Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1592762 (2541 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_1592762

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_21001 1 404 bp MLOC_21001.1 Available Available None
MLOC_21000 1 1467 bp MLOC_21000.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_21001






CDS Structure of MLOC_21000






Contig Sequence (2541 bp)

>contig_1592762 2541 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTTTATGCAGAGCACTTCTTCATTTCAATCGATCTTAATATTGTTTTGTTCCATGTCAA
AATCTGGTGTCAAGATGTGCAACCTTTCTCTTCTCGTGACTTATCCTCCACCGTGTAGCA
ATGTGTGATTGCATCGTAATATCATTCTCTTAACATCTACCACTCGTTGAACCAAACACC
ACATGTTTTTTTGGTACGATTACTTGTAAACACACTTGCAAGACCAACACATGCGCAATC
ACTTAGTAATTTAATATAACTTTGGGAAGAATACAAGTTCTTAGCAATCTTCCAGCTACT
AGAGTTGATGCGACGTTATTCAATGTAAACATGCCCTTCTATCTTACATCTATGTGCATC
AAATGTTCTTACACAACTTGCATATGCACCCGTCTTTATTGCATTTGGACCTATAGGAGC
ACCACCCATAACAAAGAGGATTATGGACGTTATCATAACGGCATACTTCATCACAGTTGG
TGGAATTGCATGTTTCACCCGACCCAGAATAGGTATGAATACAAGTTTCAAAGGTTCTAG
CATCTGAAATTTTTCACTAAATGAGTATTAATAGATAATCACATGTCTAGTTTCTCGTCG
GATTAGTTGTTGAAGCATGTGGTACTTTAGGAACAAACGAGTACCTGATGATGATGGTAG
CATGAGCAACATTAGAGTCACGCACATTAGGGCAGTCCTCATCTTGGCTAACAGCGACGT
TGATGGTGGGAATTGAGGATGTTTTGTCTGAGTTGTAGCAGAAATAATAATATGGCTACC
ATGTTATATTGAGGAATGGACTTCAATGATAATTTAAATATATTTTCTATTAATTGATGG
AAATAGAGGGAAAATATGAACAATTATTGAGAAGGATTGGTTTATACCCGCCCATTAATT
TTCGGCATGATCCTTTCCCTATTTAACAAGAGATCGTATCGTGTTACTAATTAATAACAT
ATGATTTGACAGATTTCTACTCTAAAGGGAGAGTCTGTACATGGTTGGTTGCTACTCATT
CAGTCCTAAATCTAAAATAATTTCGAAACAAAGCATCGAATCGATTTGAAATCAATCTAT
TAATGCAATTAATTAGTGAGACAATCAATTATGCGTGCAATTAATTAAGTCCATTTAACT
AAGGATTTTTCCACAACAAATCAATTATGAAATCTTGATACTAATGCAAGTAATTAATTA
GTTACGCACTTAATTGTGGATATATATAATCACCGGTAGAATGTTTTTTCAGCTGTGTCT
CTATGTTCTAACTCCTAAAGGGGGAATTGGTAGGACTATATTCCGGCTTATTTTTGCCTC
ACTGGTTAAATTTTGCCTCACCTCCCATCACCTCCATCCATGCTGCTTTTTCACCCTCCC
ACTAAAGACCGAATCGATTTGCCCGAGCCTACTTGTATACCCTTTTGGTGGATGTTGATT
CAATTCAATTAGATATTTGGTAATTAAGAATTAAGAAATTGCATAATATATATGAGATCA
CCTTCCTATAAGATAGACATTTTTTACGCAATAATATATTAAAATAAAATAGGATATTTC
TTAATAATAAATCGCCAATTCGGCACACTTGCCATTTTTTTAACACTCTCTACTTCTAAA
TGGGGAGTTCATACATCGTTGGTTGGTACTCACCCACTCATTAATGTAAAACAATTCAGA
AACCAAGCACCAAATATTTTGCAAAATTAATCTATAAATGCAATTAATTAGCTAGGCAAT
TAATTACGCATGTAATTAGTTGATTCCATTTAACTAGGGTTTTTTCCACGACCAATCAAT
TATGAAATCGAGCTATTAATGCAATTAATTAGTTAGTCTCACACTTAATTATAGATACAT
ATAATTAATAGTACAAAGTTTTTCAACCATGTGTGTACTCTTCTCTACTCCAAAAGGGGG
TGTTGTTAGGTCGCTACTCCGGTTTATTTTTGCCTCAGCGGTTAATTTTTGCCTCACCTC
CCACCACCACTCTACATGCTGATTTGTCACTCTCCCACTAGAAACCGAATTGATTCGCGT
GATCCGACTTGTATATTCTTCAATTCAATATTGTAGATATTACGAAATTAAGAATTTAGC
ATAATAAATATGAGATCACCTTCCTAAAAGATAGACAATTTTTTCCGCAATAATCCACCA
AAATAAAACTCGATATTTCTCAACAGTAAATCGCCAATCCCACACACTTGTCATTTTTTT
ACAAGTAAATAATCCCATGCATTTCACATTTCTTTCCATTACTATATTATAAATGGATGG
AACGATGAGACATGAATTTTCATCATGAATTCTTAATGATATCTATGTAATACTTGTCCA
TAATTACTCATGACGATACAATTCTTATTCCTTTTCTCTATGAAGAGGGAAATCACTAGA
AATTGGAATTTTGGACTTGAAAACCAAGTAAAAGGCTCTAAAATCACATGACTCCAAATG
ACCTGAAACTTCACGGATAATTTAATGGAATATATAAGAATTATTGGGCAAAAAATATAC
AAGAGGGGGGCCATCGGCTGG