morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_158825
Source Contig contig_158825
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_158825 (6308 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
		No map location
Predicted Genes from contig_158825

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_20146	2	2436 bp	MLOC_20146.1	Available	Available	LOC_Os07g44660.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13107.m04702 protein FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed
CDS Structure of MLOC_20146

Contig Sequence (6308 bp)

>contig_158825 6308 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATAATCTATCTTCATAATCCAGATTATCATAATCTATTGTGGTTCAAACATGGCTGGCT
ATTGTTGCAGAAAAGCTTTCCAACTAAGATGATGTTGCATTTTTTTTATTTTATAATTTA
TACAACATTAATGATATTGCAAAAATATTTCTTATAAAAAATTGAATGTTGTAAAAGGCC
GTGAAATCAGCCGGCTGAGTAAAATCCTTTTCCTATTAATAGCGGTTATTATGGCGACGA
GACGGACACGGCAACTTTCCTAGGGTCTCTTGCATGTCGCTTACAAATGGGACCCAACCG
AGAAAAATAAAAATTACTATAGTGAAAAAACATGTCACCTTCTCCACGAAAGAAAAAGAA
AAAGGAAAGTATATGAAACCTATACGCAGCAGGAGAGATGAGTAGAATCCTCAAAAAAGA
AGAAGAAAAAAAGGAGAGAGAGAGATGAGTAGATAATGATGACGCGGGCGATCCTTGCGC
GCGAGCCGAAACGGAATGGCTCCGGCATGGCCGCTCCCGATCTCATCCTAGCTGGATAAC
GCCGTCCTTATCCCACCAACCCAGTCCGCCTGGTCTTCTACTAATATTTGTTTGTTTGTT
GATCAGTCAGCCCACTTCGGCGCTACCGGCTCTCCCTCCCCGATCCATCCGACTCCTCCC
CCTTCCGTCGCCGGCCGTCGTACCCGCAGCAGCAGAAGGGGATTCGCGCGGGCGCCGACG
AGGCGGACAGGTCACCGGCAGCCATGGTCGGGCGGAGCTCTCTCCCGGATGGGGCCCTCT
TCCTCGGACTCGACAGCTCCACCCAGTGAGCCCTCCTTCCTTGTCCCTTTTCTTGCGCCT
TTTCTTCAGTAGCTTTTGGCTGTTTGGACGCCGAATCGAATGGTGGTGTGAGGTTGAACT
GGAATGCCTTTCGTGGAAGATACATGTTGTTGCGTAGAATTGTACTCTTTGATGATAAAG
ATACTATCTGGTTCTCTAGTACTTATGGTGCCTAAACTGAAGATGTTAGATGTAAGACAG
TGGTACGTAGGGATAGGGGTTTTTTAAGTTCATAATTCAAAGGTTTCCACACAAGATTGA
ATCTAACAACAAACAAAAAAACAGAAATGTCAATGAGAATAGCTGGTGCGAAGATCTAAG
CCAACGGATGTATTTAAACGTGTATTTCAGTGCTAGATCCATCCGTTTGAGCGTCAACTA
ATATGGAACGGAGGAAGTATGAGATATGAGGTTTCATGAATGCAGACACTTGTGTGTCAG
GTTCTGCCGTTCTGGGTTCAGCTCTATGGCCATGCTAATAATGATGCACCTCGCTCCTTT
TAAACCATGCACAGGAAACAGACCGAGGGTGCAATTTGGGCATGTTGTTTCTTTCTTTTA
GAACCCGCATGCTGATAAAGCCTTGAACGATTTACCAGACGATGCACCCGCCATTTGTTT
CAGATTTGCTTATTCATTTTACCTTTTGTTACCATGATAATTGTGCAGTTTACCACCATT
GTGGGATCTAATTTTTCAATCTTATGTTACAGGTCTGTGAAAGCTACTGTGCTCAGCAAT
GAGTTAATAATAGTCGCTTCTGAAACTGTTAATTTTGACTCTGAGTTACCGCACTACAAA
ACCGAGGGTGGGGTTTACAGAGATCCTACAGATGACGGCCGTATTTATTCACCAACCATA
