Map Locations of contig_159011 (6192 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_159011

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_20488 1 229 bp AK360309 Available Available None





CDS Structure of MLOC_20488






Contig Sequence (6192 bp)

>contig_159011 6192 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTTTAAAAAAACTTCGTGCAGTACACAAACATATGTAAGACGTATCACAGGACCAGTTCG
TCAAGTTTAAGGACCGTATTGAAGCGGTATTCTCAAGTTCTAGGACCGTATTGAAGCAGT
TTGTGAATTTGAAGACCATTGTGGACATCGCCACCAAGTTTGAGGACCATACATGTATTT
GACTCCAGTATCAAGAGATGCATACGATTCAGAAATAATGAGTACACAGTACATTCTATT
CGATTCAGTCATTGTTCGATCATGGTGGGTGTAGGGTATTCTTGTGGAAATACTGGAGTT
TGTGATGGGCACGGGTCTGATCCCAGCTGATGGGGAGGTTTGGCGTGTTCGACGGCGTGC
CATTGTACCATCATTGCATCAGAAGGTTTTAGCTTTCTACTCACTATTTAGGTTTTATGT
GTATTGCTTTCTTTCTTGAACAATTTTATTCACTTTTGGATTTTGCTGGCCAGTTTGTAA
CATATATGATAGGTCTCTTTGGAAAAGCTTCAGGCCGGCTATGTGAGAAGTTGGACAAGG
CAGCAGCGGAAGGAGAGGCTGTGGAGATGGAATCTTTGTTCTCTCGACTAACATTGGATG
TCATTGGGAAGGCGGTATTCAATTATGATTTTGATTCATTATCATACGATAATGGAATGG
TTGAGGTTATTGCTCAGTTTTTTTCTGGTATTGTTTAGCATATTTTGAATTTTCATTTAC
TTGTCTTCCATTTTTCCTGTTAAATTTACTATTCGGTTTGTTGGTTCATGATCAGGCGGT
GTATGTAACACTACGAGAAGCAGAAATGCGGAGCACTTCTCCTATACCAACTTGGAAGAT
ACCCATATGGAAAGACATCTCCCCTCGACAGAGGAAGGTTAATGATGCTCTTGTGCTAAT
AAATAATATTCTTGATGAACTAATTTCAACATGCAAGGTAAGCTCTTTCTTATACTGGTT
CGCTATTATTGTCTTTAGAAAGAAAAAATCATGACACTAGGACTTCTACTTCACAGGATG
GTAGATGAAGAAGATCTGCAATTCCATGAGGAATACATGAATGAGCAAGATCCTAGCATT
CTTTGCTTTCTATTGGCTTCCGGTGAAGATGTATGATATAGATGCACTAGTAAAGTCTTT
TAGATATTTGGATCTTCTAGCACTCACGGTACTTCACTGTTCAACCCATGTACATCAGGT
GTCTAGCAAGCAGCTCCGTGATGATCTGATGACAATGCTCATAGCTGGCCATGAGACCTC
CGCAGCAGTCCTGACATGGACATTTTATCTTCTATCTAAGGTGTGATATGGTTAATAACT
CAAACTCAATGTTGTAGTAGTATAGCAATATCCAATGATATTATATCACTGATCATATTC
GTATTCATTAACCCATTAATATTTTTTACTTATTCTCATTGTGTTTTATATTGCGAACCT
GTAGTATCCAAAAGTAATGTCCAAGCTCCAAGCTGAGGTAGACTCAACTTTTTATCTCTA
CTGTGTTTTTAAATGGAGACTCACACTTCTGAATTGTAGAAATGGCAATTAACATTTTCT
TTGCTCAATTATCCACAGGTTGATGATGTTCTAGGAGATGGTTTGCCAACAATTGAGGAT
GTGAAGAAACTAAAGTATACTACTCGAGTTATTAATGAAGTAAGTACTCCCTCCGTTTCG
GTTTATAAGTCCGACACGTGTATCTAAGTCGTTAATTTGACCAACTTAATGAGAGACATA
TATTACAAAAAATATATCATTAGAAACTTTAGGTGTTCTATTTTTTTAATGATATAATTT
TTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTGACGACCTAGGTACACATGCATGCC
