Map Locations of contig_158914 (8287 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_158914

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_20312 1 635 bp MLOC_20312.1 Available Available None
MLOC_20314 2 1907 bp MLOC_20314.2 Available Available LOC_Os03g29470.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-42, 13103.m03388 protein transcription initiation factor IID, putative, expressed
MLOC_20313 1 625 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_20312






CDS Structure of MLOC_20314






CDS Structure of MLOC_20313






Contig Sequence (8287 bp)

>contig_158914 8287 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATGTAGAGTTGCTTAGCTTATTGTAACTAAGCCTCCTTATTTAATGCTTTTGCAATTAA
AGTTGTGCAGGCATTGGTGCATTTCTTTCATTTAATTGCTTTACCTAGGTTCACGCGCTT
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TGGCTTCTAACCAGTAACTACCAATCTACCATGTCTGAAGCTTTGGTTGACTGCTGAAAT
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TTACAAGCTAAAAACAAATCACTTTCTACAACTCGATCTTGAGCTTCGCAAGTTTGAGCT
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TATTCTTGCCCCCAATCTGAGTTCAAAGGTTGAGTCCCACGCGACACATATTCTTATGGA
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AGTTTTTTTCGAGATTGAAAGGGGGGCAAAAACCCCACCTCTTGTTATATTCCAGCTCGA
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AAAAAAGGAGCACACATTACCTTGAAACATGTTAAGAGGTCGTCGAAAGCCTCTTTCAGT
CCGCTGTCAACGGACCAAATACTTATTAGAACCGCTCTCAGGTGAGCACAATCTTCTCCA
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TCTGTTGTGAACGGTTCTGGGTGCGAAATGGCAGTCTCCCTCTGCGGAGAAACTATTGCA
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GGCTCTCCCTCCTTTCTTGCCACGAGGGATTCATCCTCCTGGTCCTTTGCGGGCGAGGTA
TTAGCCTCGTCCATGATATCGTCACCTCCGACCTTGGTTTCCAATTCCGGGAGATTTTGT
CGAGATGCTAACTCTCCGATCTCATCGATGGTTGTGTGAACCGGTCCCGCTTTCTGCCAG
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ACAATGCAGAAAAAGGGCCTTAACCGTTAAACAACAACATCTCAGAATTGTAGTATGTTC
GGATCTTTGATAATTACCTTTGCGCTCAGGGTTTCACCCTGAGGGTCCTTCAAGGGACCA
GTTCATAATTCTCGGATTTCTCGCTGGAACCTGGGACATCATCAAAGAGGGCCGCGGGGG
CCCTGCATTGGCCCTTTGGAGCAAAGGGAGCTAGATCTCCCTCGGTGTCTTTGGACGTCG
CTCTCTTCTTTGTGTAGGTGGAGCCTCTCTCCTCCTCCTCGTCTTCTTCCCCCTCTCCCT
CCAGATGAGAGGGAGCAAACATGTCCTCGCACCTTGTGTCATGTGGACCCTTCAACCAAA
GACCCTCTCGGGCCTTTTGCCTGTCCTTCTTCTTTTTGTCCTTCTCCTTCAGAGCCGTGC
ACGACTTCTCGTCCAACACGACTTCTCTTTTTTGCTACTACGGTGATGAAAATTTGCTAC
ATCCCCCGGGGAGAGTCAACCCATGTAGTGGGCGGCTGGACGCGTGGCAGCCGTGATAAT
GTTGGAACCGGCTTCAAGATTTGCTACAACTGGCATTTCGAATTGCTGGAACCGGCCACC
ATGCATGTTTGTTGCAACCATTGTCACAGTGCAACATTTTTCCTTCAACCAGTTGTGTCA
TTTGATTCAACCATCGCCGTTGAGAGCTGCAACCACAGGTATATCTCTTGCGTGTGTGCC
GGCGCCGACGAGTAAGTCCGACAAGGGTGGGGGCGGCGACGAGGACGGTTGGCAAGGGGA
CCGACGACGAGGATGGGGACCAGCGATGAGGATGGCCACTGGTAGGGACAAGATGTGGAT
GCATACTGAAGAAGAAGAAGGTGCAGGGGTATTTGTTTTTTCTTCAAAAAGAAGAAGGTG
CAGAGCAAATCGTTTTTCCCAGGATCCAGCAGCCGCGCCGCTCACATACAACAAATGGGA
TGCAACCGACCTAAGCATTGGACCGCCGCGCCGGCGCGCAACGTTGCTCTAATGATATTG
CCGGTCATCCAAAATAGATATTGAGGTTGTTTGTCACCCTAAGATAGATCCAGACGACTT
CTTTGGCGAGCTCCTTTTTTCAAGCGAAATATGACGAATTAAATTCTAAATTCGATTTAC
ATATAGCTATTGTGGTCTCCTTTCTACGTAACTAGTAAGTTTGCATGTGCAACGTACGTA
TCACAATCTATAATAAAACATTACTTAATCTTATTTATCAATTCTTTGTCATGCCATTTA
AATGTGT