Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1581732 (5362 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1581732

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_18720 1 1222 bp MLOC_18720.1 Available Available LOC_Os06g12160.1, FRAME:+1, EVALUE:4e-145, 13106.m01321 protein AAA-type ATPase family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_18720






Contig Sequence (5362 bp)

>contig_1581732 5362 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCCCTGGTGGAACGAACCTACCTAGTGCCTGTGGAAATTACAGGCT
AAGCTTAGGTTAATATGTCATGTTATGGGAATTAACTGAGGTCTGTTGCTTGTTAAGTAC
ATGTCCATCTGATAATATTCAATCTCTTCATCTTGAATAATCACATTCTATTTTCTGTGT
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TGCAGTGTCTGTTCCATCTTGTCTGCTCAGTAAACTTACCTCTTCTGGATTCCCTTTGCT
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TGTTCGTTGTGCTCATCCCACATTATTAGCATAGAGTAAGGGATAGGTTTGATATAGCTG
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GCTTGGTTGAAATTTGTATCTTTTCAGACATCATCCTTGAAGAAGCTGGTAGGGGGACTA
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ATTCCTTTTCCAAAGGTAAGTTTACACCATTTTAGTCTCCAAAAGTAGTATTATGTTATT
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TTTGGATGATGCTGTTATCTTTACAGCTGTGTGATACTTCCTTTTATGTTCAGGATGATG
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TAGTCAATTGCTTTTCATTTCCAATACTTGACCAGTTGACCTACATATGATAACGACTGA
GTCGCTTCCCCAAGTGCTTGCATGTAAGTCCTGACATGTAAATGCAGGTGCTTGAAGATC
ATGGGCTATCATGTGAAAATCTGTTGCATGTGAAGTTAGAGGGCATTATTCTGACGAAGC
AAAGTAAGTCTACTAACTGGATCCATATTATGATGCATATCCCTTTTTCCTGAATCATGG
TTGCCAGTGGTGCTTATGTGCGGATGGATCATATGAAAGTTTGGATTAAACAATGTCCGA
CTTCAAGTTTATTGGTGTGCATGATTATTGTTCTGGTTTTAAAGCGGCATACTAGCATGC
ATTTTCATTTATTGGTCCTACCGTAGTTCAAACTCAACATTGTTGTTCTTGTTAAGGAAC
CTTTGTTTGCACTGTGCATATTGACCCCAGTTGAACTGCAACTGGAGTACATGATCAGTG
CTCAGTCCGTGCTCATGGGCCCAAAAAATTGAAGGTGCATCACACCTTATGATTGGTATT
AGACATGTGCTTCGGTAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTACACCCACACCACCCAC
TCGCGCCAGCACAACCACGACT