Map Locations of contig_1581692 (5549 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1581692

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_18714 1 2514 bp MLOC_18714.1 Available Available LOC_Os03g16440.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13103.m01954 protein outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_18714






Contig Sequence (5549 bp)

>contig_1581692 5549 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTATAACTTCTGATAACGACGACAAGTCGTCGGCCGACTGGGACCCGCATGGCCTCCCG
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TCTAACGGGGCTTTGGGTTCGCGGAGACGTGAAAGATGGTTCAACGCGTCGATCCAAACG
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TTGGGTCGGCACGGAGTCAAAGCGGACGCGGATGACGCACGCTTTCACCATTACCTGACC
CGCTAGTCGGTGGCACATTGGTCGTTTTTCACCTTCTCGCCTCACCTCGCCCCTAGCCTC
CTTGTCGCCTCCGTCCAGTTCTGGCTGTCTCCTCCCGTATCGCAGCACCTACATCACGTC
GCCGACCGCGTCACCGTCGGGGCACTGCAGCTTCCCCGACCCCAACCCGTCGTCGCCGGT
CAGCTTCGCCGTCCACGCGCGCAAGTTGTTCAACAGTTTGCCTCAAGATACAAAATGGAC
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GATGAGGATATGCTGCTTGCCGTGTTGGTCCATGACCACATTAATAGGCAACAACCGCTG
CTTCGAGGCTCGATTCCGGGGCATGTTCCGGCGTTGAATCGCAACCGAGAGAGCGGTCAT
TTCCTTCTATAGAAAGACTACTTTGACATAAGCAATCCGCTCTTCAAACATCAGAAATTC
CGACGTCGTTTCCGTATGGCTAGGCATGT