| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_1589662
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_20411 |
9 |
2199 bp |
MLOC_20411.7 |
Available |
Available |
LOC_Os08g29730.1, FRAME:+2, EVALUE:2e-39, 13108.m03072 protein intracellular protein transport protein USO1-related, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_20411
Contig Sequence (5977 bp)
>contig_1589662 5977 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGAGGAGGTGGAGGGGTATATATAGGCATCCCCCCAAAATCCAACCGTTACAACATTATT
GCCCAACTCGGTGATACCAAAATGAATCTCGGTGGCACTGAGTTGCACAAAATGTAGCAA
GGTTTAAATTCTCGATGAGAATCTCGGTGGCACCGATTCGATGACCTAGGTCAGTGTCCA
AATCTCGGCGAGGCCGATTTCAAACTCGGAAATGCCGATTCCTGAAATCTGCTCAACAGA
AAGTTGGTCACATGTTTTCGGTGGCACCGATGTGAAACTTGGTGGTACCGAGAGATTAAG
TTTTGGCAAAGGATCTGTTAGTGAAAAAATCGGTTGGTCCGAGTGGGAAAAGTTGGTGGC
ACTGATTTTGCTGTTTTGGCTTGGGACANNNATATTTGTGGGAGAATGACTGAATATTTT
TGGTGGCTATATCTAAGCACTTGAGCAATCAATTCATCATAATACCTCACCCATTCTAAT
AATATTGACTTTCCTATGGACTCAAAAAGTGATTTATCACAAATGTAAAATGAGAGTCCT
CTTATTTGAAGCTTGAGCCAATCCTATTCATTTCCTTGCATCAAGGGNNNNNNNNNNNNN
NNCCTTTAGCCAATGCATCTTTAAACTTTTCTGAAATATNCTTGGATAAGATCATTAGTT
CAGTGATACATATATCGTGATTAATTACCAAAATCACCTTAGGGAGCAATTGTGCTTTCA
CTTATCGAACTATATGTTTTTCAGAACCGAGTCAACCGCAAATCTCGAAGCATCAGGTTA
CATTACGTGTCAATCACGAGGCAAGTTCATACCTTGCAAGTCTTTTGTTTATGCTTTCGT
AAAATCATAGTTACAAAATTCTTTACTTACAATATCTATTCATTGCATTAAGTAAAACCA
TATTTAGTATTATCTAATCATTGATGGGCAATGAAACTCTGAATAATAACACCATGATAG
AAGGTGAAATTCACTAGGAAGAAACAACACAATAGATTGGACCCGGGTTTGTTTACATTA
GTATTCTTGTGTTAGACACGTTGGCCGATTCTTGAACTTTGTGACTTGTTTAACATGAAG
TCGAGTATGTGTTTCTCTGGTTTATCGAACTTGAAGAAACAAAAACCTACTTAAAGAAGT
CAATGAATCTTCGAAAAATTCAATTCATCTCCCGGTAGCACGTGCTTTTGGCACAAAACT
AGTTTCAAAATATCAAAAGAATCAAGACAATTTTTTATGTGTTCTTAATCATATCGGAAT
GCTACCTCCAAATTTTGAAGCAAAAAGTTAAGCATTTTGGCATGAGTAGAAAACAAACAA
ATTTAATATCAAATGTCATCTTAAATTTGTCTTTTCACCGATGAAACAATACCACTATGT
TTCGCATAAAAATTGCCAAGTATGCTTGCGACACTAACATGAACATTCACAAAAAGTTTT
ACAATTTTTTAAAAACATTTACTAATGAATTTATTCTTTGGTCCAGGAAAGGGAAAGGAA
ACATGTCTTCATCTCTAACCTTTGACCCTTTTCCCGTTAGTCACTCTTCCCACCTCTCAC
AGATCTCCTCCCCGCCTGAAGCCGCCACTCCGCTCCCGAACCCTAACCCTGCGCGCTCCC
GTAGGATCCAACCGGCCATCAAGCGGTGGCGCTATCGAAGATGCGGAGCTCTATAGCGAC
