Map Locations of contig_158486 (10092 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_158486

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_19412 2 1460 bp MLOC_19412.1 Available Available LOC_Os03g41438.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-154, 13103.m04460 protein serpin domain containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_19412






Contig Sequence (10092 bp)

>contig_158486 10092 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATTTATGCTACGTTAACCAACAATAGTATCACCCTTGTGACGCACAATGTTGTATAGAG
CCAGATATTGTTCCCGGAGTGTGGCATTTCCTAGCCACTTATCCTCTCAAAATCTAATTT
TCGAACTGTCCTTTATTGAGAAGGATCCATGGCAGAAGAAGTATTTCTTCATAGCCATAA
GCCCCGCCCAAAAGTGAGAATCCCCAGGCTTCCAGTATACTTGGGATATTGCCTTAGAAC
CCACATATTTCCTCCTCAGGAGGGTTTTCCATACACCATCTTACGATTTTAATTTAAACA
ACCATTTACCAAGTAGGGCCCTATTCTAAACCTCAAGGTCATGAATGCCCGACCCGCCTT
TGTCTTTTGGACTACAAACCACACTCCATTTATCCAGTTGATATTTCTTTCTCTCGCTAT
CTCCTTGCCAAAAAATTCTTGATCGGAAATAATCAAGTCTATGTAAAACTCCTTTCGTCA
ACTGGAAGAAGAATATCATATATAGTACCATATTATTTAGTACTGAATTTATGAGGAACA
ATCTTCTGCCGAGAGATAGCAATTTACCTTTCCAACTGTAAGTCTTTTTTGCAGTCTCTC
CTCGACGTGTTTCGATTCAGCATTAGCGAGTCTGTGATAATGTATTGGAACCCCCAAATA
TGTGATCCAAACTGGCCCAACCCGCATCCGAACAAGTCAGCGTATAGGTGAACCTCGTCT
TGAGCTGCGCCAAAGCAAAACAATTCAATTTTATGGAAATTGATCTTAAGACCTGAGAGT
TGCTCGAATGCTGATAAAATCAATTTTAAATTTCTTGCTTTCTCGAGGTCATGATCCATG
AAGAAAATCGTATTGTCGGCATATTGAAGTATAGACAGCCTACCATCAACTAGATGATTT
ACTACCCCATCGATTTGTCCATCAGCCTTGGCATGCTCAATCATGACCGCTAGCATATCC
GCCAATATATTGAATAGCACGGACGATATCGAATCACCTTGTCGTAATCCCTTCTTCGTT
TGGAGATAGTGACCAATGTCATCATTGACCTTAATGCCAACACTTCCTCCAGGAACAGAG
CTATGGATCATAGCGCGCCACTCTGCAAAAAATCCTTTCATTCAGAGGGTTTGTTGTAGA
AAGGGCCATTTGACTTTGTCATACGCTTTTTCAAAGTCTATTTTGAGTACTACCACATTC
AACTTTTTCCGATGTAATTCATGGACTGATTCATGAAGGATAACAACACCATTTAGGATG
TGTCTACCTTGCATAAAAGTTGCCTGTGAAGGACGAACCACATGTTCAGCGATCGAATTC
AACCTAATAGTCGCAACCTTCATGAATATTTTATAGCTAACATTAAAGAGGCAGATAGGT
CTAAATTGTTCTATCCTTACAACCTCATTAACCTTAGGTAATAAATAATCTCACCAAAGT
TTAAGCGAAACAAATCTAATTGGTCAGCATGTAGGTAGCTAAACAGGAGAAAGAGATCCG
ATTTGATGACTTCCCAAAAGTTCTGATAGAACTCTCCGGAAAATCCATCCGGACCTGGGG
CTTTATTATGCTCCATTAGGAAAACTGCCTTTCTAATTTCCTCCTCTGAGTATGGGGCTG
