Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1588491 (1905 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1588491

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_20200 2 1354 bp AK249530.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_20200






Contig Sequence (1905 bp)

>contig_1588491 1905 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCCTCCTCCGTTGGTACGTTGTACCGGTCATAACAGACCCATGGTAAGTATTCTCATAT
TGGAACAAATGTTTCCCATTTGATGGTAGATGTCCTTGTAGCATGTTGTAAAGCTTTAGA
TTTACCCATTACAGAAGTGTTAGATTTTTCGCAGGATTCCACAGATGACATGTAAAATGA
ATATTTGCCTTACCTGTTTATTATTTTAATAACGGAACATGTGCTGACTTGTAAAGCTTT
AGATTTACCCATTACAGGAGTGTTAGATTTTTCGCAAGATTCCACAGATGTCATCTAAAA
TGAATATTTGCCTTACCTGTTTATTATTTTAATAATGGAACATGTGCTGACTATCTGCAG
AGAAATGGGGTCTTATTTATTAGTGGTGATGTTCATTTTGGAGAAATTGCTCGTTTTGAC
TGTGGTGCTCAATATCCATTGTATGATATTACCTCAAGTGGTCTTACCCAGTCTGTCGAG
AATTCTGTACCAGCAGTACTTCAATCTGTCATGAGACTTCTGGCTTGGCTGACACCAACC
CCCATGCGAGTCTTCAGCCCTAACTGTCGTCACAAATCATGCTCATATGGTAAGTTTTCA
TTCCCTTTGAATATCATGACAACATATACTCCCCTAACAAACAATTACCGTAGGATGTGA
TTGAAGTTTTTGGCTTACCCAATTGCCTTGCTTCTACCATATTACAATATGAAGGTTCTT
TTCGCTTGCTGGTGTAGTTGTAATCTGTTCCTTTGTTTATCCCATCTGCATATTTAGTAC
TTGTAGCTTCACAAGTTTTTTCTTCAAAAAGCTGCTGTTTAATGCTGTTACCATGAAACT
ACGAGTTTTCAGCCCATAATTTGTTTATTTTCTGCTGTGGTTTGAGTTGTTCTTGTACTC
CTTCGTCCTTCTGTTGTTGTATGTATCAGGTCAGCCAAATTTTGGAGCAATCGAGATAGA
TTGGAATGCAGTTCCTTCATGGGTTAAAATTGAACTAAGAGATTTACAGGGCAATTCGGT
TGATGGTGTGGAGTTCCCTATATCTGAGCTGAAGCCATCAAATGCGCATGCAAACAAAAA
AGAAGGGCATTCTTTTGAAGCACATTGTAGTCTTGAAACAGAGCTTTCATGGCTGGTACG
GTACCGCCTTGCGCTGCTGTTCTTTGGCACCATTGCCGGTATGCTACTAACATCTGATCT
CAACATTTCAAACCACGAATTCTCTCTTTCCTCACATTGCAGCACTTATTTAGTTGTATG
TCTTGATGGATTTCATATGCTACCTGCAGTTTTTGTCGTTGTGTTGGTGCTTCTCGTAAT
CGCCTGCTGTTCAGCTACTAAAATGTTCACTAGGAAGTGCAAGATGGCATAGCTACACAT
GACAGAGGACAAGGGAAGGGAGTTTTCGATCAGACTAGTGTTGTGAAAACTGAATTGGAC
ACTGACCAGGTGAGCAGGGATGTTGATTGGCCAAGGATCAACATGACACTTGATTGTGAA
TATAGCATGATGCGAGCACATACTGGACAAGTGTGACGAAGCTGTGATGAGTCTCCGTAT
AGCATGGTGGAGAAATGATGTCATGGAAATCCCTTTGGTTAACAATGAATGAATGGGTAC
AATACGGGTTTATCTGTTTGTTTTATATATATATGCATTTTTGTTAGGACCCTAGTAACC
AACGAGCGTCAGCTGGGAAGGACGACAATTGCGGAAGATTTGCATGGCAATTTATGTTGG
TCTAGGATGACAAGCTTAGAGCATGGTTAATAGTATAGCCAACTACTGGCTATAAGCAGT
CTTATAGCTAGCTTGTACAATAATTAGCTATAAAAGAGTACTATTTTTATCATATATGAC
ACACCTTTCATTCTCACAAAGCATCTAGGAGCACGTGTTAGAGCT