Map Locations of contig_158466 (9279 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_158466

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_19368 7 3259 bp MLOC_19368.7 Available Available LOC_Os06g10620.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13106.m01149 protein transcription elongation factor SPT5 homolog 1, putative, expressed
MLOC_19369 2 860 bp MLOC_19369.1 Available Available LOC_Os06g10610.1, FRAME:-2, EVALUE:5e-17, 13106.m01148 protein hypothetical protein





CDS Structure of MLOC_19368






CDS Structure of MLOC_19369






Contig Sequence (9279 bp)

>contig_158466 9279 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCGCGCCCCCGCCGGCGGCGGCGGGGTGCGGAAGAGATCGCGCCAGGACAACTT
CATCGACGACTCGGCCATCGAGGACGACGACGAGGACGAGGAGGACGACGGCGGGAGCCG
CCCGAGGAAGAAGGGCGGCGGCGGCGTGCGCGGGTTCTTCGACGAGGAGGCGCAGGTCGA
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TGTATGAAACTTCTGTGCCTCTTCTTGTAAATGTGAAAAATGTGTATTCTGCTTCAGTGT
TGATTTTCAGGCAGCTCCACGATAGCTTTGTTAACTGAAGCTGATGTATTAATATGGCCT
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ATGCCTTAGTTGGCAAGTGTATCAAGATTAAATCTGGTCCTTATAAAGGGTACCGTGGTC
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GAAAACTGCAGCCGAGACATCACGGCCTGTTTACTGTGGTTTTGTTCCTCATCAGGCAAC
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CGACCCGGTGACGGCGCGCTGGCGCTTGCTGCTCGACGGCCGCGAGTCCGGGCTGGGCGT
CGGCTCCGGCTCGGCCTCCCCGAGCAGCTCCTCCGCGTCCTTCTCCTTTCGCAGGGTCTC
CAGGAAGGACTCCTTCACCGCCCCGTCGATCTGATACGACCAAACATCACCGACAGAGAG
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GCGCTCCGCGCTCCCGAAGATCTCTTTTGGGATGCTTCTTTCCTCTTAGACCCTGCGCCT
GCGGCGGTGGATTTGGAACGGGGGGGCCCTTTCGGTTTC