TTATAAACTGTGACGGAGGGAGTACCAAAAGTGTTACCATGTGACATAATGAGTTTTTTT
TCACTAAATGGGAAATATTATCATTGTTGCAGTCTTTGAGACTATATCCACAACCGCCAG
TTTTAATTCGTCGGTCCCTTGAGGATGACATGTTGGGGGAGTATCCAATCGGGAGGTAAA
TATTTTTTTTAACAGAGTTGCATCTATTAGGTCACTAATAAAACGGCCAACTTTACTCTT
ATTTCATTAGTAAGGAGTAAGTATCAATTATTAATTTGTCAAAAAAGCACCATTATGACC
ATCAAGTTATGCTCCTTTTGTCTAAGGGCTTTTCAACACCCTTTTCCTTGGTTACTCGTC
TCAGTAACTTATTAACATCAAGTGTTCCTTCCTTTTCCCAATCTTGTTCATACTATTTGA
TTTTACCTGCCTTTCCTTATGCTGCGTCTCGTAGCTAAGTTTCTTAATTGTTGTTATTGG
GCATTTTATTGTGATATTTTTTATTTTAGCATTTCCATATAAATTGAAACTTTTGTTAGT
TTTGAAAAATACATTACTCTTTTCAAGGGGAGAAGACATTTTTATATCCATCTGGAATCT
TCATCACTGCCCAAATCATTGGGATGATGCAGATGTTTTCAATCCAGAAAGGTGGCCTTT
GCATGGACCAAATCCAAATGAGACAAACCAAAAATTCAGGTTCCATCCCTATTATTATAA
TGAAATGCTTTTTGGTACACCATGTTTCACCTTAGTTATCAAGTTTAATAGTTATTACAA
AAATCTGTTGCAAGAACTGAAAGACCTTTGAAAGTTGGAATATGTCAATGATGAATCTTC
AAAGGGATGAATTGACTCCAATTAGAATTTATGGTTAATGGAATAAGAAAACTCATACCC
CATGGTAATTCATATTACAATGCTAATCCAGTCAACATTTTTTGTGTATGGAGTTGCTTT
GTGAGTGTTCGAAAAAGATTCACACAAATGCCTTCCCAATAACCATTACGTGCTATGAAT
TGAACTGTATTGGAAATTATAACTTTGTATAGTAAGTTTATGTGGCACAATTTTAGTACC
TACCATGTAATAACTAGTAAATTCTTTAACAATGGGCCTCCTTTTAGGACCTAGGAGGGC
CAAAGATCTAGATGAATATTGCCTTCCCGGGAGATATATTACTGGATTTTTCATAATCTT
TAGTGTGGGGCATAATCATAATGCTCATGCAATATATTTGTAACGGGGACAGGTGTAATG
GATATCTTCTTGATATTAATATATTATTCTTTCTTTAAAAATACATTTCTAAAAGACTAT
GAACTATGGGGTATCTGTATCTGCTATGAATATGTAACTATTTGAATCGCTACGAAGGAA
CAATTTGAACGATTTGTGGGGGGTTGAAGCAACGAGATATTAGTAGCCAAAAGACATCTC
CTAAGTATCCATCTAAAACTTGAAATTAGTAAGAAAACAATAGGCAATGCGGTTATGTTC
CTGTGTTTTTTTCTTGTGCTTCTTCTTGTTACTATTTTTTAATTTATATCAGCATGACTA
TTACAGTAAAGTTGATATATTTCTAATGATATCACATATTTCAAATAAACAGAAAAATGT
ACTTTCATGTCACACTCTTAGAGATACATTGGGTGGTTGTGGTAGCTTTCCTTCTGAAGA
ATAATGGTGCCATATGTTTGCTATCATTGTTTAAATAAAGGCTTACAAGCCTATTATAGG
CTATAACTATTGTACTTACGTAGTCTTGATGATTTTTTAGTTACATACCATTTGGTGGTG
GACCAAGGAAATGTGTAGGTGATATGTTTGCTACTTTTGAGGTAAACCATTCTGATTATT
TAGGGTTTGCAGCTAATAATTTTGAAATTGCATTTTGCATTATCATTAGATTTACTAGAT
TTTAGTAATTTGATTTAGTCGTATCAAGGCCTTCTTCTTTTTCTATATTTTACTTTAGAC
TTCTTGGAATTTGTGATATTATTATTATTTTGGTTAAAGCTGAGATACGTGGCCTTCCTA
GCCTATGCATGCACCAAGAGAATGTCCATGTGTAACTATTGAGAATCCCTTACATTTATG
AAATTTTGTTTGTAGAATGTGGTGGCAACAGCAATGCTTGTCAAGCGGTTTGATTTTCAG
