Map Locations of contig_158955 (13035 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_158955

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_20394 1 598 bp MLOC_20394.1 Available Available None
MLOC_20395 17 5947 bp AK373407 Available Available None





CDS Structure of MLOC_20394






CDS Structure of MLOC_20395






Contig Sequence (13035 bp)

>contig_158955 13035 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACTGTGTGGCGCGCGCTCTATTTGCTGCAATAAGCGGCGT
GTAGGATCTCCCTTGGCAAATGTCTGAACTCTTTCTTAATTTAAGTCTCTACACCCAAAC
AACGAATAATGGTGAAGACATGGATGCGTTCATGAAAGAACAGGCTACCGCCATTGCTCT
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AAAAAAATATGTAGCAAATCAGCTGAATATTTTGCTAATTCTTCTACGTGAGAGCAACTA
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CTTAACCGCCGCCATGTATCGCATGTTGGGCAATTATCATGATTTTTTATTTTTTACATA
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AAGACACAACTATGCCTCTTAAAAAAGGGAAAATATATTTTCTTTTCTTCCATGAGAGAC
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CCTTCCACGAAAGCACGGTTGTGCCTCATGGAAAGGAAAAAATATGTATTTTTCCTTCCG
GGAGAGGTATAGATGTGCTTCGCGAGAGATAGAGTGCCTCTTTGGTATCGAAAAAGTGGG
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AAGATCTAGTTGGTTATCTCGACGCGAGAAATCAAACGGTGAAAGCAGTTCACGATTTGA
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TTAAAAAATATTAAACCTGCATTGAAAAATGTTAAATGTGTATATAAAATTGTTGGTCAT
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AGCATTTGAAAAAGTTAAATATGTATCAAAACAAATGTTGACCATGTATTTTAAAAATTA
AACATGTATTTAATAAATATTAATCAAGCATTTGAAAAAGGTGTTAAATTTATATAAAAA
TGTTGATAAAGGATTTGAAAAATATTAAACATGTATTAGAAACAATTATTAGATGTATGT
AAAAAATATGTATACGAAAACAATGAAACCCGAGAGAAAACTTAAAAAACTGATAAAACA
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AACAGTGAAAAGATACAAAAACGGGTGAAAAAGCAAAGGAAAAAACAAAACAAAAAAGAC
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AGGGTTTGAAGGACTTTATAGGAAAAGCATATGAACAAAGATTTTAGAGGAAAATTTCCT
ATAAATGCATTCGGTTTGTAGGAAACGCGCACGGGAATTCGAAGGAATGCTATTCATTTC
TTGTGTCTTTAGAGGAATCTATACATCCACTCAAAGCTCATTTTATGCGTAGGAGGGAAG
CAAAACAATTCCTTATCAACTTCCTGTACTATTCCTCTTTTTTAGACAATCCTGTACTAT
TCCTAAATCCTACATTTTGGTTTCCTCCAAAGCCTATGAGGCCTAATAGGCTGGCCGTTA
TTGTAGACACTTATTGTCTTGCTATAAGGGAGATCTAATTGTTGTGACTTTCCACGCCTC
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TCTTCGCCAACACGTTCATGTCTTTTCAGTAATATTATTGGTGCGTAATGGCATAATGCC
