGCTACATCTAACTGAACCATTTCACCTGTTCATGTATTGCAGAAAGGTGTTC
CCCTCAGAGACATCAGACTATTGGCGGAGAGGGTAAGTTCTACTGCCGAATTTCTTGCGT
CCAAGGCGTCTGTTTGATGGTGCTGGCTTCAATGCAAACTTTCAGGACATGCAGATCTCC
CAAAAAAAAATCTAGTTTGTGGTTAGCCTTTAGCCATAGAGTTGTTTTCGTTTTAGTCAA
CAATCATGTACTATTATGCTGTGGGCATCTGATATAGCAAGTTATCCACCTGTGAAAATT
GTAGCCTCCCTTATTTTTTTCTACTGTTGTACTTATAGTCTTATACTGCCTCGTTTTCAA
ATTACTTCGCATATTAGGTCCCGTTAGTACCTTTGACCAACAATTACATTATTAATATAT
AACTTTTGTCATATTCATAAAGTACTTTGGAATATGAGTCTAATGACATTGATTTTATGT
CACATGAAGTACATGGAACATGAATCTAATAACCTCAGTTCGGTGTCACATAAAGTACAT
GTTAACATAGAGGAATTGCTGGTCAAAAGGCTGTCCTTACAGGACAAAACCTTCGCCACC
GTGTACTTTCTTCCCAGCCTTTGAGCTGCATGTATTATGATGATTATGTTTGCTAATAAT
GTTTTCATATAATTTGGTCTTTTGCATGTGGAAAGAAGGTTGCACAAAGAGATATCATTG
ATTCATTGCGTGCATGAGAACAAGCTAGATGTGTTTTTTTCTTCTTCTTTAACTGGATTT
GGGATCTTGTGGTAGTCTTCGATCACAATGATTCTTTTTATCCATGACAAGAAATATCTC
TCACCAATTATTGGTGCCCAAGGGTCCCATCTCCTTGAGCTTGTCCTCAAATCCTAAGTA
TAAGCCTGTGGAAATCTAAAACCCTAATATTGCCTTTCCAAAGAGAACACCACAATACTT
GTGATAAATCCCACAAAAAAACTGCAAAAACATAATCATGTCAAGCCCAATATTTGCATC
TAAAAAAACGTTTCAATTCCAATTAGCCAATAAATTCTCGAATATAGTTCTACCTCTCCA
AAATTTGTCGAAAAAAGTGGTGAGATCCCATTTTATCGATAGTGACCTCTAGTGAAAAGA
TTGGGCGAAATGGCACATTGTTTCATCCTTATCCTTTCATTAGACATCTTAGATCTATAT
GGCCAATTGAAAGTGCATCTTATCGGGTTTTCATGATTAAAGACAAGACAATTGATACGA
CTAATATATCGACAAATTTATTTCAGTAAATTAGTCCACATATGTGAGTGTGACTCCTAC
TTTTACATCTTCAGGTGGTTACCTCCTTCAAACTGTTAGCATGTAATTTATAGGTCTTTG
GTGAATCCAAGATTCACATCAATGTTAGTACAATTGTACTATCAGAAAGGCAAAAATAAA
AGAACAATGGTTGAACTCCCAAGATAAAATCCTCCGACCAAAATCCCAGGATTTTACTCC
TGCCATTCAATCCTTTTGTTTTTCCTAGCCTTAGTACTTTGAAGTAATTCTACCCAGTAC
TATTTAGCTTTGTGAGTAGAGTGTGTGCTCCGTGAAGCGAACCCTATTTTCCCCTACTCA
GAACTGCCAAGAAATTTCTCCAGTACCATCTAGCTATGTTTCCCTTGAGATCATCTCTGT
TAGCTCTGGTACATCTGAGCATAACTTTTTCATGGCACTTTCGAGCCCTTCTCAATTTTC
TTCAGCCCTTTGGGTCTCACTATCAATATAGGTCCAGCCATTCGGAACCTCCAAGCTGGG
ATCTAGCCTTTTTCTGCACCGTTTCTCTTTGAGAACAACTATGCCGACGCCGGTACTTCC
AAGCATCTTCTATCTTTGTAGAAAAGAGCCACCTTTGAACACACCCCATAGTTCTGGGAT
TTTTCCTCTGGTGATTCTGGGCTAGTTCTTCACCAATCGTCACTGTATTGGTTAGCAGTA
ATGGATAGGCATGTGTCGAATTGGCCAAATACCAGTGTAAGGAGAGCCCTCAAATGATCA
TTATAGCACGCATTTTACTTTCTACTCCCTCCGTCCCCAAATAAGTGTCTCAAGCTTAGT
ACAA