ATGGCTCCAGGAGCACCTCCGGTATGTTCCCTACCAGCTATCTTATTCATCATAACTAAT
AAAATATATTCTCACATTTATGAGCACTATTATAGGTCGAGATGACAACCGGAGCAACGA
TTCACACAAGTAAGGGGTTGAACATGACTGTTAACTCGAGACAAAGACACATGTAAATCC
AATTTAGAGATGGAAGCCGATTTAAAAGGAAGTGCATGTTCTAATGTATCAGTGGTTGTT
TCCACTGTTGGTACTGCTTCTAGAGAATACCAAGAACTGGAGATGCCGCTAAGTCAAGTG
TGATACATAATGAGTACGTTCCCATCTCAGATCTACTTGAAAGTTCTGCTGCTCCCTCCG
ATCCATATTACTTGTCGCTGAGATGCTGAGATGTACCTAGACGTACTTCAGTGCAAGATA
GATCCATTTGAACGACAACTAATATATATCGGATAAAGTAGTTAATTTTTCATCATTAGT
TTGCCAAATGTTGTTGTGCATCAACTTCATTTATTTGTTCCTTCAATCATCTCTAGCCTT
TACTGATACCTATTCTAAAAAGAATATGGTGTTTGTCTCAGCCAGCGTGAGAAGGTAGGT
TGTCCTCATGAGGTACTACTAGACTAAACCTGGGCATGGGTAGCCCGGCCCGGTGACCCG
ACCCGAGCCCGGATTGAATAAACCGGACCTGGGTTTACATTCGGGCCGGGTTCGACCTTG
AAAATTAGGCCCGTTTGTACTTCGGGCTGGGCTCGGTCTTGGAAAAATACCCATTTTACA
TGAAGGCCCGACCCGGCACGGGCATGAATATTTGATTTTTTGACCGGGTCGGGCGGGCCA
GTCTCAGACTTGGGATTTTCAGTTCGGGTTTTCTAAAGCCCGACACGAAACCTGGTTCGG
CCCGGGGTATGCCCAGGTTTATAAGAGACTCATCTCTTACTACTAGTACTTGTTATCTCA
TTTGCCAAGCAATTTATTCCATGGGAAATTCACACACAGAAGACCATGTTTTATCAACAT
GCATCGAGTGTTTCATTTATGTCATGGAAATGAAGCATGGAAACGGTATAAAAAAGAGCT
GAAATTAGAGCATACCTTTATTCGGTGGTTATCTATTTCTTGAACGAAATTGATCCCTGA
GGTGTAATTTGGAAAGCAAACTTATTTTCATGATTTATATGTTAGTCATGTCTACTATAA
ATTTGAAAACAGTTTGTGAAACTTATTGAAAAACGTTCCTCCATCCCGATCCAAGCTGGC
TGTAATTTAGCTTTTATGGCCAAAGTTTATTTTCTGGCAACAACATAGAAAGAGCTTGGC
TTTTGTTTTGTGTCGATGTTCTTTAGCACTCATCCTTTAGTTATAGAAAAGTTCTACTAT
ATATACGGAACCGCGTGTTTCCTCTATGACAAGTGTCACCGTATTCAAGGGGCGGGTAGT
TGTCATCATCCTTTTCTTCTTTGTTGTCTTCCATCATGACCCCTCTTTTTCCGTGCTTGG
TTCAAACGTTATAGTGTGGCATAAAACCCTTCTCAAGCAGTTGGAAGTGAAGGGTTTTGG
AGTTGGAGAAAGCCTTCGTATTCGCACAGACAATACATGGACAATGCATAAAACCATTAT
GCTTGTTTGCCTCAGCCGCTTCGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATATACTCGGAGGTGC
GTCGGTCATCGTATATCCATTGTCGGTTCATCTGCGTGCGTTATNNNATAAAGTGTATTA
AAAACCATTACAACATATCATTAATAGAAATTGGTCATTACATTAAAGCCAAAGTATACT
AGTGACCAAAATAAATACATAATGTTCATACATAGTTCTCATTATTGAAGAACATATAAC
TCTCTAGAGCATCTAATTTAAACATACATTGAAACTATAAAATTTAAATGCAACAATAAA
TGTGATCATAACCGCAACTAAGGTACCAATTGATCCAACGGCATAATGAACCAAGCGTCA
GTATGAATGGCATATTTTCTTATCTTTCTAATCTTCAAGCGCATTGCNTCCATCTTGATC
TTGTGATCGTCGACCACATCGGAAACATTCAACTCCAATATCATCTTCTCCTCTTCAACT
CTTTGTAATTTTTCTTTTAAGTAATTGTTTTCTTTTTCAACCAAATTTAACTTCTCGACA
AGAATTTCTATG