TTAGAAGGCTATTTTCCTCAACAAAGACCTAAGGGATGTCATCTATTCAGCACTGATCCA
TTGAGAAGTTTCCTTCTTGTGGGGCTCCGAACAGATTCTTATAATAATTAGTGATGTAAC
TTTTAAGTTGCTCATGTCCCTCAATCGTACCATCATCTTGTTGTAGGGAATGAATACTTT
TTTCCGGTGTCTGCCATTGGCAACTCCGTGAAAATATCTAGTATTCAGATCACCCTTCAC
GATAAATTGAGACTTAGAATGTTGGTATCATTTGATTTCCTCTTCTCACAGTATGCTAGC
TATCCGTGCATTTGATTGACTCTTGATCTTGATTTCATGCTCAGATAAAGGCCTAACTTC
TGCCAAAGCTTCTAATTCATCAATGATTGATGAAAGACGAAACTTATCTTTTTTGAGGAT
ACCGACCGTATGTATGACCCACCCACCAAGAAATTTACGTAAAGCACACATTTTGTTATT
CCATTGGTTTATTGAGGTACACCCGGCCACCGGTTTCTCCGATACCTCCTTGGGCAGCGG
AATGGTCGGGTGGAAGTTTGTCTTCTACGGAGCATGTTGTGGTCAACTATGAAAAAGACT
TGTAGGATTTATTTATCTGTCTAGTTTGGTAGCTTCATTGTATTACCTAAAAAATTGTAG
GTATATGATGACAAGAAGCGACTTGATTGGACTCATGAATAAGGCAATGGCATAGGCTCT
GACTCTATCGGCTTATTGGTGCCTACGGTTTTGTTCTCTTTGTGTCTTTCATGCAAATCT
CGTGATTCATTCATTCAACTGTATGTGACGGAGTACTTCATTGGTCTCTTGGTCTTGCTC
GTCTACTTATTTGGTTGTAACCTTTGTGCTTATACTCTGTGTGTCCATGTTGTATGTGGT
GTGCTAGTCGTACCGAAATGTTGTTGGATTGCTTGGCTTGAGGACGAGCTCCAAAATGTC
CGGATTAGCCTTCGAAGGCTCAAACCTCACTCATATAACCTGAATGGCATCCGTCTCCGG
TTGTAGGTGAGCCTTGGCCCGCGCTTGTACAATGTTTTTTTACTTATTTAGCATCACTAT
TTATGTACTTGGTTTAATGAATTGAGCAAAGAAAAAGTAGCATAGGGAATTTCCTTTGAT
CTCACTTTTTTAAAGAAAAAAGAACTTTGCCAACCGCTTGGATCTTTCTTTTTCCCCCAA
AGTCCGACAAGAATCTTTAGTTACAGTTTCATGTGAATTGATTTTGAATTGATTCTGTTT
TTCTATTCCTTTCAAAAAATGAAGTCAAAATGAGCGTGTTGACATGCATCTGCCTCTGTA
GCTCATAGGTGGTGTCATAACTAGTATTTTGGGTCAAGATAGTCTAGTCGACACACAAAA
TGCACACAAAAGTAATATGTCAACATACTAGTGTAGAATTCATCAAAAGCATAGAACATT
TATTGGATTTATTGCATGGGTAACATGATGAACTGTCGAAACCCTTCCCTTACATGTAAC
AACTGAAGTAAATGACAAGACACTTCAGAGCAAACACATTACAAAGATAGGAGGGGATTG
ACCACATGACCGATGAATAGCACCACACCGGAAATGTCTTCCCGGATAAGGAAGAGGAAA
GGGTGATCCGCAATGAAATCCATATCTGAGGGCGGCCTTGCACTTTGTAGGACTGCTTGA
CCCATAGTTGATGCCGCAGCCTTGGTTCCTGTTTCGTTCACTTCGACAAATGCTTTGTGG
AAAACAGATGATATGTTGAGGCCCTGTGGCATTGGGGAATCTACCATCTCCGAAAGGTCT
GCTTGATCACTGAATGGCAGTTGCAGACCAAACTGTTTGAGCAAATCAGATGCTTCAATT
TCAAATGATATCTTGAACTTGGGGAGCTTGAATTGCCTGAGTGCAACCTTCTGCCTTGGG
ATATGGCACTCTAGGAACTCTGGCTCAACACTCAACTTTTTGGCCAAGCTCCAAAGACCA
TCTCGTGCTTCTGGAAGAAGGATGTACATGGAGAACTGCCTCCTGTCCTTGCCTTGCTTG
TAAGGAAGCTTAAGTACCTTCATGCCATCAGAAGAAGAAATGTATTGGTCTTCTATGCTG