CTATCGGGAGAGCCTCTCCCGGCTCGCCGGCGAGGTCGACGACGCCACGGCAGACGAGGT
CCCCGCGCCGTGGCCATCTCGGCGCGGAGACCACGCACCTACGCCTCCGTCGTCCGGGCG
GCGGAGGCGGTACACCCGTCCGGACCCCGCCGAGCCGGACGAGGTAACGGGTCCTTATTC
TATCCACGCATGTCTCGTGTTAAAATGGTCCGAGTGGTGGCTCCCATTGTTTACCCGCTG
CTATTCGTTCGCGAGTTTGAGTGCGTAGAGTTGTTAGATATAAATGGCTTAGCCTGCTCA
CGCCAGATATTAAAAGGCAATTCGAGCCGATGAGCTAATCCTTGCTATTTGACTAGTTTG
TGCGATGTTGAAGTTTTAGTCTGTTAACTGATAATTTTCTTGGAAGTTCACTGAAAAATG
TGAAATAAAATCGTTAGGCTAGTGGTTAGCTAAAGGTATTGGGAAGTGAACCACCTCTGA
AGAGAAGGTATGCTCCAAATGAATGCAATATGTGGTGATATGTTAACTGTGCATATTAGT
CTGATAATATATATGTGATGCAAGTGATGTATATGTTGCTACCAGAAGTTTATTGATTGA
TTATAAGTTTATAACAGGGCTTTTATTAGATGTTATTGATGTTCCAGCACTCTCCAAATG
TTGGATTGCGTAGCAAACTATTATTTGTTATGGTTGGGCGAGGCTTTAATACATGGTTGC
ATGATTTGAACTTGTTCTGAACACATATTCATGTTGTATTTCTATGTGGCTAACTGTGGA
AGTGGAGCAGTATCAGTGCAGGTGCCCCCTGATGCAATAGCATTTTTTGTTGTAGATTTC
TAAACTCAAGGAGGATATTGAAAAACTTCAAACTTCTGAGGCTGAAATAAAGGCATTGTC
TTTCAATTATGCTGCCATGTTGAAGGAAAAGGAGGTATGCATGATTGAAGGTCTCCCCCC
CTCCCCTATTGCGTATCTGTTTATCAGAATCAGATCACTGATGCTGAAAGCATTGCTTTT
TAGATGCTAGACGCGTGCATTGAGCTTCTTTGGCAGCTTAGTGCCAGTAAAACAGTTAAT
TCGTTTAGTGGTAAACTGGTGATGCCATTTGAAAGCACACAATTTTTTGATTAACTCGGT
GATAATGTGGCTCACAATATCTCTGAGCATCCAGCGGTGCATATGTTATGACAGGAGCAA
CTGGTAAAATTTCGTGAAGAAAATGGCTCATTGAGAAGAAGTATGGAGAGCTCTAACTAT
AAGGCAGTCTCAGGCAATTCTAATGTAATCGAGTAATTTGATATCCACATCTAGTATTGA
TCACTTAGCCTGCTGTATGCCACGTACCAACTTCAATTTTTATAGGGTGCTTTGCAAAGA
TCACCTAGCAGAATGCAAAGAAACACAGATCAAGAAAAAACATTGAGCTTCTTAAAGCAG
AATGAGTATGGTGGTGGTGCTTCACAGGTTATACAGCAAAATGGTCCGCACCCATTGCCA
GGGCATTATAAGGTATAACTATAAGCAGTGTCATTACGACATGTTTAATCTATAAATTCA
TAATTTCTATTGTGTTCACGCTTCACTCCTCTCTGCAAGTTATTGACAAGATTGTGTTTT
GTTCTGTCATTACCTGTTAAGAAGAACAGCACGCTGCAAGAAACAACTATTACTCTTTAT
TGAATGCATACTATGTTACAGGGAGATGTACTGGAGGAAGAAAGAGAATATTTTGCTGCT
AAACAGGCTAGTCTTGAAAATGAAATTAAACAATTGAAACAGCAACTCAGGCGCTATTCA
AACAAAGAGGATGAACCAAAAAGGAGGTTAGAAGGTATGTCAGTGCGAAAACTAAGCTGT
TCCAACTTGAAGTAGTTTGCACAACATCTTGTATTGCATTTTTTTTTGGTTTAAATATAT
TATTTCCCCTCAGATGAAAACAAGAGGAACGAATTTCTTCAGCAGCAGCTAAATGAACTG
AAGGTCAATAGAGAGATGGTAAGTTCATAGTTAATATAAATACAAGACAAATGGATACAT
TGATTATCTGCACCTCGGGTCTGTGTATGCTTCTCTACCATTGGAATTCCTGTCCTGCAT
TTGGATGACAGATAGGACTCCATGGTTATATTTATTTGGTTACCCATGTTTTTAAGGCGT
