Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1581335 (3409 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1581335

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_18640 1 721 bp None Available Available None
MLOC_18641 1 1851 bp None Available Available LOC_Os02g16640.1, FRAME:-1, EVALUE:1e-42, 13102.m01863 protein proline-rich protein HaeIII subfamily 1 precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_18640






CDS Structure of MLOC_18641






Contig Sequence (3409 bp)

>contig_1581335 3409 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCGTGCTGCTCTTACTGATGAGCGCACTGTTGAGACTCCCATGGAGCTCAATGTTCACC
TCAGTGATACTGATGGTGACCCCTTGCTTGATCCGACGCGTTATCATCATCGTGTTGTGA
GTCTTGTCTATCTAGTCGTCACTCGTCCGGATATCTCCTATCCGGTCCATATTCTGAGTC
AGTTTGTCTCTGCTCCCACTTCGGTTCACTGTAGTCACCTCCTTCATGTTCTTATCTTCG
GGGCATGATCCCTCACCGCCTGTTATTTCCTTGCTCTAGTTCCTTATAGCTTCAGGCCTA
TTCAGATGCTACGTGGGCTAGTGATCCCTCCGATCGTCGTTCACTTTCTTCTTACTGTGT
TTTTCTTGGTGGTTCTCTCGTTGCCTGGAAGATGAAGAAGTCGACTGAAGTTTCTCGTTC
GAGTGCAGAGGCTGAGTTGCGAGCTACGGCTCTTTTGACGACAGAGGTGACTTGGTTACG
ATGGTTACTTTAAGACTTTGGTGTTTCTGTCACTACACCCACTCGGCTATTGTCTGGCAG
GTAGAGGTGCTATTAGCATTGCGCGCGACCTGTTAAGCATGTGCTCACCAAGCATATTGG
TGTTGATGCTTTCCATGTGCGTGTTATTGTGCAGGATCAGGTTATTGCTCTTCAATATGT
GCCTTCCGAGTTACAGTTGGCGGATTTCTTAACGAACCCCAGACTAGAGCGCAACACGGC
TTCTATCTCCCAAACTCGGTGTTGTTTATCCACCATGAGTTTGAGGGCAGGGGTGTTAGA
GTTATATTCTAGCCTATATGTTTTCCCCGTTGTATGAGGGGTTTCATGCATATTTACCAC
TTGTACATGTATATATATATATTGGCCATTGGCCCTCAAGGAATACAAGTTGCATATTCC
TAACAAGTACATTGTTTACACTATTCTAATAAAATCTACTCCCTCCATTCCTAAATATAT
GACGTTTTGGTAGTTCAAATTGAATTACCAAAACGTCATATATTTAGGAACAGAGTAAGT
ATTACAACACTGGAAATTAAAAACATTTCATCTCTTTCATGTTTTCTAAGTAGTGTTACG
GGAGTCTACTTATAATATTATAAGTTGATATGTTTATAAGCCCAGGATGAGATCCAGCAT
ACAATAACTTGTAGTATATGGAAACAAAATTTACTTGCAATCTAATAACTAATCTAAGTG
TCATGACCATATTTAAAAGAATTGCTTGCAGAAAGTAATTACCCCTTTCTATCTGAGTGC
CTATGAAAATTCAGAGTTTCAACTTAAGCTGTCCATTCCTATCTGAAAGTGCTACTCTGC
CCCAAACTCAAATGCACTCACCATGAACAGTAAAGTTCCAAAAAACTACTCCCTCTGCCC
CACAATATAAGATCATTTCGCAAGCTGTTTTAGCTTGCTGAACAATCTTATGTTATGGGT