TACATGAATGGTGTTTGAATTGAGCTCCCATCAAGAAGGTAGAAGTAGTCGTTTTTTATT
CCACGTGGATCAAACTGATTTGTCCAAGCTCCTTTGAAATAAAGGGCATTGCCAAGAACA
AGTCTAGTGGTACTGCCAACAGATCCTGCGGGGAGAATATCTTTGATGAGCCCGGTTGTG
ACTTTCTCTACCCATGAGTTCACTTGAGAAGTAACTTCCGCGGCCTGGACCAAGTCAAAA
TAAAGAAAGGTCAATGTATGTAACGAAAATAATTTGACAATATTATTGTGCTACCAAGTT
TGAAAAAAAATTCTCAAATGACAAAATATTATATTTGTGGCAAGAATGCAAAGAAGAATA
CTAATGGTTTACAAAGCATTTCTATGTATAGTATAGTTTTACCCACATAGTAAAACCATC
ACATAAAACCACATATGACATAGTAAAGTTTTACCCACATAGTAAAACCATCACATAAAA
CCACAGATGACAGAAAAAAGATCCATGTGTGCGTACAAAATTTATTAAATGGTCATCCTA
TACCCATTTCTCAGTACCTATGCAAATTTAGCACATAGATATTAGCTATACATACTCCTA
TACGTATGCTACTACAATAAGCAACATGACAGCACGACGATGAATATTGCCAAGGTATCA
TAAATTCACGTAAACAACACCTTCATTTCAATAGTTAGTTGGACACAAATAGCAAGGGAT
TAATAAGTACTCCATGCATATTACAAGTATAATCTAGACTAATATATTTCATAAACTTGA
ACGGTTTAACAATGGGATATTAAGTCTGTCTATTTCATTTTACCCAACCAACCGAAATAC
TATATATGTGTACCTATAGAAAGTTGGAAACGGTTCTAAAACTTATAGAGTTAAAAACAG
TGGTCCATATGTATAACCATTAAATTTCAAAGGAAAAGGACTATAACAAATCTTGAATGG
TTATAAGGCTTAGCTAAATATCAACATAAATAAAATACACTATTATTATTACTTTTGCGA
CTGAGAGTGCCACTATATTACATCAACACAAAACAAGCACTCTCTACATGATAGTGCCAT
AGATAACGAGCAAACCTTGCCGTCATTTCGAGAACGAGCTAGCTAAAGAAGGGGGGTCAC
CTTAGTTTGAAAGTCCACAGACTGGGCCTCGGCCTTGTACTTGCACATGGCGAGCTCCTC
AAAGGATGGCTTGAGCGGCAGGGACGCGTCCACGAAGACGCCGTTGGCGAATGCGACACG
TGGACCGCCGACACCGGATGCATCGGCGAGCACGAACTACACCACCTGCTCGGCGAGCGC
GTGGAGTCCCTCAGCCTCGCCTTCCCCTAGTGTAACTAGGAGTTGGTCACGGGTGGCACC
CCCGGCACCAGCAGTGATGAGGCTCAACGCGACATGAAGGGAGACCGGAGAGAATGTGAC
ATTGTTGGCGGTACACTCGGGGTTGGATGAGATAGCGGAGGCGAGGCGAACACCGAAACG
GGTCTGGTGCGCAATGGAGAGGCGGACGTCGGTGGCGAGGGTGGTTGCCATCGTTGGGGT
GGTGCTTCGTTGGGATTTCCTTGGAGTTGAGAGAAAGAGAGATTATTGACTGGGAAGTGC
TGTTTTCGTGGGCGGTTTGTGGCTATTTAACAGGAGCCACAGACCGAGAGTTGTGCAAAG
GTTCGGAGCATGTGAGTTGTTGTGACCAACACAACCACAATGAAATCATTGGGTAGTATC
TCAATCAATTTGCATCATAAAGGAAGATAAGTGGTTTGTTGTCTAGTCAGCGCCGCGTCA
TTTCGTATATCTGGAGAAACTTGAATTGATCCTATCTCGATTTAGGGTGGCGCTTCCGAT
CTGATCTTTCCGCACGTCGGATTTTTGTAAAATTGGTACTGGATCATGTGAGACTATTAC
ACGCCACGTAACCTTTTTGTTGATCGTTTTAGAAGAATGGTGTTATCTAAAATCACACAA
GTGATAAGTAGTACTACTATATTCCAAGCTTGAGATAGCGATGCCAATGTGGAAAGTTTT
AACTAGAAAAAACGATTTGCATGATATCGCATGGTATATCATAACCGGGATTAGGATCAC
TTGACGTGGGGTATGGACTTAACTTGTGGTCAGATTGAAGAGTTAGGACCCCAATGACGG