ATGTGGGTGGAGGCTTTGGAACTGCTGCTTGAGAAACTAAAACCGAAGATCAACTTCAGT
AAGGTTGTGGCCGTTTCTGGGAGTGGGCAACAACATGGCAGCGTTTACTGGAAGAACGGC
AGTCAAGCTGTGCTGTCTTCCCTGGATCCTGGTAAGAGCTTGGTATCCCAGCTTAAGGAT
GCCTTTTCTACCATGGACTCGCCAATATGGATGGACAGTAGCACTACCAAGCAGTGCAGA
GAAATAGAAAATGCTGTTGGAGGAGCATTGGAGTTATCTAAGCTGACAGGGTCTCGTGCG
TATGAGAGATTCACTGGGCCCCAGATACGAAAGATCTACCAAACAGCACCACATATTTAT
GAAAATACCGAGAGAATATCTTTGGTGAGCTCATTCATGGCATCTATCCTTGTTGGATGC
TATGCAAGTATTGATGAAACTGATGGCGCTGGGATGAACTTGATGGATATAAACAAGAGG
ACCTGGTCAAAAGTTGTTTTAGAGGTTTGCCCCTTGCCTGTTTAGCTACACCAGATTTCT
TGAATGGATTAAATGTAAAAAATATTTGAAATAAATTTCACATTTCTCTAAGAATAAAAT
ATCAAATTGTGCACTTCTTCCTCCAGGCCACTGCTCCTGATCTTGAACAGAAGCTGGGAA
ATCTGGCACCGGCATATGCAGCTGCAGGTCGAATTTCTTCATATTTTGTAGAAAGGTGAG
TTATTGTTTTACTGCTGCACTCGTGTGGTGCATCTGTAAACATATGGTTACTTATGCCAC
TTTGTAATTAAGTTTAAACCTGCAAAGCTGTAACTCCAGTATTTTCTGTCAATCCTCTTT
TTTGCTGTCAAAGGGAATCTATTAGTAATAGGATTTTAGGCACCCACAACTATAGAAATA
ATTTGTCAACATGTATGCTAGCTTAATGTTCTCAACAAATGCCATCCTAATGGCAGAAGC
AATGAAGATTATTTGCAGCATCATCCCATAAGTTTATTGATGCACTATGCATTTGCAGGC
ATCAGTTTGACAAGAACTGTTTGGTTATTCAGTGGTCAGGTGACAATCCCAATAGCCTGG
CAGGTACTTCACTGTTGTTTCTTCGATTCTTTCACGAGTTGCTGGTGTTGTCATTTTCAA
TGCAAATGTTTTATCATTTAACAATCACAGCCCAATTAGCAGCAAGTGATTATTACTTTC
CTCTATTCATGGTTAACATTCCATTGGACAATTGTATCTGTTGTAGGTTTAACACTGAAT
ACACCTGGAGATCTTGCAATCAGCCTTGGTACTAGTGACACAGTGAGTTGCAAGTATCCT
GTTTCAGTTGTGTTGTATTTTCTTTTTCAAGACGCTGTCATACTTATCTCCTAATTGTAT
TTTAGGTTTTTGGGATTACTGCCGAAGCTAAACCAAGCCTTGAAGGCCATGTTTTTCCCA
ACCCTGTTGAACCGGATGGTTACATGGTGATGCTATGTTACAAAAATGGCTCATTGACCC
GGGAAGGTATAAAACTGTTATCCTTCTATCTGTATTGCGATGTATGGCATGAGGAAACTA
CAATTGCAGGATCCATGGAACCCTGCTTTTAAAAACTAAAAAAAAATATTTTGGAGTTCT
GTTAATCTCTGAAAAAAGATTACACATACATGCAGATGCTCACTATGTACAACAACAACA
ACAAAGCCTTTAGATGCTCACTATGTTAGCTCAAATAAAAATATTTATTGATGAAATTTA
CAAGTATGTAGGAATATCTGTATATTCATGTGGGATTTACAAAAATTTCTGAAATTTCTA
AATATGGTTTGTAATGTTTGAACATTCTGGGTTCCATGTAGCCTGGGAGCCAAAAATCCA
CACCCTTCATGGCTTGCTACTATTACTTTGCTTACTCCCGATGTTATTTCAGATGTGCGG
AATCAGTGTGCAGAAAAATCGTGGGATATTTTCAACAGCTACCTAGAGAAAACACCCCCT
CTGAATGGTAAGTTCTTAGATAAGTTGTCTTGGTCTTTCCCGTTGCAGTATGTTATCACA
TTTGCTTTCAGCGCATATGAATTAGTAACAATTTGAATGGATTACTACTGTCTCAACTAT
AAATTTTCCAGGCCTGCTAACTTTCTGTAGTTTTGTCGTTGGTTAAAAACTTGCTCATGC
TGATTTTCACCATGACAGTGAATGAAGTGTGACTCTTAAGTTTTTGACATAATGAAATTC
ATCTTTTTTTTCATATAGGTGGTAGGTTAGGATTCTACTACAAAGACCATGAAATCCTGC
CTCCTCTTCCAGGTAATCATGTAATAGTGTTCTTAAGTTTTTTGACCATTTCTCTTGTGA