CTGAGGGAGTAGTAAACAAAGTAAAAAAAACTCTGGGTTTTTTTGGCAACAATCGTTCTT
AGTTTTCTACCTAAGTGCAAATTTTCGTGAAGGAACGACATTTGCGCTGGTTTGGGGGGA
AACTAAAAAGGTGCTCAAAATGCTTTAAAACCTAGCCTTTTCGGAGCATCGATTTTGTTT
TATTGCCCCAAAGTATTACGAATGTTTTTTCTTTGCGAAAATTTGTGCATAGGTAAAACA
TTAAATCATGCTTGTTTCCAAAAACAAACTGAGATTAGTTTCACTATTTTTCGGGTTTTA
CTTTTCATCAGGGTGCATATGTGCTCAGTTGCCAAAAATCCATGTCCACTCCTATCTCAC
TATGGTTAATATAGTTCAAACCATGTAATACACATCCAATGCGGTATCCAGCTGGTTTTG
CTCTTCAGTCCCACTAAGCAAAATTAATACATGCAATACATCAAGACAAAGACTAAATAT
ATGCTCAAGAAGCAGAATCAAGCAATAAAGAAACTAGCGCAAATTTCTCCATCTTGTAGA
CCTTTCGTGTTTCTGTATCCTTGTAGGAGTACCAACTGGTAAATTGTTATCTTCCATACA
GGAAATATATAAGCAATTGAGTTAATCAATAGGAGCACAAATTAAAGAAGTTATGGACCA
TCTAATTTTATCGAAATATGTGACTATAGATACAAGTAATCACAATAAAAAATGAAAACA
ATACTGAAGTTTACCTGGAGCGCCAGGAACTGGTAAAATAGGAGGCCTTGCAAACGGCCC
ACCAGGTTGTTGATGTTGAGGATAACCATGTTGCATCATGGGTGTGGGCAGAATTGGAAG
ACGGGGACGGGACATATTTCCTGGATATTGAAGAAGATGTTGGTTGAAAGGAGCGCCAAC
TTGGAACGCTGCGGCTTGTCCTAGGTGTTCCTTGATCCTTTGATCAATCAAACTTTGAGT
TTGCTGCTCCTCGAATTGCTGATAGTAGTTACGAACATTTGCCTAAAAATGTTTCACATG
AAAAATAGTGTACACGCAAGAATAAACCAGAGCTATGAATGAAGGTATAAAAAAGAAAGA
ATACCTTGTGTTTATATCCAGCATTGTGTTGCTTACGGACAGATGGCTGCACCATTATTG
ACATGAGTGGTTAGTTCAAAGATAGGTATATTAATAAGCAAACCAGAGAAAAGGACAAAA
GAGTTGGAATTACACTACTGGATTCAACAATTTATGAACTAAACCATGTACAGGTTGGTG
CGATATTTGGGTGTCTTGAAAAACAACAAAGTGAACCAACTAACATTTTAAAACCAGGGT
GGGTTGTATTTTGTATTTCGTAAATATCTAACTGCACTCAAATGCAATAATGTTTTACTG
ACATGAAAAAGGCATCTTTCTGCACATCGTCTGCTGTTTATACATCAATAGATGATCACC
TAGTGCCTAATTTTATGTTTCCGACTATAGAAAGCAGGGCACAGAACTCTCCTGCAATCC
ACTTCTTTAGCTCGGGATGTCAGAATTCAATTAAGTGGCTCCTTCAGTTAAGTCACTGAC
CACTGAAGAGCTTACAAAGTTAGCAACATAATCATGCCAAATTGGCATATGTTATGGTTG
CTCGGGTTTGAGCGGGAGAGAGAGAGCTGCGAGGGCGCGAGAGAGCCGGCCATGGGGGTC
CTTTCCCACGGCCGGGCAGGGAAAAGGGTTTTCCTTAATTCTTGCCTGATTAGTTTGATA
CATCTCCTCTCCATATATAGAGAGGTTTACTTGACTCCCAAGTAAGGCTTACTTGACCCC
TAAGCAAACCCTAAGACTAACGGGCCCAGGCCCATCACGTACTCTCACACTACACCCCAC
CTGGACATGCAGATCATCCTCGAGCTGCAACCTAACGACGATTCGACCCCACACAACCCT
AACGCACAAAAAACAAGCCTTTTACATCCCGTCCTATTGTACTCACCTA