Map Locations of contig_1584877 (3189 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1584877

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_19421 2 1140 bp MLOC_19421.1 Available Available LOC_Os08g23730.1, FRAME:+1, EVALUE:3e-14, 13108.m02431 protein class I glutamine amidotransferase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_19421






Contig Sequence (3189 bp)

>contig_1584877 3189 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCCCCTCCGCCCCTCCCCCCTTGCACACCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGTTTGCAATTCT
ATGATACAATCGTGCTCTAATGGTTTCGTCAGGCCCTTGTACTACACAGCAACATTTTGT
TGCAGTTGTACAGATAATAATGTTATGTTTGCTTTTTAGCCCAATTTTCCTGCTAGACTA
GTTTGTGAACACTAGTAGTTTGAATCAGACAATTCAGCATTAATGCACCCGCGTTTCATT
GCCTGTACAAGTCGTCTTGGTGCCTCACGTATTGTTCTGTACAGAAATGTGTTGTCTCTC
CTCTCATTTTGGTAGCACTCGTACCTATGTTTCTATGATTTGGTAAAACCTAGGCTTTTT
CTTTCATTCTATTTTTTGGATTTTGTTGATGCTATGGAGTTTGTTGATGCTATCTTGCAT
ATTTTGACAGCCGTGTCCCTTCTTTTTTAATCCTGCCAGGTATGATTTTGAGCGCCAGTT
CCTGGTTGATGTAGTGAAGAAGATCTGCAATAACGTGCGTGGTGTCAACCGTGTTGTCCT
GGACGTAACATCGAAGCCACCAGCGACGGTGGAGTGGGAATAGGATGGTGGTGATTTGAT
GGTGCAATAACGGGCTGGGAATTGCAAAAATCATGCTCTGATGCTGTTGCAATGCTGCAG
TGGGTTTAGTGCTAAATTTGCAGTTCAGTTATTTATCTGTAGGTTATGCTTAGAAAAATA
TGGATCTAATATGCTTAGACAAATATGAATCTATTGTGTATCTTTTATGCCTTTTGATTT
TTCTACCCCCATCCTTCTAAAATTGATTATATATGGGAGTAGCTGATTTTCATTTTACTT
GCGCTAGGAATTTCTTTGTTCTTGGGAAGGTAACCTATCTAGAACCAAAGCAATGATCAA
CAGTGAATTGGTCTCCTCATCATTTACTACTGTTTTTGACTGTTAGAAGTAAAACAATGG
AGTTGATATGAATCTCTGCTATTCAGTGTTGGCATATGCGATCACAAAACCAACATGTAT
ATTGATTTTGCAGAGCTTGATAGTACAGCCCAAATTTGTGCTTTGAGCAGGTACTTGACA
CCTTATTTGGTCTATTCCCCATCCTAGGATAAGTAGCAATTTACAATAAGTGTTGTTCTA
AGCCTGAGCTCATGTGAGCTAGGGTGAACAGTAAAGTAACAAAACATAGAATACTATTAA
GAATTTCCTATTTTTTTGGTATGAAACATTGACAAATGTTTGCTTGAATGTTTTCATAGT
TTGCAAAATTCATCATCATCATGAAATTACATCCATGGAAAATGTGGCAAAAAAATAGCT
GCTTATTTGCTACCCATTCAACTGTTCCATACCATGATATATAAGTATGTAACTTCTTTT
TTGAGATGGACGAGTCAAAATATATCCCCTGCTAAAACTACTGAAATGTGTCTGCAGTTT
TTGACACGCTCGTTCCAATACAAAAGAAAATTGCTGGACCTGTGACTCCGACCTGGTAGC
AATTAACTGCTCGGCCCAATAAACTGCAATCGAACCCTAGCGGCACGGCCCAGAAAAGGA
ATGGGGCGGCAGGGCAGGCGATTGGGCTAGTGTATGGAAAAGACAACAATTTTTTTTCTA
TGAGATGAGAGTTTTTCCTTCTTTAGAATTTGTAGTTTGCTCGTGCGCACAAAACATGTA
TTTTGCCAAGGTCCTATTTTTTTTTCAGAATAATATATGCGTTCGCTGGCACACCTAAAT
GGTACCTGTAAAATTTATGGGGAAAACTAGAGCATGTTGGCCCGCGTGAAAAAAAAGTTG
AACCACAAATGTTACCTTCAAATGATACATTTAATTCTGTTTTTCTTCCACCGTCAAAGC
GTTGTTATCTCATTTCACATGAAAATTAACAAACACGCTTGTTACCCTAACATTAGCAAA
AAATATATCAAAACACGCTTGTTATCCCAAAATGCACGAACGGGCGTGCAGTAACGGCCG
CTGGAGATGGGCTGGCACAGTCGTACGCGGGGAACAACTTCAAACAAGACTATCTTCCGA
CTTGCGTTGACCAAGATATAGTCCTGCCTCTTTTTGTGTACCTAAATAAACAAATTATTA
CCTTAAAACGATTGTCAATAACGGATACCTAAATAAAAAAGAATGTTTACCCTAATAAAA
GAATTAAAATAGTTAACTTCATGGTATCATAATGCTAATTATTATTCATGCTATGTTGTT
TTCAACACATATTATAATAACCTAAATACTTAAAAATAAAGCTGCACTTTTAAACCTCTC
TGAGTGCATGCATTTTATCCGTCCGATCGCGCAGACTCATCTTCAATTCCACGTGCATGC
ATTTATTTGAGACTTTAATTTTTTTTTTAAATTCATAACTTTTGATTCTAGTGTTGAATT
TCAAATCAGTTTTCCCATTGTGTTTGTCGCGACGAGTACTTCAAAACTAGATCCCATATG
GATAAGTTTGGACAATTTTTTTTTTTGAGTAACTTTAGTGCTAAAAGAAGCAACTTCTTA
TTAGTGTGCGTAGTATGATGGTCTATCAACGAAAATTCCTTCAATGTTATCTACCAAGAC
TAGACGGTTAACTAACTTCACCTTTTAGCAATCACATGGCAGATGTCGTCAGCTATTTCC
AAACTGAAATAGTTAAATTACGCGTTGGATGTGCATACTCGGCTTCTCATGCGTTGGATG
TGCATTAATTCATGTACGGATTTTTTTTTCAAAAAGCTAAACCGTGTGTTGGAATTATAA
TATGTTTTCATCGTTGGGTTCCTCGTGACGAACTCTTCAAAAAGAGACCCCATATGAATA
TGTTTTAAAGATTTTTTTTTCAAAAGCAACTTCGATGTTAGATGAGGCACCTTAGTGCTA
AACAGAAACAACTTTGATGCTAGATAAATTGCATCGTGTGTATACACATGAGTTGCTTGT
TGAATGCAGTAGAGTTGCGCAAAAACACACTAAAAGTTGTTAACTTTTTTGTATACTCGA
GTGCATTCATGACAACTATTTATAAATAGCAGGCAACTTGGCATCAATGATATGCAACCG
AACATCAACCGTAGGCAATTGATTATCAGTAATAGGCAACTGAGCATCAAAATTGAGCAA
TTTCATACTCCCTCCTTTCCGGTTTANAGGGCTCATCTCAAAAAATTCAGATTTCCATTA
TATTAGGCT