CCTGCCTTGGACGCTTAGGCGGCAAGGTGCCCTGGCGGCACCTTAAATTTTATCCACCTT
ATGCGCTTAGGCGTCAAGGCGCTGGCTGCCTGCTGTAGGATCCCTTACCGCCATCAGCAC
ATTGCTGGCTACATATGGAATAATGAGCGTGCTGTATTTACACTTCCGCAGGTAGCAGCT
ACCACGGAAGAGTTGCGTAAGGAATTAAGTGAGAAGAAAGCAGAGTTGAGATGCCTGCAA
GATGAGTTGAGTACAAGGGACAATGAGCGTGCATCAGATGGATCTCTTCAGAGCCTTCGA
AGTATGGTGATGGCTCTACAGAAGGAGAATTCAGATTTGAAGGTCTAAATTAACATAGCA
ATTGCGTAAATGTTTAAGTAATGCTTAAAAGCGATCATATATTTACTGCAGGTTTATGAA
TATTGTTATGCCATAACTGTAACTAGACTCACTATGTGGCTTAGGAATCTGACAACAGGG
TCTTTACTTCTGTAGATAGCGAAGGGCAGGCTTGACAAAGAGCTCGTTAATATGGAAAGT
ACCACACAAAAAGTTGACAATTGTAGTTCTGATATTAACAATGTTTCTGATGTGGAAAAG
GTAAAATATTCTTCAGTTGGGATTTACGCATATTACAAATCTAATTTGGAATGTGGTAGC
TCATCCGGAAGACACATGGGATAGACTGTTTTATTTGTTAGGTTCAGAGCTTTGAAGTGA
AATTATAACCTTAATGTATACTCCCAAAGTCCCAATTTTGTACTTTGTTAAAGTAAAATT
TCTACAATTTAGCTAGTAAGAGAGCAATCTTACACTGTGAAAAGTAATAGGCTGCACATT
TCTCTATGGATACCTTTTAACCCAAGTTATGGACCTGCAACACATGGTTTGTTAGTGTAC
AATATTACTAAGTATAGATTCTCAAGAGAACAAAAATACTAATGTGCTTGTAGTTACGCT
ATGAAGGTTAAGGAAGAGATGGCTTCATTGAAGAAAGTTTTACAGGGCGCTTCTCATGAG
CGAGACAGAGCATTACAAAATTTGTCTCGGCTGAAGCAACATTTGTTAGATAAGGTAATA
CTCTAATCTCAATTCTTAGTTCCCACACTTGTAATTGAAGCAACACATGGTTGTGGAGGA
GCAATTCCACCTTGCTGCTACAATGTGTAGAACACAAGTGTTAAAGGAACAACTTCAACG
TGTTAGATATTGATCGAGGTGGAGATAGGGCTGATATGTCAACATGGGTTCAATCCAAAA
CTCCTAGAGCACAAGACCTAGTCCAAGATCTTAGATTGGAACACCAAGCTCTATTATAGG
TTGTCGGGTACATAGTTTGGGTTACAAACTAGAGGCGATGACCTCCATTTATAGGGCTTT
CCGGCTTTGGGAAGCCTTCATATCTCACTTCTACTTAGAGTTGAAACACTCCAGAAAACA
TTACTTAAGATTCACCATTCTACTCATAGCTACTTGTACCTAGAAGACTCTAGAAAAAGT
AGCTAGGGTAAAGAAAACAAAGGAAATACTACCTTAGAGTAGAAGTATCTAGAGATAGCC
AAACAAATATGATGTATGATTTTCTTTTTCTATCCTCGTCTATTGTTCCTCATCATTCTC
CCCTGGTTTTTTGAACTCGACCTCGAGTTATCTTCATAGAGCGCTTCTTTTGGATGGCAG
AGAGTCAAGTCCGCAACATTAAAAGTGTTGGATATACCCATGTCGCTTGGAAGATCTATC
ACATAAGCATTATCATTTATCTTCCTCATGATAGAGAAGGGCCCATACCTTCACTGTCTA
AGCTTCCCTTTAACATCTAAAGGCGCCTCATTTTACGGAGGTAGACCATCACCTTATCAC
CAACTTGGAATGATTTCGGCTTCCTTTTGCAGTCAACAAGTTGTTTATATTTCTAATTTT
GTGCTTCCGAAACACCACGAATCTCTTCAAATAACTTGGTGTAATTATTTGCAAATGACA
ATGCTGATTTTGTGATTCCCCTTGATGGTAGCTTCACCAGGTCCACCACATGTGTTGGAA
CTCAGTGTAGACAACGGAAAAAGGACTCCTTTCGTGGATCTATGTTTGTGTTAGGAAGTA
TTAGTATNNNTCTAGGAGTCCTTATTAGTCTATTAGT