Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_158775 (8288 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_158775

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_20051 3 769 bp MLOC_20051.2 Available Available LOC_Os03g61019.1, FRAME:-3, EVALUE:1e-40, 13103.m06704 protein mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim, putative, expressed
MLOC_20049 2 714 bp AK364134 Not available Available None
MLOC_20050 1 1369 bp AK364134 Available Available None





CDS Structure of MLOC_20051






CDS Structure of MLOC_20049






CDS Structure of MLOC_20050






Contig Sequence (8288 bp)

>contig_158775 8288 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCGGGCCGCCCTTCTCCTCCCCTCGTGCTCGCCGATGCGTTTCGTGTTTTCCGGCCGCGG
TTGGCGGCGTCGGCCCCGCATTTGGGGGTCCTGGCCTCCTCGCGTTTTTTTTTTCTCGGG
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TTGCTGATCCCGACGCGCGCGCGCACGCGCTCACCTGTTTGTCTTCGTGCCCCCTGCAGA
GAACGGCGCCGCCGGGGAGGACGGCAGCGGCGTCCCCGTCTTCGCGGAGTACAGCCTCGA
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GAAGGCGCCCAACGTCGTCTACCGCGGCACCCTCTTCAGCTCCGGCGCCACCGTCGCCAT
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TTCTCGTGTGCGCAGGAGGAGGCCAGGGCCGTTGGGCTGCTGCGGAGCGGTCGCCTGTCC
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ATTCAGTGACACGGTACACCACTGGAAAGGGCGACAAGCTGGGGGTTCCCTTTTCAACAG
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AAAAACGGAGGAGAAACATGGAGACGGTGTCCTGCTACAGAAAATGCGGCTACTGCTTAT
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TGCCCGAAGCAGGAAAAAGGCAGTGTGATATTATTAGTATCTTCTATAAAAACCACATAT
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CCCATGTTGAGTTCAGCTTCTTTATGCCTGTTGGAACAGAACAAATGACAGGAAAAAGCC
ATGAAAAGAGGATAGATCTTTCTTGTGGTTGTCAACCAATGAGTTACAACGAAAAGGGAT
GATTGGTGGAAAGTTGGACCACCAGTCGACTATTTTAACCACCTTAGTTGAGCCATAATG
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AGCAAAGTACAAGGCATCTTTGTGCTTTCAAGTAATAGCATGCCAACATCACTAACTTAG
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TATAACTGCCATACTACATTATGCTATTAGGAGTGGAGTAACAGTAGTACACACACATCA
TTTGCGGGTTCAGGGAAGATATCAATCTAATGCGCAATTCAACGATCATGCAGTTGTACT
CATAGTCGTCGATTGCAGAGCATGGCAATCATTTGGCATGACTGAAGGAAAATTAGTTTG
CAAGGAAATAACTGAAGCAGTAAGCACACTAAACACCAGGCTTATAACTGTCAAGCTAAA
TTAGGCTACTCATCGTCAGCAATGCCACGACAAGTGCAAGCAATTCCTTTTCAGCAGACA
ATGGCATCCCTCAATGTATAACTACATGAGCAACAACCACTACGGAGTTGGTTCTACTCA
TTGCATCAACCAGCGATCTGATCTCACAATCCCCACCCAAGTGGTAGTACAGCAGGGTAA
CAGGTGCACCACTCACCGGTTGAAAAGCTCGACCCGGTACTCCATCTCCTTCTCGGCCAT
CCCGAACATCTGCATCGCGCAACCGAAGTCAATTAACCTCGGCGCAAAACTCCCGAAATC
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TCTGCACGTCCTTGGCAGCAGCCATTGTCGCGACGCCTTAGCCTGCACAGACAGAATCAC
AGAGCGCACCGATCTAAGCAGGGGAATCGTCCGAGGAAGGCATGGAAGATACGGGGGGCA
AAGACGGCAGTGCTTACCGGGAAGGATGACGGGAGGAGGCCGGAGATATCGCGAGCTCGG
CGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGGTCGTCGAGATGCCGCGGACGCGAAGAGGAGCCCTGG
AGCAGCGGCGAGAAAAACTCTAGGGTTTTGCCCTTCTTCTTTCTTGGAGGAGGAGTGAAG
GGCCTGCGCGTCCTATATGGGCTTCGCCCAGCTCCAATGGGCCTCTGGGCCCGTATATGT
TCTCTCCAGCCCAAGGCCAGCTTTTCTGGGCAGGTGGGCGATAAGCGGCTCTATTTGTTT
TGAAAAAAGCACAGATCACCCAAATCAATCAAAAACCACCCACATCACCCCCCTAACCCC
CACTTAGGCCTTGTTTGGTACTAGTGTTTTTGAGGAGATTGATGGTGATAATCCCCCAAG
GGATTGGG