CACCGCGCGCGGCATGCCAACGCTACCCCTGGAGGATGACAAGATTGATAATATGTGTTT
TTCATCGTTTTTGCTAGTTCTCCTAGAACATCTAATTTATGTGGAGTTTACAACACGTCT
CGTGACCTTTTAGTTGTTTGTTTTAGAAGCATAGTGTTTCCTTAAGATCACACAAGTGAT
TAGTAGTACTAAATTCCAAGCTTGGGATTGGGATGCCAACGTGTAAGGTTTTAACTAGTA
AGAAGATTTGCATTTTTTTATACATGTAAAGAAGATTTGTATAATATTGCATCACGTAAC
AAAATTGAGATTTGCATCATTTGCTGTGGGATGTGGACTTAGCATGCGGTTAAATTACAG
TGTTGTGATCTAAACCGGAGCAAGGTTACGTTACTTACGGATGCACTAAAGGATAGCACC
GCGACATCCAACGCTAACCCACAAGATGGAGTACATTTACATAAAACTATCACAATTGGG
GTTAAAAACGAACACATTCCGACTTGATCACTAACTCGGAGTGTGGGCTTAACTTGTGGT
AATTCAAATGTATGATCGAATGATGCCTCTGGGGAGGTAGACACGAGCATGTCTATGGGC
CCGACTATGTAGGGTTTAACTAGTTAGCTACTTTTTCGGAAGCCTTCCAGCGATCACTCT
CGTCACTTGACGCATTTTCAGCCACCGTCACGTGTCGTGCTCTCAACGTTTCCTTTATAT
TTTGTTTTTTTCATTTTTTCGCACGTGTTTTCGGCTTTTTAGAATAGTTTTTTTTATATA
TATTTTTGGTGTTCCGGTTTTTCCTATCTATCGTAACTTTTGGACAGTCAAAACTTTTTT
CCCACGAAAAAACGGGTTTTTTGTTTTTTTATGGAAAAAAACATGTTTTCTGTTCTTTTG
CGAGAGGCACGATTTTGCCTTCGCGAGAGGCATGGACGTGCCTCTCGGAAAGAGAAAAAA
TAAACGTGTTTTTTTGCGAGAGGCACGGTTTTGCATTCACGAGCGTGCCTCTCGGAAAGG
AAAAAAACGTGTTTTTTGTTTTTCTGCGAAAGGCACGGTTTTGCTTCCGTGAAAGGCATG
GTTTTGCCTTCGCGAGAGGCACGCCCGTGCCTTTCCTGAAAGGAAAAAACACATTTTCTG
TTTTTTTGCGAGAGGCATGATTTTGCTTCTGCGAAAGACACGGGTTTGCCTTCGTCAGTG
CCTCTCCTGAAAAAAGAAAAACCACATTTTCTGCTCTTTTTTCCGCAAGAGCCACGACCC
ATGCCTCTCGGAAAGGAAAAAAACGTGTTTTCCATTTCTTTTTCGCGTAAGGCACGGTTT
TTTCGTCCGGTTTTTTTCTTCCGGTTTTTTGTGGAAAAAAAGTTCATCAAAATCTATCAA
CATGGGATCTAGTTTTAAAGATCTCGAGGCGAGAAAGCCAACATTGAAAATGGTTCGAGG
TTTGAACGCACGGTTAAGGAGATAAAACGTTTTGAAAATACGNATCTACGAAAAAAGGGA
AAACTCACATGTTACGACAAGTGGGATGCATGCAGTGCGTTATTTGTCACAACCTGTGGA
GGTGAGAATAATCGTTAGAAGGTGTACTCGATAAATAGTGATTTCAGACTATGTCTCGCC
ATCAGCAAAACTAGCTTCGGACTCGATGAAGGGCGAGTGAGATGGGTCAACCCATGAGCA
CGCGAGGCCACAACCTCTTTTTCCTATTTATTTTTTACGTTTTTGTTTTATTTTTATTTT
TATTTTTGCAATTTTGTTTGTACTTCAAAATATTATATATATATATATGTGTGTGTGTAT
ATATATATACATACATATATATATATATGTTTATATATATTACTAAAAATACTCTTCAAT
GTTTTTGAAAAAATGTTGATCATATATATAAAAAATTTAAATAAGTATTTTAAAAATGTT
GAACAAGTATTTGAAGAAATGATGAACGAGTATTTGAAAAATCTTGAACAAATATTTGAA
CAAAAATGTTGATAATATTTATTAAAATGTTGAACAAGTAATTGAAAAACTTTGAACAAA
TATTTAAATTTTTTTGAGCAAGTATTTGAATATTTTTTATCATCTACATAAAATCTAGAA