GTTACTATAACCTTACAAAAATTTGCCTGTTGAATGCAGTTGGTTTTCACCGGTACATTG
TCGAGAATTTCAACGACGCCTCCTCTGAAAATCTGACAGAGCGTGAGGTGCAAGAATTTG
ATCCACAATCTGAGGTATGTTCAACGGTCTTGTCTGTCTCTATCTTTCTACAATACTAGC
GGCAAACAAACGAGTCATGCGCTTATTATTCCTTGCGCATAGGTCCGTGCCATCGTCGAG
GGTCAGATGCTGTCGATGCGAGGGCATGCTGAGCGGTTTGGCATGCCCAATCCCCCGAAG
AGGATCATAGCAACCGGTGGGGCATCCTCCAACGAGAGCATCCTCAAGTTGATCGCACAA
ATCTTTGGCTGCCCTGTCTTCACAGTTGAGAGACCGGGTACGTTAAAATTCTCTCTTGTT
CCAATGTAAAACGTGCACAAGCTCATACGCTAAAAAAACTTACGCTGCTTCTGGAACTGG
AACAGATTCGGCCTCACTGGGTGCAGCCCTGAGAGCCGCCCACGGATGGCTGTGCAAGGA
GGAAGGAGGCTTTGTTCCCATCTCCCGCATGTACATGGGCAACCTGGAGAAGACCTCGCT
GGGCGCAAAGCTGGCGGTCCCGGCGCCCGAGGAGGAGGGCAGGGAGCTCCTGAAGAAGTA
CACCGCGCTCGCGAGGAAGAGGATGGAGATCGAGAGACGGCTGGTGGAGAAGATCGGGCG
TGCGTAGAGATACTAGGACACACCATACGGCGCTTGGGAAATGGGTATAGGGATTATTAG
TAGGAGGTAATAATCATTAGTTCAATTGATAATGTCGCGCGTGTCAACCGTTGATGGATT
ATGTCGCGGTCCTGTGCACGAATAATTTCGGATATGTTCGTTATGGAAAACTGTCACATG
TCTCTACTTCCTGGGTTCTTCTAAATCTGAAGTGCACAAAATGTCCTAACTCGTCTTGCA
ACACCTAGAAGGAGAAGACGCCTCAAGCGTGACATTTCGGTATGTACTCCTTCTAGTTTT
CTCCAACTATAAATATTATTTGAATACAAAGAGAGTATCACCTTAAGCTACAGAAATTGC
TTTTGAAGCTCGGCCTTCATGAAGGCTTTTAAATTTGAAACTCAAATTTCATGAAAAATC
ATAATTTTACAATTAAAAAAATTCTGAAAGAATACAAAGATAAGTGAGGACGTAACACAC
ATGTATGTAAATTTTAAAGAAAAACATACATTGAAATGAGGGTTGTACAAAAAAGACAAC
TCTGAGGTTTTTTAACACATGATACTATTCATCGTTTTATTTATGAATTTGTTTTTTTTG
CAGATCGTATTTCAACGTATTTCATCCTAAAATTTTACACACATATGCATGACATCCTTC
TTTACTTGTATTTTTTTCAGATTTATTGAAAACCAAAAAATTTGAATTTTGAATTTTTCA
GTAATTTCGGCCTTCATGAAGGTTGAGCTCCAAACGTACCTGACATGGATACCTAGTTCC
AAAAGAAGAAGATATCACAAGCATGATATATTCCAATAAAAAAAGGAAAAGCTTACTATT
AAGCCGCGGATCGCAGCTGCATGACACACGTCCATATACCTTCCGTAGTTGACGCACTTC
TACATAGACTATGTTTTTAAAACATATATTGTGTTGCAATGGTCTACCACGGGTCTATGT
GTTGACACACGAACATGTCACGCGTACCCTCGACGTCGGGTTGATGCACCGCAACTCACG
TCGAAGGAGACTCGACCGACAGCGCGATACGCAAGACAGTCAGCGGGTGCTTTTGAGAAC
CCGAGGCCCCACACGTCCGGGAGGGACCCCGTCAGTGAGTGCGGCAGCTATGAGCCGCTC
TAGGTCAATTCGCTCGTCCCTAGAGCCTCGGGATTCGCATCTTTCAAACTCGAGGAACAG
CGAAGAACGAGAGCTAAAACGTAGATGAAAAAATAGTATATTGATGTTTCAATTGTGTGT
TGTTTCAATCGGCCATCNNCTCCAATATATATAAGAGGCGGTTGGACTTCCCGCAAACGA
TTCATCTAGGTTCACATCACGTCCCAGAGTCGTAATTCTAGTCTAATTCGGATTCGGCCC
AAATCTGGCCCAATCTTCTGTCCAATTCCTTGCATGGGCCGTGGAATCTGCATATGACCT
TCGATGGAGACGGTCCAAACACCAATTTTGTGCGTCTCTATGTGTAACATCCCAAATTTC
CTAATTTGGAATGTTTACAATTGTAGCTAAGCATCTATGCATATTGAATGGCAATAAAGA
TTTGCATT