TCAACCGGGCCATGTTCTATGTATTAGTGATGCCTTTTTTTCTTGCACCTGGGTAGGATT
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TGTTGCAGGTTGCAATGCATTATACTCACTGAGGTGCAATTCCTTTCCTCTGAATTTGCA
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CTGTAAAAGTGCTCTTCCCAATAGGTCATTATATAGGAGCTGAAATTTTAAGCCATTGTC
TGATATGTATTTTAAGCCATTGTCTGATATGTATCTATAAAGTCAATTATATATGATATC
ATTTCTCGACAAATTTGTATTGCATGTTGCATCTTGGCCATTTTGGAGAAGGCATGTTAT
ATCATTATTACACCATATTATTTCTTCAGTGCCAATTTTATCACTTATTTATTTTTAGCA
GAATGTAGTGTTGGGTTTGGTCCAGCATCTGTTGTGGGAGGAGACATAACACGACTTATA
AGGGCGGGGATGTTCCCTTCTAACAGGCTAGTTTTTTGGGGGAAGAGGGGCCAAGGCCTC
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TGGCTTATCAAAAAAGAACGGACACCAGAAACTGAGTTCATTGCTTTGAATCTCGTATAC
TGTGGTTTAATGTGTACATCTTACAATATTTTGATCCACCATTGGGTTCAAAAGAAAATT
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AACATGGAAGGCCATATATAGCGATCATGTCTGAATTCTGATGTGGCAAATGTGACACAT
CCATTATTTATTTGCGAGACTCCAGAACTGAGGTGAGAACTTTTTCCACTTATTTGTTCC
AGATTTGTCTGCAAATTTAGGGTTCAATGCAGTTGCCCAATGCTTTAGGATATGTCGTGC
TTCACACCGGAAACATGCTTCAGTTAGTTTTGGTAGGATACTTCAATTCATTCCACCTTT
TTCTTTTGTCATATGTAGTCTCTAACTTAAAGATGGTCATTTTATAGTTAACTAGCATAC
ATGCCCGTGCGTTGCAACGGGAAAAGAGAAAACACCCCTCATGTATCCTAGAAAAATAAC
CTCATACACACCCGATGCATCAACAAATCCCTTGAAATATTTCACAATGTCATATGTGAA
ACAACATGATAAGTGATGTTGTGCGAAGACATAAAGGTTGGATAATTTGTAATTCTATTA
AGTCTATTAAGTATGTGAAACAACATGATAAGTGATATTGTGCGAAGACATAAAGGTTGG
ATAATTTGTAATTCTATTAGGTGTATTAAGTGTGTGTGCAATTTATTAGACAACAAAAAT
AATTGTCCTTTTCAAAATATAATAGTGTATCTTCAACATAATTTTAAAAATAATTAACAT
GCGGGGTAATAGCATATTTAGAATCTACCTATTTTTCTGAAGAATTTTTATATATAACAT
GACTAATCTTGAGCTATAGTTTGAAAGATATGGTTTTTTTAGGATTGAAATCTGTGAAAA
GAAAAAGAAAGATTAAAACTATAGTAGGTGGGCCCAAAGTGTAACATTTGTGCAGCCCAT
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GCCACTGTGCTACCTTGCTGCCTCTCAAACTTTGCCTTTAATCCTGAAGACAAATCCGAC
AACGACTTTAGAAGCGGAAGGCTGCGGGCGAGCGGCGACGACGTGGACGGCGGGTTAATT
TCGGGAAAAGCACAGTGGGTTTTCTATAAAATTACAAAAAACGATTCGTTTTCTAACTTA
ATTCCGAACTGCGGGTTGATTTCAGAAAACTACAGAGGGTTTTCTATAAAACTGTCACAG
AAGTGGTAGCTGCTTTATTATTAGGAAAAGATTTTGTTCCAAGTAGTTCTTGTGGTTGTG
GTTAGATGTACCGATTGTAAGTTTTTACCAAACTTTTCGTTCATCTATAGATATAATAAA
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GAGTGAGCGGCAGTTTTACACGTACTCAAACCACTTTTTTATCTGGGTGCTTGGCGTCAT
TTCCTTTGTCTTTGAGTCTTCTTCTGAGCAGGATTCATTTTACATCTGCGACAATTGACG