TGGAAAACAAAAATAAAAAAATTGTTGAACAAGTATTTGAAAAAATGTTAATCATATATA
TGAAATTATTGAACTAGTATTCAGAAAATGTTTAACAAGTATTTGAAAAAATGTTAATCA
TATATATATAGATATGAAAAAATGTTGAAAAAGTATTTAAAAAAAGTTGATCATGTTTAT
AAAATTGTAGAATGGAAAACCAAAAGTAAACAAATGAAACAAATCAGAGAAGAAAAATGA
AAAGAATGGAAAATCAAGGGAGAAAAATAAAAGAAAGAACGAAAATACATGGAAAACCGG
AGAAGACTGACTCTAGTCGCCTCTAGTAGGCCGCGATCCTACTACTAACGAGTAACTCAA
AGCAGTCGGAGCGGTTAGCTGCTTCGGTGATCCCCGTGGAGATCATGGCTTGATTTTTTT
TAGACAATCTTACCAAGCTTTATTAAGGATCAAGAATGTTTACACGCAAAAAGGGCAGCT
CCCCTGGCTGGCCCAACCAAATGTGGCCTGCAAACCCGAGTGTTAAACATTCTTAGTAAG
ATTGTGAGCCTCAAAGTTCGAGCTCCTAAACTCATGAACTATGTTATAAGAAATGAAAAA
ACGAGAACGATATGTTATATCATGTAAAACAGCTCCGTACTCTGTCGCCGATTTCTTCTC
CAGATCGCCAACCACCGTCTTGTAGTCACAGGCAATATGGATCTTATTGACATACATGTC
CTCTGCCACAGTTTGTCCTTCACGAATAGCAAGAGCTTCCAGCGTTGCCACATTGGATAT
ATGGTTGAACTTGATCGTCGAAGCCCCGAGAAAATTACCCGCCTGGTCCCGACAGATTGT
TGCAGAAATGCCACACGTACCATCGCGTGTAATCTTTGCATCCGTATTGAGCTTTGCATG
GCCCTACGATGGAGGTTGCCAAGATAACGAGCGAGGCGGGGCACTCCTGCGGCTGAGTCG
ATTAATATTTTCAGCAATTTGGATATCTCAAAGATATGACGTGATGAAGACATTGGTTGA
GAAGGGGCTCTCATAAATATCTTCATGTATCACCCTTCTCCGTGCTCGCCAGATCGTCCA
TAATGTCATCTCTACACGGATAAACTCACTATGAGGCAGCGAATCATGCAGTGTAAACAA
CTAGTTCCTTGCATTCATCGACAGGTTCTCGACCATAGTCTTCACCGTTTCTTCCAAGCA
TAGGGACCACACACTTCTTGCTGTAGCAGTCTACTAGTGCATGTTTCCAACTTTCTTGTG
ACACACAAAAGGCAAAGACCTTGGTAGTAGACATGTGGCGGTGGTGTAGAATGTCAGATG
TTGGGATTGTTTCATGGCACAGTCTCCATAGGAACACCTTAATCTTCGAGGGTACCTGCA
TATGCCAAAGTGAGGTCCATGCCCCTTCTTTCATGGAGATATTCGAGTGTCCCCCTGCCG
GTTATAGCAAGGCTTCATTTCTTATGTTCATGCACAACAGAAGTTTATAAACTGATCTCA
CCAAAAACCTTCCTCTTTCGTCTTCTCCCCAAGCCCAAAAATCTGAAACTCTTCTTGTGC
ATAGAGGTATCTTGAGAATCCAGTTAGCATCAATGGGAAGGAAAACTGCACGGACCTTCT
CCTCGTGCCAAGTGGCGGATGAGCTATCAATCAAATCGGACACCAACACCGGCTTATCTG
TAACTAAGGATGCTATCGGCCTCATCATATCTAGCCTTGGTATCCAGTTGTGGTCCCAGA
CTCTAGTTTCGTCTGATAAGTCCCTGCGAAAGAGTGCCTCTTCCATCTAGGATTGCCCTC
CAGATTTGTGACAGGCTATCTCCAAGTTGAGCCTCGAGGAAAGTAGTTGATGGGAAGTAA
TTTGCTTGTAAAATCCTCGCGCTCAGTGACCTTGGATCTTGTAAAATTCGCCAAGCTTGT
CTAGCCAGGAGTGACAAATTAAATATCTCAATATCTCGGAAGCCCAATCCTCACAAGTAC
TTAGGCTTAGTGCAAACATCCCAAGAAATCCAGCAAGGTTTCCTTTTCCCCCTCTTACTC
CCTACCAGAACTTTCGTATCATAGAAGTAATGCTTTCACAAATACCTCTAGGTAATTTGA
AACACGACATGG