AGGTATGTAGCGAATGGTTTTACGTACAGTTTTATGTGTTACTCAATATTCTATATATTT
GTTTTGAATGTATCTATGTTCATGTGTATCTACATTCATCAAGTTGATATGAGTGTCCGT
CCCACCTTTGTGCTTGGGCCATGACATCCTTAGTGGAGATAGGGAGAAGTTAGTCATGAA
ACTTGTGCTTAGTCAAAATAAAATTGCAGATTTGTCAGTTAACATGGCTAGAACGGAGGT
CCGCACCGACCTGTGGTTGCAAGACACTCCTGACGCTGTCGCACAGATTGTAACTCTGTT
CCTGGTTAATATTGTACTCCATCCGTCTCAAAATAAATGTCTTAAGCTTAGTACAAATTT
ATACTAAAGCTAGTACAAAGTTAAGACATTTATTTTAGGACGGAGGAAGTACCTACTTCT
TTGGGCATGTCATGTATCGGCAGTCAGTACATCAACATATCGGCAGTCAGGAAGGATTCT
AAAAAAAAAGGTAAATTCAGGAAAGCCACGAGTACACTGGTTCATTTCAACTTCAGTGTG
TGTGTCGACATACCTGAATGCACACCAATATCCTTTTCGTCGCGGTCTGGGTGCTTCAAG
GTGCGAAGAATTCACAGTTATACAACATAAAAATGATGTTGGAACAGCAGACTTTTCTAC
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GCTAAATTCATATCTACATCTTGCCAGAATACAGACTACAGAGTACAAGCATGATTGTGC
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TTCATAAGCTCTGGATAATCTGTTTCAGCGAGCTGGAGGTGCCCACGACCACGAGCCCTA
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TGGACCTGATCTTCAGGTAGCAGATGCACGGCAGCAGCATCGTGGCGGTGCCGCTCAGGA
ACGACCCGGTGAGCGCGACGGCATAGGCAAAGTACGGCACGAGGAGCGCCACGATGGTCG
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GGGTGTCCTCGATCGCCTCCGCTATCGGAGTGACCAGCAGCGCGAACTTGGTGAACGGGT
TGATCAGCGTGGTGTAGATCGCGATGCTGGAGCTCAGGTTCCTTGATGGGAGGTTCAGCG
TCACCTGTGACTTCAGTGACTCGCCATACATCAGGTACCCGACGACGCCCATCAGTCCGT
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AAGGTTGTACTATTTTGCATTGACTATGAGCATGTAAAGTAAGATTTACCAATAATAGTT
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ATGCCTCTCTCGTGGAAACCAACACCATCAAATGCTCCTACCCAGATAACAGCTGCGATG
AGAATGACGGAAGCCACGATTCCTCCAACAGAGACGTATGCAAGCGCACTTAAGCTCCGA
AACCATGTTGTTGGCAAAACTAACAGGCTGAAGATCAGAACAAACCCTTGCTTGCCTCCA
ATCTTGAGCCCAGCAACATGGAAGTCGACACTTGGAAATAATTTCTCCAAGTTATCACCT
TCCAATATCATGAAATCTATTGCCACAAGGTACAGCTCCAGGTACATGAATATTGCTACT
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GAGCTTGAATCTATGCATCTCTGTAGGAGAATCCCAGTGTAGAAGCAAATAACTGCTATA
GTTGTGAACATAAGTACGCTCAGCCATCCTCCTTGAGACAATGCATAAGGAATCGATAAT
ATCCCAACCCCTGCAAAATAGAAAGTTAATACTGCAAGTTAGCTAGGTTAAAGAGGACAT
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AAAAAAAACAGAGAAAGAATGGAAGAAACCTGAGAGGGCGTTAACTCCATTGAAGCAAGT
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GCATGCCCCAGAGATTAAGGAAGGAAAGACGCCCATCAAAAATGCATGCAGCAGCCATGC
AAAAAAGCAGGGAACAAGTGAAGTTGCTCCATCTTCTGAACACATGTTAATAACTAGGAT
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GGATTATACAATTCAAATATGTTTAAAGGAAGGCTAGTACTTTCTTCTTTCTTGATTGCA
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AGCCATGGCATGGGTGCTCCTTAATAGCATCATGTCAAATAGATTACTGAAAATAATTAA
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TTAACCTTAACCCCGACCAGCTTGCCTTTTCAACGTATCTGAATACATTACGTTTTACAG
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TTACTGTTAGAGAATATATATTCCAAAATGACCTTCCTATGCAGATAGAATAAAAACCTT
ACACTTCCCACTCTGTTAGAGCACATATACAAACCCTGTAGAATAAATAAAAAATGTTCT
AACATGAGTAAATTGTAGAAGTTTGAATAATAAGAAGCAAAATTATGAAGCACCTTGTGC
TTCATTCAAATCATTACGTACCTGCACTAAGCAGAATGATGGCAGAAGACTGTATATGTG
GCCAGAACCTCATCTTTTAAAAAATAATGACACTTCCCACTAGGTGATGTCTCCAGTCTG
ATGATAACAAAAGTTTGTTGCACCCAACAAATGTGCCAACCATAAAGCTTTCTGCTACCT
TGTTGCAGCTAGCCCTAGGCCCTAGCTAATACATAAAACATCACAGTTCCAATGAATTTG
CCTATTCTACATCTGGTGGGATCATATCAAATAATAAGTGCCAAAATAATATACCATATG
TTTCTGCAATCAGAAGAATTTCACTATTTGTGGTTCAACTGCATTATTTAAACCAAAGCA
GCTGAAAAGGAACCGCTTAGTATTTAAGCCACAGGGGTGTGCTCTTGAAAGGTGCCAGGC
CAAGTATATAAAGCACATTGCCTGAAAGATTCCAAACGTAAGCACTTGAAAAATCATTCT
ATTTTAATTGTTTGCCAATAACAAATACAAGTTCTGTGCCAAAAGTAAAACACTACCAGT
CCCACGAAAATGTAAGGAGTAAGCATTTTGTGTCCAGGGGAAACCACGTTGTTGTTTTGA
AAGTTCCATAAAGTATCACGATACAATGTTTCAAAATTCCAGAGGATCAGTATCATTTTT
TTTGACCTGCAATCAGTGTCATATTCGTTCCTGACCATCAAGATTTCAAGATACAAGAAA
GACAAAATGACAGTCTTAGCATAAATGAAGAGTGTAAGAATGACTGTTTGTCTTTTCTGG
TCCTTGATATAAGAATGAATTTGACATCAAACTTTAGCATTTTTATGTATTACATTTACA
TTCATGAATTTTGTTAGTATTCTTGGAACATCGTATCATCACTTTTCGCCATTGGAAAGT
GGACTAGGGCACAAGTCAGTTTTCCAAGTACCGCTCATGCAAAGGATGTATCAAATTAAC
ATACACAGAGTTATCTGTTCTTAGAAATGAAGAGCAGAGCATCAGCAAGCACATAGCATA
GTTTAAGTTTTCCAATACTTAGGTCTGAAATTGATCGGTTCTAAAGCACTCCGATGAGGT
AACACAAGAGATGACACAGTGGTCTCCCTCATGGTATCCTCTTGAGTCTTCTCAACCTGT
TAAAGTTGCTTCGGGTGGTCCACTATGTATCCTCCTCAAGATTCTAAAAGTAAATCTCCA
TCACCACAAGTGTCAATTGCGTACTTCCGCACGTATCAGCTCAATATCGCTTTGGTCGTA
GCTAGAAGCTACATCATGCATTTGTGTTGCATTAAAGAAAACATATAAATTATGTTAAAA
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CAATGGAAGTGGAACTTGGTTACATTTACTATTATTACAGGATAGTCCCCTTTATAAAGG
AAGGATGCAGACCTGCAGATAGCAAAAAAGTTGCCACTCCCAGAGATAGCCGGACACCAG
AGTTGTCATCAAATATAAATCAGCTCTTTGTGAAAGCTAGAGGCATATCAAAGAGAGGGT
AAATGAAGTGTGTTCCTCAAAGGAAATAGCACAAGACATGAAAATTGTGCTCAATTTCTT
AAAATGAATGTGCTAACAAGATAATAAAAATAAAGCAATGAAAGCTAGCCAAAGTTGATG
GAGGCTGTAGCAGCAATGGGGTGATCATGATTAGATATTCTTTATTAATGGTAAAGTTAG
CAGAAGATGCTAGGTGAAAAGCAGTAGAATATTAGCTTTTTTTCTTCTCAAAGGTAAGTA
GCTTTGCGTGTGTTTTCGGCCTACATTTCCAACATTTAGGGCCTAAATAGAGTGCCGAAA
CTTCACATCAACTTTGCGTAGAATAATATGACGCCCGCAGAAATTCCACAACAAAACCTC
ATGTTCCATATTCCAGAATATTATGTTTGGGCGGAAACAGGAAAGTGCATCAAAACCAAT
GATTTCAAGAACTTCTGAACTGATTCGAATAATTAGGTAGGTGTGGTCCTTTCAGTAGGA
TAAGGTCCACTCCGAAGACTAACCCTTTGCTTTTCTGGTGGACAGGTGGAGTCTATAATA
ATTGATGCAAAAATCACGATTATTTTAGCCGAATTTGAACAAACTTCATTTAGGGCCTAT
ATAGAGTGCACAGACTTCACATGAGTTTTGCAGAGAATAATATGCCTCCCCCACAAATTC
TTAAAAGAAAAGCTCATGCTCCAGATTGCAGAATACTATGTTTGTGCAGTTAGGTGTGGT
GCTTTCTTGGGAGAACGTGGTGATGTGAAATACAATATGTTCTTCGAGAGTTGAATAAAC
TCCCCTTGGAAGACAATCTTTCTCTTTTCCTTTTTGTGGTGGGAGGGGTGGAGTCTCAGA
TAATAGAAGCAAATCACGATTCTGTTGGCCGACTTCGAGCAACATTATGCAATATAGCTT
TGATGGAGAAGTTTTCGGATTTATCCTGGTCATGGCAGACCACGAAAGTCCCGACATATT
TCAGAGGAGAACTTAAAGGTGAAAGTCAAGGGGAAGAGAATCATGAATGCGCACCTACTC
AGCAAGCACATAATAGCGTGCTGCCCAGTCCAACCCAACTGCAAGTGAAATCTTTCACCC
TGTGCCTCCCACTGTCGCCGGCACTTCACTCTCATCCGAATTCTTGCCAGGCCCTCTCAG
ATTTCTAATCCGTCAGAAATCCCAGCCCCTCTGACATGCCGCCACGCCCATCCACACATT
GTGCGTCACCACTGAAATCAAGTGAGGAATTGCGCTGGTAAGGGGGAGCACTCGGATTGC
CCGTCCAGCCAACGAACTGAATTCGTACCAGTTAGGCAGCGGCAGCCACTTACAGTTCGG
TTGGCGCCCAGCAGCTCCGGCTCCGGCATCGATTCAGATTCCGATGCGCCCCCGCGTGAA
ATACCCACGGCGGGACGATGGCAGCACGGCGCCCGTCGACCAGCAGCGGCGGCGGCATCA
GCCACCAGCGGCGCACGCCCGACTCGAAACCTGAAACGCACGGGTGAAAGGAGTCAGAGA
GCAGAGGAGAAAACCAAGCGTTGGTCACACATGAACTCACCGGAGGCAATGCGAGGGGCA
GGCGCTCCGTGGCATCCTGGTGCTGGGAGAGGGCGAGGGGGCGAGGGGCGAGGGGCGATG
TGGTGGCCGCACAGCCGCAGTCGCGGGCGGCAATGGCGGCCGGTCGTTTCTATGGCTCCC
CGTGAACCTGGTCAACAATTTCTCAAAAAAAAAAAAATCATTTAATTGTTTTATTTCTCT
CCCTAACCTTTATCTTTACCTACTAATAAAGCACGGATAACTTATGTCCGTACGTCATCG
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TTCAGTTTTTTCTTTCACCGGCCCGCACGTATTATCTGAACCTATGCCGCCATATTATGT
CCATAGTAAAGGACTAGCAGGATGGAGAGAGCCTTGCTCTTCTTAGCTGAAAACCCAGGT
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CCGTCGACTGGAGCCCTGGTCGCCACCTTGTCATATGTTGCATATGACTTTCGGTGAAGA
AATCAGATGACCTAATGCGGACAAGCACGGAATGAATTAGATCGGATTCATTTCAAATCG
CAACTAGGTCGGGATGAGAACGACACCCCTCCGTTTCATGGCCGAATCCGGCGGCAACTT
GAGGTCCGTCGAGCTGGAGCTCATGGGGCACGGCCATGGCTCCATGGGACAAATCCTGAG
GAAAAGAGAAAGAGA